叶剑英一面向党中央和已到南京的周恩来报告这一情况，一面向国民党北平市政府当局提出严重抗议。同时，向军调部国民党方面的代理委员蔡文治、美方委员饶伯森连续发出备忘录，严正指出：《解放》报及新华社北平分社，是中国共产党在华中、华北地区中唯一的言论机关，执行部中共代表团及各地小组中共代表遵照执行部三委员新闻协议，均将执行部之各项公报、命令委托该报及通讯社代为发布。现在政府方面已封闭中共方面报纸及通讯社，中共认为，今年1月三委员达成的新闻协议及联合新闻科1月19日协议的条件，均已被国民政府当局破坏，该项协议将自然失去效用，执行部中共代表团及各小组中共代表将不再受这些协议的约束。
5月30日，叶剑英带领在北平的中共方面驻石家庄、太原、高密、晏城小组的代表和军调部中共全体人员，至宣武门外方壶斋9号，慰问被国民党当局非法查封的《解放》报及新华分社工作人员。叶剑英在现场发表了简短的讲话。他说：“北平《解放》报每日销售四万余份，为北平市报纸销数之冠，这是一种最好的民心测验，是人民事业胜利前途的象征。《解放》报和新华分社，因为替老百姓讲话，宣传正义，无情揭露反动派罪行，才被他们视为眼中钉，而不惜破坏诺言，强行封闭的。国民党反动派虽然猖獗一时，但在人民的力量面前，终会自食其法西斯暴政的恶果。中国的和平民主事业一定会胜利！”
当日下午4时，叶剑英举行中外记者报告会，严厉揭露和斥责国民党当局的法西斯暴行。他对到会的50余名中外记者说：“北平市的反动当局，在5月29日封闭了77家报纸、杂志、通讯社，迫使77家言论机关不能继续与读者见面，这是扼杀民主与自由的反动行为。”他严正指出：“中国共产党在北平的机关报《解放》及其通讯社新华社，一贯地为反对内战、呼吁和平而努力，对好战分子的内战阴谋，经常给以无情的揭露。因此，反动的好战分子视之为眼中钉，不断地给以压制和破坏。今天，当他们坚持在东北继续扩大内战，企图造成全国规模的大内战的时候，公然查封我们的《解放》报和新华社，这是对全国和平事业的严重打击。”叶剑英呼吁中外记者：“要以高度的警惕性来重视这一严重的事件，要以十分明确的真实性来报道这一真相，动员起全国和全世界的舆论，来制止国民党这一反动措施，挽救陷入危机中的中国民主。”
三黑暗中的灯塔
军事调处执行部中共代表团，是中国共产党驻在国民党统治下的北平的一个公开合法机构。叶剑英根据党中央指示，利用各种机会，在北平广泛地开展统一战线工怍。在代表团内部，专门设立了一个负责统战、联络工作的小组。叶剑英对这个小组的工作十分重视。他反复交代说：“我们到北平来，不光要同国民党和美国人作斗争，还要广泛地进行联络、争取工作，要利用各种可能的办法，宣传解放区的优越性和政策，扩大我们的政治影响。”他还特别强调：“解放区非常缺乏知识分子，缺乏人才。党中央要求我们多做工作，尽量多争取一些知识分子和各方面人士到解放区去工作。”统战组的干部们想了很多办法，广交朋友，工作开展得卓有成效。
有一次，统战组的艾大炎等接待了住在中共代表团驻地附近的北京大学著名法学教授陈瑾昆。陈瑾昆对国民党政府的腐败十分不满，主动要求接近共产党。叶剑英亲切会见他，表示欢迎。彼此寒暄以后，叶剑英诚恳地告诉他，有什么心里话都可以说。
教授的话匣子打开了。
“我是搞法律的。说句不自谦的话，在当今的中国，我是这方面的专家，却发挥不了什么作用。国民党政府虽然也制定宪法，也搞一些法律，但是，许多东西都是骗人的。他们实行的，实际上是国民党一党的党法，姓蒋的一家的家法。这个政权腐败到如此程度，还有什么希望！”教授说着说着，浑身激动得颤抖起来，“我把国民党同共产党作了很长时间的比较。我发现，只有共产党才是真正为全国老百姓谋利益的。我佩服、赞同共产党的主张，希望能为共产党做些事情。”
叶剑英听了教授的话，由衷感佩。他对陈瑾昆说：
“我很佩眼教授的见识。我们中共代表这次到北平参加军事调处，有许多工作要做。我们希望同更多的北平知识界、科学界、教育界的人士交朋友。如果教授利用自己的身份和关系，能在这方面发挥作用，我们将非常欢迎。”
陈教授满口应允，表示愿意提供自己的住所，作为中共接触各方面人士的一个联络点。
此后，中共代表团联络组的人员，便经常利用陈教授的住所开展活动。不久，叶剑英以中共代表的身份，借陈教授住所举行了一次宴会，宴请在北平的其他民主人士和著名专家、知识分子，其中有张东荪、李锡九等人，气氛相当热烈。1946年12月，陈瑾昆教授抛弃住房和家产，到了延安，成了解放区的一位法学专家，新中国建立后曾任中央法制委员会副主任、全国政协委员。
中共代表团住在北平，就像这黑暗古都中闪闪发光的一座灯塔。广大人民群众，各界进步人士时时都在仰望着这座灯塔，不断有人主动找上门来，靠近共产党。许多人指名要见叶剑英委员。负责警卫工作的人员，从安全的角度考虑，常常想让别的干部代替叶剑英出面接待。叶剑英知道后，批评说：“人家采找我，并不是找我个人，而是找共产党。如果我不出面接待，岂不使人家感到失望吗？安全工作是要注意，但更要注意共产党的形象，共产党的影响。”
一天，翠明庄中共代表团接待室走进来一男一女。男的自称是国民党十一战区司令长官孙连仲部下的一名少将，女的是他的妻子。他们不满意国民党打内战，特来向叶剑英委员报告重要情况。
接待人员马上向叶剑英作了汇报。叶剑英想了想，说：“立即通过地下党的线索，查明此人的真实身份。”
第二天，些下党组织报告，来人确实是孙连仲部下的一位少将。于是，叶剑英要求尽快安排会见。然而，如何会面，却成了一个难题。中共代表团住地周围布满了国民党的特务，自然不便，只好在外边另找地方。而代表团的人员、车辆，只要一出大门，立即就有特务跟踪。叶剑英委员出门，目标更大，跟踪的特务更多。怎么办呢？叶剑英同统战组的艾大炎、警卫人员李树槐等一起商议。大家提了几种办法，都觉得不理想。最后，还是叶剑英想了一个“甩掉尾巴”的计策，大家听了齐声说“好”！
这天上午，叶剑英同艾大炎一起，带了两名警卫人员，乘车离开了翠明庄。驻地附近的特务一看，叶剑英的座车出门了，立即跳上早已伪装好的小车，远远跟在后面。叶的座车左转右转，兜了好几个圈子。特务们紧紧跟随，咬住不放。过了一会儿，叶剑英座车开到东安市场大门口，突然停住。一行人下车后，装作买东西，走进了市场。特务们也赶紧停车，留下二人盯住叶剑英的座车，其余二人一阵小跑，紧跟上来。只见市场里人头攒动，拥挤不堪。特务们四处搜寻，却不见叶剑英一行的踪影，只好垂头丧气地转回来，同留下的特务一起看住座车。他们心想，跑得了和尚跑不了庙，你的车在这里，看你能飞到哪里去！
他们哪里晓得，叶剑英一行进了东安市场以后，立刻迈开大步，分开众人，很快从另一个门走出去，乘上早已由地下党安排好的另一辆车子，飞快驶去。
在东城青年会旁边一间不起眼的屋子里，叶剑英同那位国民党少将夫妇见了面。少将向叶剑英报告了孙连仲部准备进攻解放区的作战计划。叶剑英对他们表示感谢，热情地鼓励他们夫妇追求光明，站到人民方面来。叶剑英还给他们分析了中国的政治形势，指出，如果蒋介石继续进攻解放区，坚持打内战，最后必将走向灭亡。中国共产党一定会赢得全国的胜利。少将完全同意叶剑英的看法，并表示以后要跟着共产党走，决不再为蒋介石政府卖命。叶剑英请他暂时继续留在国民，党军队中，利用合法身份，帮助共产党工作，并让他以后直接同艾大炎联系。后来，这位少将又几次向中共方面提供了有关国民党军队的重要情报。在解放战争后期，他毅然脱离了国民党军队，加入了革命队伍的行列。
叶剑英还经常向军调部翻译人员王光美询问了解大学校园里的情况，了解北平学生和教授们关心的问题，以及社会动向等，并经过王光美等多方联系，接见了许多教授，进一步开展统战工作。后来，王光美去延安前向他辞行，叶剑英亲切地嘱咐说：“青年人要有理想，要把学习的知识用来为人民服务。到解放区去，要有吃苦的思想准备。知识青年要正确看待工农出身的同志。”
四“我们一定会回来的”
1946年6月26日，国民党一手策划的全面内战爆发了。随着战争规模的扩大，军调部的工作变得日益困难起来。叶剑英根据党中央指示，在十分险恶的条件下，继续领导代表团坚持斗争。但叶剑英对斗争前途仍然充满信心。他以积极乐观的态度迎接即将到来的“翻天覆地”的斗争和伟大的胜利。这从他写给在莫斯科学习的大女儿叶楚梅的一首长诗中可以看出他的心境：
亲爱的梅儿：——爸爸有你而感觉骄傲。
鼓起你的劲儿，踏上你的长路。
这不是日暮途远呀！红日恰在东升。
阳光照着艰险的途程，比起黑夜里摸索，要便宜得万万千千。
急进吧！追上那先头出发的人们。
急进吧！再追上一程。
那里有广漠无边的地盘，等待着你们去开垦。
那里有大批优良的种子，等待着你们去拿回来散播，赶上春耕。
人民要翻身了，许多人已经翻了身。
敌人着慌了，不顾一切地起来作绝望的抗衡。
这是人类历史上最热闹的场面。
急进吧！再追上一程。
我们不是速胜论者。
欢迎你们能够赶上这一场翻天覆地的斗争。
我想你们没有一个是“坐享其成”的人。
你们是铁中铮铮。
爸爸
1946年12月6日北平
由于斗争形势急转直下，从1946年9月开始，叶剑英组织中共方面人员开始分批撤往解放区，留下少数人坚持工作。中共中央指示叶剑英本人早日撤离军调部，但他向中央说明情况，坚持同少数干部一起冒着危险战斗到最后。1947年2月21日，也就是蒋介石发动的全面内战打了7个多月之后，叶剑英才带领最后一批中共代表团人员，乘军调部提供的三架飞机离开北平，回到延安。离开北平前夕，叶剑英在北京饭店同各界友好人士话别。他坚定地对大家说，我们离开北平只是暂时的。我相信，过不了几年，我们一定会回来的！
叶剑英在军事调处执行部，率领中共代表团战斗了约400天，同国民党政府和美国代表进行了艰巨复杂的谈判斗争。深刻地揭露了国民党反动派破坏和平，挑起内战的阴谋，从全局上有力地配合了中国共产党及其领导下的军队同国民党反动派的斗争。