科学必然战胜迷信，诽谤、攻击只是一小撮居心不良的小丑玩弄的伎俩。天花继续泛滥，种过牛痘的人却安然无恙，种牛痘能预防天花已成为抹煞不了的事实。当那些求神、祷告的人们得不到上帝的保佑时，便自动向这位伟大的发现者求救。而那些造谣诽谤者面临天花威胁的时候，也只好偃旗息鼓，诚惶诚恐地接受牛痘的接种。
因患天花而得救的人，仅就英国来说，每年达四万五千余人。
在大量的事实面前，英国政府终于承认了詹纳的研究成果。1802年，英国国会以一万英镑奖励詹纳的伟大发现，1806年又奖给了两万英镑。俄国皇帝赠送给他一个宝石戒指作为纪念。詹纳把一部分奖金为第一个接受他种牛痘的孩子盖了一幢房子，并亲手在房前种了蔷薇花。但他还是拒绝到英国政府去当官，仍在故乡当乡村医生。
詹纳的著作先后被译成法、德、西班牙、俄、中等国家的文字，种牛痘免疫在世界各地广泛应用。
1823年，詹纳在七十四岁时与世长辞了。为了纪念这位平凡而又伟大的乡村医生，1857年的5月14日，也就是詹纳1796年第一次给小菲普士接种的日子，在伦敦举行了詹纳纪念像的揭幕式，雕塑家精心制作了一座詹纳为菲普士接种的雕像。他的碑铭上写着：向母亲、孩子、人民的英雄致敬！从此，人们为纪念詹纳的伟大贡献，把每年的5月14日定为“种痘节”。
人们与天花这一严重危害人类健康和生命的传染病作了长期不懈的斗争，终于迎来了天花在世界上绝迹的一天——1980年世界卫生组织宣布天花已在全世界被消灭，这是人类消灭的唯一传染病。