香港与澳门是我国的领土，是我国对外交流的重要场所，但是在货物运输的具体操作流程上与国内的一般流程还是存在着差别。他们与内地的商品、货物以及相关物品的往来依然被视为我国的对外贸易，需要经过海关的检验与放行。
一．对港澳地区货物运输的方式与特点
（一）运输方式
1．对香港的货物运输方式
（1）铁路直接过轨运输：货物在内地各发站装车后，经深圳直接过轨运至香港九龙车站。
（2）铁路－水路运输：货物从内地通过铁路运至广州南站，再用驳船转运至香港。
（3）铁路－公路运输：货物从内地通过火车运至深圳北站，然后用汽车经文锦渡、皇岗、沙头角等口岸运至香港。
（4）海洋运输：货物通过中国内地的港口装船运往香港。
（5）航空运输：货物在内地机场装上飞机后运至香港。
（6）公路运输：广东地方货物装车后直接经文锦渡、皇岗、沙头角等口岸运至香港。
但是随着近年来内地与香港海洋、公路、航空运输的迅速发展，铁路运输在输往香港的货物总量中所占的比重已经有所下降。
2．对澳门的货物运输方式
由于澳门与内地之间没有铁路直通，所以内地运往澳门的货物必须先由铁路运送至广州等站，然后转水路或公路运至澳门。
（1）铁路－水路运输：内地运往澳门的货物，先由铁路运至广州南站，再转水路运至澳门。
（2）公路运输：广东地方货物装车后经拱北运至澳门。
（3）水路运输：广东地方货物委托广东外运分公司办理，经由广州水运中转至澳门。
（二）特点
1．商品结构的特殊性
在对香港的铁路货物运输中，鲜活、冷冻商品占深圳过轨运量的50％以上。
由于鲜活、冷冻商品在运输过程中有特殊的要求，管理难度较大。
2．贸易方式的特殊性
对港澳地区的贸易商品特别是鲜活商品，反映在运输上必然是计划多变，要争取做到数量、时间的恰到好处，优质、适度、均衡、及时的供应香港市场。
3．运送方式的特殊性
对香港地区的铁路运输是按国内运输办理的，但又不是一般的国内运输，它的全过程分为两段，即国内段铁路运输和港段铁路运输。货车到达深圳北站后，要过轨至香港，继续运至九龙车站。我国铁路和香港铁路不办理直通联运，因此，就形成了现行的这种运输方式：发站以国内运输向铁路办理托运至深圳北站，收货人为深圳外运分公司。深圳外运分公司作为各外贸单位的代理与铁路办理租车手续，并付给租车费；然后租车去香港，货车过轨后，香港中旅货运有限公司则作为深圳外运分公司的代理在香港段重新起票托运至九龙。货车至九龙各目的站后，由香港中旅货运有限公司将货物卸车后交给香港的实际收货人。
对香港的铁路货物运输不是国际联运，国内运单也不是全程运送票据，因此不能作为对外结汇的凭证。目前由各地中外运分公司以运输承运人的身份向外贸单位提供经深圳中转香港货物的“承运货物收据”，作为向银行结汇的凭证。
4．费用计算的特殊性
由此可见，对香港地区的铁路运输的特点是“租车方式，两票运输，三段收费”。因此费用项目复杂，具体包括：
（1）发站至广州北站的费用：包括发站至广州北站的运费、铁路建设基金、电气化附加费及其它杂费，由发站计收。
（2）广州北站至深圳北站的费用：包括广州北站至深圳北站的运费，以及在原有基础上加成50％的铁路建设基金，由深圳北站计收。
（3）深圳口岸的费用：包括深圳口岸的中转费、调车费、租车费、装卸费、杂费、口岸代理劳务费，由发货人的代理人先行垫付或发货人直接支付。
（4）香港段的费用：包括香港段的运费、终点费、装卸费、延期费等和香港段代理劳务费，由发货人的代理人先行垫付或发货人直接支付。
二．对香港地区铁路运输的重要单证
（一）联运出口货物委托书
联运出口货物委托书是供港铁路运输最基本、最必备的单证之一。它是发货人向深圳外运分公司和香港中旅货运有限公司委托办理货物转运、报关、接货等工作的依据，也是它们最主要的工作依据以及向发货人核算运输费用的凭证。委托书一式三份，深圳外运分公司一份，由深圳外运分公司转交香港中旅货运有限公司一份，运送结束后退给发货人一份。委托书在货物发运后，以特快专递的形式寄给深圳外运分公司。
（二）出口货物报关单
出口货物报关单是出口货物必须具备的基本单据，也是发货人向海关申报的依据。报关单一式两份，来料加工、进料加工和补偿贸易货物为三份，并附有来料加工合同副本及登记手册。其格式、内容、填写与通常使用的出口货物报关单相同。报关单的寄送与委托书的寄送相同。
（三）出口许可证
根据国家有关部门的规定，对香港的商品出口依然实行出口许可证制度。根据商品的不同，分别由商务部，商务部驻各地的特派员办事处，各省、自治区、直辖市和计划单列市的外贸部门签发。向香港出口货物的外贸公司必须根据规定申请出口许可证，出口许可证向海关出具，是海关验放货物时必需的重要单证。
（四）商品检验证书
根据我国进出口商品检验法的规定，凡是需要进行法定检验或贸易合同中要求进行检验的进出口货物都必须申请规定的检验机构进行检验并出具商品检验证书。对港出口申报时，要求一车一证。如一证的数量太大，则需要在深圳商品检验局分证，每分证一次收取一次的手续费。商品检验证书一般为一份，或在出口报关单上加盖商检放行章（冻肉若无兽医检疫合格证，则香港五丰行不收货，有放行章也不能过轨）。
（五）起运电讯通知
起运电讯通知包括电报、电话及其它规定的通讯方式。为使深圳口岸和香港有关机构提前做好接货准备，各发货单位在货物发运后应当在规定的时间内向深圳口岸和香港有关机构发出货物起运电报。深圳口岸和驻港机构接到起运电报后可以及时做好接运准备，必要时还可作为补制单证的依据。发货人必须在货物装车24小时内向深圳外运分公司拍发起运电报，如在广州附近装车，应电话通知深圳外运分公司。发运电报是对港货物运输的必备单证之一，没有电报就无法抽取单证报关，货车到站后也无法过轨。货物发运后，如对原委托书、报关单及起运电报的内容有所更改时，发货单位应该立即以急电或电话及时通知深圳外运分公司。
（六）承运货物收据
由于国内铁路部门与香港九龙铁路当局没有货运直接通车运输协议，各地铁路发往香港的货物，不能一票直达至香港，银行也不同意用国内铁路运单作为对外结汇的凭证。因此，为了解决各外贸专业公司结汇的需要，各地外运分公司以运输承运人的身份向各外贸专业公司提供经深圳口岸中转香港货物的“承运货物依据”，作为向银行结汇的重要凭证。签发承运货物收据主要依据委托书和国内铁路运单的领货凭证。
承运货物收据的格式及内容和海运提单基本相同，主要区别是它只有第一联为正本。正本的反面印有“承运简章”，注明承运人的责任范围，其中第二条印有：“由本公司承运之货物，在铁路、轮船、公路、航空及其他运输机构范围以内，应依据各该机构规章办理。”
（七）国内铁路货物运单
国内铁路货物运单是发货人与国内铁路部门办理从发站至深圳北站之间国内段运输的合同。因向香港发送货物而填写铁路运单时应该注意以下问题：
1．经深圳北站运往香港的货物到站为深圳北站，不能填写九龙车站。
2．收货人填写“中国对外贸易运输总公司深圳分公司”，不能填香港实际收货人、代理人或“深圳外运分公司转××收”。如在深圳存仓库（暂时不出口，经深圳外运同意暂存深圳外运仓库的货物），则填“深圳外运分公司仓库”；经中转站装箱出口陆海联运货物时也填“深圳外运分公司仓库”。属于深圳市有关单位收货的非出口物资，不得填写深圳外运分公司或深圳外运分公司笋岗办事处。
3．货物重量按照货车实际毛重填写，不要填写车皮标记载重。发货人不填写实际毛重时，铁路按照车皮标重计费。
三．对香港地区铁路货物运输的一般过程
（一）出口货物运输的一般过程