尾巴作为动物身体结构的一部分，其功能必然是不可少的。就大多数动物的尾巴而言，其形态均为末端不断变细，它可以很好地感知来自外界的影响和干扰，防止外界它物的伤害。其实，恐龙的尾巴也有着这样的功能。
恐龙
恐龙武器锤状尾
锤状尾是用来当作武器来保护自身免受侵害的。对大型个体来说，挥动其锤状尾巴并不是太笨重，是可以实现其保护功能的，就比如甲龙，它的尾巴一直认为是保护自身的武器。不过库姆斯博士对此提出了质疑，甲龙的尾巴过于短小僵硬，并不能灵活地左右摆动，所以起不到保护的作用，反而是自我炫耀的标志，或许只是在与其他甲龙进行仪式化的格斗。不过有的专家发现在靠近甲龙尾巴基部的椎体上侧生长着长肋，这说明此处附着有大量的肌肉，这样就可以用力地甩动尾巴，而尾巴末端的相对不活动也正好起到一种大尾锤“骨柄”的作用，从而增强其打击力度，甚至可以打败霸王龙。
恐龙武器刺状尾
刺状尾的功能也是起到防护的作用，比如剑龙。剑龙的棘刺数量和位置曾经也有争论，一般多见为两对棘刺，且尖端很细。开始的时候，认为棘刺的位置是向上的，可是这样它的防御功能就会因此而减弱，另外，棘刺也缺少和尾椎相连的关节，所以后来才将棘刺排列的方向向两侧和后方倾斜。斯莫尔博士发现了一个非常有力的证据，剑龙的尾棘有着明显的部分破损，经分析认为，这是经过多次防御而受的伤，且在后期受到了感染所致。
恐龙武器鞭状尾
鞭状尾的功能不同于锤状尾和刺状尾，它不仅可以维持身体平衡，还可以用作信号联络或者是当作武器。亚历山大教授认为，鞭状尾的装置是用来发声的。慢速挥动鞭状尾会发出“嗖嗖”的声音；快速挥动鞭状尾则会发出“劈啪”的声音，这些声音很有可能是它们的一种信号传递。迈尔沃尔德和柯里的观点和亚历山大教授十分类似，他们认为像梁龙一样有着强壮肌肉的尾巴，如果能够快速挥动，则足以打破声障，其目的是用来威胁捕食动物并或是与其它恐龙联系。不过这些观点还存在着争议，而且也只是推测。