五十四岁的孔子由司空升任大司寇之后，他走进大司寇府，心情愉快，面露喜色。
子路问：“常言道：君子遇灾祸不忧，逢好事不喜。老师为何升官即乐呢？”
“你说的没错。但你只知其一，不知其二。可能你还没听说这样的话：君子居高位而敬重低于自己的人是乐事，君子以权惩恶亦是乐事！”
子路又问：“如此说来，您最近可能以大司寇的名义惩治恶人？”“你说的没错！”
夹谷会盟之后，孔子名声大振。执政大夫季孙斯请孔子推荐弟子就任家臣，孔子推荐了两名，季孙斯欣然接受。孔子向季孙斯提议：“三位大夫所属城邑的城墙高度超过了周朝的规定，应该拆城墙、撤武备，使上下永安。”季孙斯同意，并转告孟孙、叔孙二氏。
少正卯嫉妒孔子就想方设法破坏孔子的计划。他策动现任费邑宰叔孙辄勾结前任费邑宰公孙不狃，拒绝平毁费邑，并发动叛乱。在郈邑遭毁前夕，少正卯暗自派人在城外向郈邑城内射箭，箭头上系的白绢上写着“坚守拒堕”四个字。在是否平毁成邑城的问题上，少正卯则使用两面手法，从中捣乱。
平毁费邑、郈邑之后，孔子掌握了少正卯幕后活动的不少证据，向定公密奏少正卯破坏平毁三都的情况后，说：“鲁国不振，原因是忠臣和奸佞不分，奖惩制度没有建立起来。
为保护庄稼更好地生长，必须除掉野草。愿主公切勿姑息奸佞，传旨取出太庙中用于斩刑的兵器，放在两观台下。”
鲁定公说：“好，就这么办！”
第二天，鲁定公让群臣商议平毁成邑的利害关系，并责成大司寇孔子裁决。
少正卯故意迎合孔子开始时提出的平毁三城之意，说：
“鉴于费邑、郈邑已平毁，成邑城亦当平毁，这样可以使跋扈的家臣无所凭借，亦可平衡三家心理，避堕二留一之嫌。”启奏道：“少正卯所言别有用心！成邑已处于孤立的形势，怎能再平毁呢？何况成邑宰公敛处父忠于公室，怎能说他是跋扈家臣。前些日子，我下令平毁成邑时，少正卯暗自让公敛处父拒绝平毁，向我陈述的理由是：成邑城是鲁国的北大门，有抵御齐军入侵的作用。我念公敛处父以礼对待堕城鲁军，且无叛乱言行，奏请主公批准，没有平毁此城。少正卯明知详情，今日信口雌黄，离间君臣，居心险恶，按律当斩！”
“少正卯是鲁国名人，言有不当，亦不应诛！”
几个大夫为少正卯求情。复奏：“鉴于众卿不知少正卯底细，臣有必要道破其天机：暗自策动费邑宰叔孙辄和公孙不狃起兵叛乱的是他；暗自指示郈邑宰侯犯坚守拒堕的是他；在成邑堕与不堕问题上玩弄两面三刀手段的是他。少正卯言论偏颇却辩才无碍；行为怪僻而意志坚定，内心险恶却深藏不露，以广博的学识掩盖其邪恶，对作恶的人广施恩泽。对少正卯这样以虚名惑众之人，不诛之难以为政。我的职务是大司寇，应维护法律尊严，请主公正斧钺之典，以儆效尤！”
鲁定公大声说：“准奏！将乱政大夫少正卯就地处斩！”命力士捆绑少正卯，在两观台下将少正卯斩首，并暴尸三天。
自诛少正卯之后，孔子的作用得以正常发挥，定公与三家皆虚心听取孔子的意见。从此，孔子立纲陈纪，施教礼义，整顿官风民俗，三个月之后，鲁国的风气大为好转。
不过，也有不同的议论。
有人说：“少正卯曾与孔子同时在鲁都讲学，多次把孔子的学生吸引到自己门下，致使孔门三盈三虚。孔子诛少正大夫是公报私仇！”
子贡将听到的议论告诉孔子，并问：“少正卯是鲁国名人，你刚执政不久就杀了他，这样做妥当吗？”说：“黎民百姓不了解真相，说三道四，在所难免。
我已命差役在城乡张挂诛少正卯的文告，公布其罪恶，让大家有所认识。这关系国家稳定的大局，绝非其他原因。应懂得这样一个道理：小人成群结党，是值得忧心防范的。国君诏示天下的动乱罪有五条，俱一罪即可杀。而少正卯五罪俱全，经常以邪恶之言蛊惑民心，聚各方势力为己所用，实在无法饶恕。今日不诛少正卯，将来鲁国必生祸患。商汤杀尹谐，文王杀潘正，周公杀管叔和蔡叔，姜尚(太公)杀华士，管仲杀付乙，子产杀史何，与我诛少正卯是一个道理。”
子贡说：“原来老师奏明主公，捕杀乱政大夫少正卯，是为了鲁国的江山社稷啊！”