番茄病毒病是由多种病毒侵染引起的，主要危害番茄，还可侵害辣椒、茄子等茄科作物。病毒病在国内分布非常广泛，很多地方导致失败后不能栽培。根据症状不同，分为花叶型、条斑型和蕨叶型。番茄病毒病可采用下列方法防治：
（1）抗病品种。尽量选用抗病和耐病的品种。
（2）种子处理。为消灭种子上携带的病毒，可行种子处理。方法见春早熟栽培。
（3）土地选择。栽培地应避免连作，选通风的开阔地，秋季深翻，施足有机肥，增施磷、钾肥，促进植株健壮生长，提高抗病力。
（4）育苗。育苗的叶龄应适当，过大缓苗慢，易发病。苗期温度应适宜，温度过低，易成老化、僵化苗，这样的苗生理活动弱，易感病。徒长苗也易感病。移植时，少伤根，可促进缓苗，减少发病。
（5）田间管理。适期早定植，早生长发育，在病害流行期前长成较大的植株，可减轻病害危害。定植时，选用无病壮苗、淘汰病、弱苗。定植后勤中耕，提高地温，促进根系发育，增强抗病力。尽量利用地膜覆盖，改善土壤环境条件。在整枝打杈，采收，插架等田间操作时，应经常用肥皂水洗手消毒，尽量减少人为地汁液传播。烟草有病毒，吸烟者禁入。及时清洁田园，拔除病株。病株应深埋或烧毁，减少病源。定植缓苗后，勿过度蹲苗。高温干旱季节应适当小水勤浇，保持田间湿润，降低地温。分期追肥，增施磷、钾肥，可提高植株抗病力。防治蚜虫及时防治蚜虫，可减少传毒媒介，避免病害的发生。除了药剂防治外，还可用纱网遮挡。
（6）药剂防治。利用弱毒疫苗（N14和卫星病毒S52）、钝化物质（豆浆、牛奶、鱼血等）、保护物质（高脂膜的200～500倍液）、增抗物质（83增抗剂）等防治病毒。