同年5月，两位美国潜水员完成了对这8处遗址的水下考察。他们两人都具有丰富的潜水经验，阿布斯诺特曾经在大凯曼群岛对一艘沉没的三桅帆船进行过考察，而赛义德已经有40年的潜水经验了。
冲绳海域颇为凶险。遗址距岸边很近，因此上下涌动的浪流非常强烈，同时伴随着潜水员的还有快速的潜流和不时造访的鲨鱼。但是令人感到愉快的是这里是世界上清澈度排第3的水域，海水能见度可以达到60多米，还有着异常美丽的珊瑚。起初两位潜水员并没有发现多少可以说明水下遗址是人工制造的迹象，但是在仔细考察了名护附近的遗址并且与木村教授见面之后，这种猜测才逐渐在他们脑中形成。
阿布斯诺特认为名护附近的构造像是城堡的围墙，这种猜测可以从附近岛上具有相似建筑风格的城堡找到有力的支持，而庆良间的水下构造则很可能是举行仪式用的平台。在庆良间的水下平台上，两位潜水员发现了非常精确的直线构造，它们清楚地表明，这里不是经过工具的加工，就是由人类对自然的地质构造进行了改动。尤其重要的是，在平台上发现的孔洞，不像是天然形成的，很有可能是用以插入柱子来支撑木制结构的。用人类的标准来衡量，这些石头平台确实非常巨大，但是我们可以想像在上面架设木质的台子就可以轻易将其利用起来，只要在岩石上钻一个孔，插入支撑梁架就可以了。
“我们所观察到的东西非常有趣，让我们觉得有必要进行进一步的研究。”阿布斯诺特说道，“对这些遗址还有一些认识是错误的，我们要做的是澄清事实，而只有通过更完整更严谨的科学调查才能做到这一点。”