丁亥。四十九岁。
三月。述唯识心要。相宗八要直解。九月。述弥陀要解。四书蕅益解。
去岁。颛愚大师坐脱于紫竹林。门人以陶器奉全身供于林之山阳。今年弟子请归云居。于是金陵缁素以所存爪发衣钵。就山阳建塔供养。大师为撰志铭。
是冬。自辑净居堂续集。
居祖堂幽栖寺。除夕普说。
戊子、五十岁。
成时师始晤大师。大师一日顾成时师曰：“吾昔年念念思复比丘戒法。迩年念念求西方耳。”成时师大骇。谓何不力复佛世芳规耶。久之。始知师在家发大菩提愿以为之本。出家一意宗乘。径山大悟后。彻见近世禅者之病。在绝无正知见。非在多知见。在不尊重波罗提木叉。非在著戒相也。故抹倒禅之一字。力以戒教匡救。尤志求五比丘如法共住。令正法重兴。后决不可得。遂一意西驰。冀乘本愿轮。仗诸佛力。再来与拔。至于随时著述。竭力讲演。皆聊与有缘下圆顿种。非法界众生一时成佛。直下相应。太平无事之初志矣。
是冬。自辑西有寱余。
己丑。五十一岁。
九月。从金陵归卧灵峰。
撰北天目十二景颂。
腊月。力疾草法华会义。翌年正月告成。
庚寅。五十二岁。
结夏北天目。究心毗尼。念末世欲得净戒。舍占察轮相之法。更无别涂。
六月。述占察疏。
自癸酉迄今十余年。毗尼之学无人过问者。而能力行之彻因、自观、僧聚三比丘。又皆物故。毗尼之学。真不啻滞货矣。是夏安居灵峰。乃有心学律者十余人。请大师重讲。大师念向所辑。虽诸长并采。犹未一一折衷。又问辩、音义二书。至今未梓。因会入集要而重治之。兼削一二繁芜。以归简切。名曰重治毗尼事义集要。
六月二十一日。撰重治毗尼事义集要序。
安居竟。重拈自恣芳规。悲欣交集。慨然有作。赋偈云：“秉志慵随俗。期心企昔贤。拟将凡地觉。直补涅槃天。半世孤灯叹。多生缓戒愆。幸逢针芥合。感泣泪如泉。正法衰如许。谁将一线传。不明念处慧。徒诵木叉篇。十子哀先逝。诸英喜复联。四弘久有誓。莫替马鸣肩。”
八月初八日。撰重治毗尼事义集要跋。
与见月律主书。谈论律学。冀获良晤。
冬。住祖堂。
辛卯。五十三岁。
夏。结制长干。
九月。重登西湖寺。
是冬。归卧灵峰。重订选佛图。
壬辰。五十四岁。
结夏晟溪。
草楞伽义疏。八月。迁长水南郊冷香堂。乃阁笔。
秋。辑续西有寱余。
是岁腊月。草自传。先是是秋大师决志肥遁。缁素遮道不得。请述行脚。冬。憩长水营泉寺。念行脚未尽致。复述兹传。曰八不道人传。取中论八不。梵网八不之旨。又大师自云：“古者有儒有禅有教有律。道人既蹴然不敢。今亦有儒有禅有教有律。道人又艴然不屑。故名八不也。”
（录者注）大师一号“西有”。出家前曾用“金阊逸史”号。
住长水。阅藏经千卷。
癸巳。五十五岁。
是春。大师过古吴。删改自述八不道人传。故从古吴传至留都。与长水本数处不同。后成时师谓传收著述未尽。请补。于是与古吴本又增数句矣。
夏四月。入新安。结后安居于歙浦天马院。五月著选佛谱。阅宗镜录。删正法涌、永乐、法真诸人所纂杂说。引经论之误。及历来写刻之譌。于三百六十余问答。一一定大义。标其起尽。阅完。七月作校定宗镜录跋四则。又汰袁宏道集。存一册。名袁子。
秋八月。游黄山白岳诸处。
冬。复结制天马。著起信论裂网疏。
（录者注）是岁大师在歙浦栖云院演说弥陀要解。释义分科。间有与前不同。由性旦师录出。甲午冬。大师病中。复口授数处令改正。名歙浦本。即今十要中之流通本也。
甲午。五十六岁。
正月应丰南仁义院请。法施毕。出新安。二月后褒洒日。还灵峰。自辑幻住杂编。夏卧病。选西斋净土诗。制赞补入净土九要。名净土十要。夏竟。病愈。七月。述儒释宗传窃议。八月。续阅大藏竟。九月。成阅藏知津、法海观澜二书。
九月一日。撰阅藏毕愿文。计前后阅律三遍。大乘经两遍。小乘经及大小论两土撰述各一遍。
（录者注）大师阅藏毕然香愿文有云：“窃见南北两藏。并皆模糊失次。或半满不辨。或经论互名。或真讹不分。或巧拙无别。虽有宋朝法宝标目。明朝汇目义门。并未尽美尽善。今辄不揣。谬述阅藏知津、法海观澜二书。傥不背佛旨。乞得成就流通。”
又大师佛顶玄文后自序云：“深痛末世禅病。方一意研穷教眼。用补其偏。虽徧阅大藏。而会归处不出梵网、佛顶二经。”
冬十月。病。复有独坐书怀四律。中有“庶几二三子。慰我一生思”之句。十一月十八日。有病中口号偈。腊月初三。有病间偶成一律。中有“名字位中真佛眼。未知毕竟付何人”之句。是日口授遗嘱。立四誓。命以照南、等慈二子传五戒菩萨戒。命以照南、灵晟、性旦三子代座代应请。命阇维后。磨骨和粉面。分作二分。一分施鸟兽。一分施鳞介。普结法喜。同生西方。十三起净社。撰大病中启建净社愿文。嗣有求净土偈六首。除夕有艮六居铭。有偈。
是岁多病。寄钱牧斋书云：“今夏两番大病垂死。季秋阅藏方竟。仲冬一病更甚。七昼夜不能坐卧。不能饮食。不可疗治。无术分解。唯痛哭称佛菩萨名字。求生净土而已。具缚凡夫损己利人。人未必利。己之受害如此。平日实唯在心性上用力。尚不得力。况仅从文字上用力者哉。出生死。成菩提。殊非易事。非丈室谁知此实语也。”
乙未。五十七岁。
元旦有偈云：“爆竹声传幽谷春。苍松翠竹总维新。泉从龙树味如蜜。石镇雄峰苔似鳞。课续三时接莲漏。论开百部拟天亲。况兼已结东林社。同志无非法藏臣。”“法藏当年愿力宏。于今旷劫有同行。岁朝选佛归圆觉。月夜传灯显性明。万竹并沾新令早。千梅已露旧芳英。诸仁应信吾无隐。快与高贤继宿盟。”
正月二十日。病复发。二十二日晨起病止。午刻。趺坐绳床角。向西举手而逝。世寿五十有七岁。法腊三十四。僧夏。从癸亥腊月至癸酉自恣日。又从乙酉春至乙未正月。共计夏十有九。
大师生平不曾乞缁素一字。不唯佛法难言。知己难得。亦鉴尚虚名之陋习。而身为砥也。西逝时。诫勿乞言。徒增诳误。
大师著述。除灵峰宗论十卷外。其释论则有：阿弥陀经要解一卷。占察玄疏三卷。楞伽义疏十卷。盂兰新疏一卷。大佛顶玄文十二卷。准提持法一卷。金刚破空论附观心释二卷。心经略解一卷。法华会义十六卷。妙玄节要二卷。法华纶贯一卷。斋经科注一卷。遗教经解一卷。梵网合注八卷。后附授戒法、学戒法。梵网忏法问辩共一卷。优婆塞戒经受戒品笺要一卷。羯磨文释一卷。戒本经笺要一卷。毗尼集要十七卷。大小持戒犍度略释一卷。戒消灾经略释一卷。五戒相经略解一卷。沙弥戒要一卷。唯识心要十卷。相宗八要直解八卷。起信论裂网疏六卷。大乘止观释要四卷。大悲行法辩讹一卷。附观想偈略释。法性观。忏坛轨式三种。四十二章经解一卷。八大人觉经一卷。占察行法一卷。礼地藏仪一卷。教观纲宗并释义二卷。阅藏知津四十四卷。法海观澜五卷。旃珊录一卷。选佛谱六卷。重订诸经日诵二卷。周易禅解十卷。辟邪集二卷。共四十七种。又定嗣注经目。有行愿品续疏。圆觉经新疏。无量寿如来会疏。观经疏钞录要。十轮经解。贤护经解。药师七佛经疏。地藏本愿经疏。维摩补疏。金光明最胜王经续疏。同性经解。无字法门经疏。十二头陀经疏。仁王续疏。大涅槃合论。四阿含节要。十善业道经解。发菩提心论解。摩诃止观辅行录要。僧史删补。缁门宝训。共二十一种。俱未及成书。
（录者注）上列著述。系依成时师之蕅益大师宗论序说及续传钞录。此外尚有净土十要。四书蕅益解。见闻录等辑著行世。
大师示寂。诸弟子请成时师辑灵峰宗论。辑成。成时师然香一千炷。愿舍身洪流。一、报师恩。助转愿轮。二、供妙法。生生值遇。三、转劫浊。救苦众生。四、代粉骴。满师弘誓。五、忏重罪。决生珍池。
腊月十二日。成时师撰大师续传。后一日撰灵峰始日大师私谥窃议。后二日撰灵峰宗论序。越一日撰灵峰宗论序说。
丙申。
丁酉。
是冬如法荼毗。发长覆耳。面貌如生。趺坐巍然。牙齿俱不坏。因不敢从粉骴遗嘱。奉骨塔于灵峰大殿右。
戊戌。
己亥。
是冬。灵峰宗论刻板成。
庚子。
辛丑。
康熙元年。壬寅。
大师入灭八年。壬寅七月。门人性旦病逝。先书嘱语。面乞成时师并胞兄胡净广粉遗骨。代大师满甲午腊月初三日所命。先是成时师邀净侣礼佛说佛名经。旦就坛然顶灯。以报法乳深恩。至是复有此嘱。谨就八月集众修药王本事七昼夜而作法焉。
雍正元年。癸卯。（即日本享保八年。）
是年孟春。日本京都灵峰宗论重刊版。老苾刍光谦序云。“（前略）昔尝读灵峰蕅益大师所著诸书。见其学之兼通博涉。其行之苦急严峻。因窃自叹虽荆溪、四明大祖师几不及也。（中略）古人有言曰。读孔明出师表而不堕泪者。其人必不忠。读令伯陈情表而不堕泪者。其人必不孝。读退之祭十二郎文而不堕泪者。其人必不友。余亦尝言读蕅益宗论而不堕血泪者。其人必无菩提心。”（后略）