何心隐的思想是主张人人平等，不分贵贱，当时被视为“异端”。一次，在朋友耿定向家里，正好张居正前来拜访，何心隐却不愿意见他。耿定向问原因，何心隐回答说：“这个人将来必定掌握天下大权。”他又说：“严嵩想灭绝道学却没有成功，徐阶想大兴道学也不能如愿。将来能做到这些的，只有张居正。我知道这一点，所以他必定会杀我。”后来，张居正当了首辅掌握大权，判何心隐以聚徒乱政的罪名，将他杀了。
