新学期最好的事便是海格恢复了荣誉，他不再被当成饲养杀人凶手的罪人了，而且还在霍格沃兹教了课。同样是新老师的还有黑魔法防御术的老师卢平，这位老师一开始并没有表现的太过抢眼，甚至看上去有些邋遢，可他们不会知道，这位卢平教授，会跟他们的命运息息相关。
这一切还要从一起越狱事件开始讲起。从没有人能从阿兹卡班越狱而出，可是这位臭名昭著的小天狼星布莱克却做到了。而且有迹象表明，他是冲着哈利波特而来，好像是跟十几年前的凤凰社有关。小天狼星布莱克迅速成了各大报纸的头条新闻，在巫师界引起了恐慌。为了抓住他，魔法部甚至让摄魂怪搜查了霍格沃兹列车，那种哈利最恐惧的怪物，仿佛在一瞬间就能摄取人的意志，令人彻底绝望……
是卢平救了他们。他让这几个初次见面的孩子们对他充满了信任。
不管怎么说，他们还是要好好上课的，赫敏更是对知识十分渴望。他在学期初就向邓布利多表达了想要多上几门课的愿望，可是一天只有那么多时间，她要怎样才能出现在所有课堂之中呢。邓布利多显然可以帮她解决这件事。他给了赫敏一个小小的工具，让她能把时间掌握在自己的手中。不过，这当然是个秘密。
在海格的第一堂课上，他们认识了一只叫做鸟嘴的鹰马，这其实是只可爱的动物，至少在海格眼里是这样，可是由于马尔福口出狂言，他被鸟嘴抓伤了。不知这只鹰马，会不会因此而遭到厄运呢。
而卢平的第一堂课也同样精彩。他让大家面对自己内心最害怕的东西，打败格伯特。可是没想到，在哈利面前，格伯特变成了摄魂怪，卢平见势不妙急忙挡在哈利的前面，而这时，格伯特变成了月亮……卢平害怕月亮吗？他们总会找到答案。
三年级的学生可以有资格霍格莫德了。这对于他们来说是多么兴奋的一件事，可是对于哈利就完全不同了，他没有取得监护人的签名。没有办法，孤身一人的哈利，只能找他信任的卢平教授聊聊填天了。
“教授，在那时，我似乎听到了一个女人的声音。我想，那我妈妈的声音是吗？”
“哈利，摄魂怪把人们的恐惧当做养分，你越怕它，它越是强大。”卢平走到他身旁，“其实我第一次看到你，就知道你是谁。不是因为你的伤疤，而是你的眼睛跟你母亲莉莉非常相像。没错，我认识她，当所有人不想理我的时候，她会去帮助我，她不但是个很有天分的巫师，还是个心地非常善良的女人。相反地，你父亲詹姆，可就是个制造麻烦的专家了。我听说这天分也遗传到了你身上。”
哈利腼腆的笑了笑。
“你很像他们，慢慢的，你就会察觉到了。”
霍格沃兹的安全警戒要升级了，因为神通广大的小天狼星布莱克居然混入了城堡。奇怪的事不止这一件，卢平教授也从黑魔法防御课上消失了，西弗勒斯代替他上了这节课，讲述了世上一个危险而悲哀的物种——狼人。
依旧无法去往霍格莫德的哈利十分不甘，他甚至想要披着隐身衣前去，可是还没出门就被罗恩的哥哥乔治和弗雷德发现了，不过他们给了哈利一样好东西——活点地图。哈利简直太喜欢这份礼物了，他不仅可以看到霍格沃兹每个人的位置，还能知道通往霍格莫德以及其他各处的密道。哈利迅速前往霍格莫德寻找他的同伴，还顺道调戏了一下马尔福等人。他在霍格莫德的收获可不只是这些，在跟踪了魔法部长和麦格教授之后，他听到了一个无法接受的消息：小天狼星，是他的教父，更是背叛了詹姆和莉莉导致他们被杀的血海仇人！
被仇恨笼罩的哈利开始跟着卢平学习守护神咒语，这是普通巫师等级考核都不会考到的高深咒语，可是他却学会了。与此同时，鸟嘴却遭遇了不幸，由于抓伤了德拉科马尔福，魔法部的人要判它死刑。
一天晚上，哈利在看活点地图的时候，突然发现了一个人，他记得，这是麦格教授提起过的一个人，小矮星彼得，他是詹姆和小天狼星的跟班，在小天狼星背叛詹姆和莉莉之后，也把他残忍地杀了，甚至连尸体也没留下，只剩下一根手指。
可是活点地图不会骗人的，小矮星彼得，怎么会出现在霍格沃兹的校园里！哈利想去找找答案，可他什么也没发现。不过他却被西弗勒斯发现了。
“把你兜里的东西交出来。”
哈利不情愿的拿出他的活点地图。
西弗勒斯施法想让地图上的内容显现，可是纸上却出现了这样的字样：月亮脸，虫尾巴，大脚板和尖头叉子众位先生，在此大力赞赏斯内普教授，请他带着他的大鼻子走开，不要多管闲事。
西弗勒斯当然知道这四个人是什么意思，恰巧这时卢平出现了，西弗勒斯把纸扔给卢平，“我刚刚从波特身上没收了一件有趣的艺术品，我想这属于你的专业领域。”
卢平笑了笑，“我想这不过是从外面买的普通的玩具，不过，兴许里面还有什么黑魔法呢，我还是拿回去仔细看看，就像你说的，这属于我的专业领域。走吧哈利。”
哈利跟着卢平教授走了，留下西弗勒斯，暗想这四人究竟以前搞过什么把戏。
“哈利，我不知道这地图怎么到了你的手里，但是这也许是属于小天狼星布莱克的东西，你在半夜出来乱走是十分危险的。”
哈利点了点头，不再要回地图，可是临走时他告诉卢平，“这地图并不总是正确的，我在上面看到了一个已经死去的人的名字。就是小矮星彼得。”
“这不可能。”卢平摇摇头。
“但是确实是这样，晚安教授。”
事情仿佛越来越糟了，先不说鸟嘴真的被斩首，斑斑不停的挣扎，后来竟然真的出现了狗灵，把罗恩拖进了打人柳下的洞里。哈利和赫敏好不容易跟了进去，一直通到尖叫棚屋。他们在那里发现了受伤的罗恩，他的斑斑，还有那只狗……其实是阿尼玛格斯——小天狼星布莱克！
赫敏马上挡在哈利身前，“你想杀哈利，必须先杀了我们。”
“不，今晚只有一个人会死……”小天狼星目不斜视的朝罗恩那边走着。
哈利却不能一直心中的仇怨，他冲着小天狼星扑了上去。就在哈利准备攻击小天狼星的时候，卢平来了，他是顺着活点地图找过来的。
“小天狼星，我们看起来好激动啊。”
“你最了解疯狂的内在是什么不是吗，莱姆斯？”小天狼星躺在地上说道。
两个人突然笑起来，卢平拉起地上的小天狼星，两个人激动地拥抱了一下。
“我找到了，他就在这，我要杀了他。”小天狼星似疯了一般。
“不！我那么信任你，可你真的在接应他！”赫敏大声说道，“他是狼人，所以他才不能去上课。”
“你真是个很聪明的巫师，就像是……”
“不要废话了，卢平！我不能再等了，我在阿兹卡班等了12年！我不能再等了！”小天狼星狂吼着。
“好吧，但是哈利有权利知道真相。”
“我知道，是你背叛了我的父母，让他们被伏地魔杀害！”哈利喊道。
“不，确实有人背叛了他们，但不是小天狼星，是那个人人都以为死了的人。”
“是谁！”
“小矮星彼得！”小天狼星答道，“他现在，就在这里。出来啊彼得！”
“不，彼得死了，是你杀的。”
“我也本以为他死了，直到我在地图上看到他。”卢平说。
“地图说谎！”
“地图从来不说谎。”小天狼星说道，“他活着，就在那……”
罗恩看小天狼星指着自己，吓得要哭了。“我怎么可能……”
“不是你，是你的老鼠。”
“斑斑当我们家宠物已经……”
“12年了，一个老鼠怎么会有那么长的寿命，他有一个指头不见了！”
哈利想了想，“他们只找到他的一根手指……”
“没错，他砍掉自己的手指，让人以为他死了，然后就变成一只老鼠！”
“证明给我看。”
小天狼星抢过斑斑，与卢平合力把他变回了原形。当他们正要杀掉他时，哈利阻止了他们，“他应该被交给摄魂怪，交给阿兹卡班。”
出来的时候，小天狼星感慨万千，他看着城堡，对哈利说，“很漂亮是不是，我总是在想第一次去城堡的时候，若是我恢复自由重新回去，该有多好……你刚刚的做法很高尚，他确实不值得我们动手。”
“我是不希望爸爸的好朋友变成杀人凶手。而且，他死了，真相就无法大白了。”
“有件事，我不知你是不是知道，在你出生时，你父母让我当你的教父……不过如果你愿意跟你的姨母继续生活，我可以理解，但若你想有个新家……”
“你让我跟你一起住？”哈利的喜悦马上就要掩饰不住了。
但是这时，出现了让他们都难以预料的麻烦，月亮出来了……月圆之夜！
卢平变身了，彼得逃走了，小天狼星为了阻止他也变成了大狗，但是他自己根本敌不过狼人的力量，他们刚刚说的梦想，就要破灭了吗！
变了身的狼人非常危险，还好西弗勒斯出现，挡在他们之前，但他也被狼人的利爪横扫，受了重伤。其实当他发现赫敏他们不见了之时，就在不停的寻找他们了。
就在危急时候，远方响起了其他狼人的叫声，卢平听后，马上跑走了，哈利走到小天狼星身边，发现他伤的很重，更糟糕的是，摄魂怪来了……
“呼神护卫！”哈利竭尽全力的喊，可是他的神志也开始不清晰了。
“呼神护卫……”哈利渐渐倒了下去，迷茫中，他看到身后有人又发射了守护神咒语救他和小天狼星，那守护神是一只鹿的样子，赶走了那些可怕的摄魂怪。他觉得，那好像是他的父亲……
当哈利醒来的时候，邓布利多正在他身边，他已经听说了一切，但小天狼星正被关在塔楼里，只有一个方法可以救他。
“你知道规则的，绝对要在最后一声钟声之前回来，不然后果将极其恐怖。如果成功了，你们会拯救不只一个无辜的生命。大概转个两三圈就够了，找不到方向时，就循着自己的教步前进。祝你们好运。”
赫敏明白了邓布利多的话，她拨转自己的时光器，回到了处决鸟嘴的那个时候。
一切那么神奇，又好像注定了一样，他们重新回到那个时刻，秘密的救了鸟嘴，后来，赫敏又学了狼人的叫声，引走卢平，救出哈利。当哈利满心欢喜的期待着能看到自己父亲的时候，他发现，原来救他的人，就是他自己……
最终，赫敏和哈利骑着鸟嘴，来到了黑暗塔楼，小天狼星正关在那里。
赫敏迅速施咒，打开了牢门。小天狼星在看到她开门的那一瞬间，心里突然咯噔了一下。不知道是不是错觉，但在她坚毅眼神的背后，小天狼星似乎看到了某个人的影子。
时间紧迫，他们赶紧坐着鸟嘴，逃离了那座塔楼。
分别之际，小天狼星拉着赫敏的手。
“赫敏格兰杰小姐？”
赫敏点点头。
小天狼星叹了口气，“谢谢你们，救了我。”
“小天狼星，我要跟你走。”哈利说道。
“我的人生太过千变万化，而且，你应该留在这里。”
“可是你是无辜的。”
“你知道我是无辜的，这样已经足够了。这句话你大概听腻了，但是你真的跟你爸爸很像，除了眼睛以外。”
“眼睛像妈妈。”哈利笑笑。
“造化弄人，我跟你父母朝夕相处，跟你相处的时间却这么短，你要记着，所有真心爱我们的人都会在我们身边，他们永远会陪伴着你。在你心里。”
小天狼星再次坐上鸟嘴，他回头看了看赫敏，“你的聪明伶俐让我印象深刻，再见了。”
鸟嘴飞走了，赫敏也不会知道他说的深刻，到底有多么深刻。
钟声想起来了，赫敏拉着哈利飞快往会跑，在门口，正好跟邓布利多碰面。
“他走了。”哈利说。
“谁走了，呵呵。”邓布利多悠然的下了楼。
“你们怎么从那边冒出来了？”罗恩诧异地问。
“他在说什么啊哈利？”赫敏打趣地问。
“我也不知道，呵呵。一个人怎么会出现在两个地方呢。”
“哈哈哈……”
令他们难过的是，卢平教授要走了。因为他是狼人的事被传开了，他不得不辞职离去。他把活点地图还给了哈利，其实那，本就是他父亲他们一起画的。
后来哈利收到了一把新扫帚，火弩箭，最快的型号，他知道，那是小天狼星送给他的礼物。
西弗勒斯后来康复之后，还对卢平和小天狼星把赫敏陷入危境而耿耿于怀，这个小天狼星，在阿兹卡班12年之后，他还是出来了。其实西弗勒斯一直不相信他会背叛詹姆和莉莉，不过阿兹卡班也确实把他折磨的够呛。小天狼星不会知道赫敏的事，虽然那些争风吃醋的年代早已过去，他依旧对这个名字心怀芥蒂。