龙眼的实生苗因开始结果和丰产较迟，且变异大，不能完全保持母树的优良性状，很少直接育成苗木，一般只在嫁接育苗作砧木时采用。
一、圃地选择
龙眼幼苗不耐低温，苗根脆嫩易断，断根后再生新根能力弱。苗地宜选择冬季无低温寒害，避免冬季容易沉积冷空气的低洼地或冬季风大的北坡。以土质疏松肥沃，沙质壤土为佳。
苗圃地应提早犁耙晒白，深20～30厘米，每亩约撒施5 000千克腐熟厩肥、火烧土等杂肥作基肥，再翻犁耙碎，然后开沟整畦，畦一般高20～25厘米，宽1米，畦面平整，畦沟宽30～35厘米，沟底亦应平整，以利灌溉及操作管理。
龙眼播种圃与移植圃的比例一般是1∶6或1∶7，主要是根据播种量和移植的株行距而定。移植圃要求靠近交通方便的地方，以利出圃。
二、播种
龙眼种子一般随采随播。白露前后温度较适宜，发芽快，为理想播种期。播前以1∶2或1∶3的细沙混合堆积催芽。但催芽要注意细沙的含水量，假如含水量太高易引起发霉、烂芽。假如不马上播种，可用含水量1％～2％的沙混合藏在阴凉的地方，但最多只能保存15～20天。
龙眼一般多用撒播，保持粒距8～10厘米，每亩播种量110～125千克，小粒种可减少至100千克。催芽的种子应在早晚播种。用粗圆木棍或平板轻压使种子深入土中与土壤紧密接触，以利吸收水分，然后每亩用2 500～3 000千克火烧土加沙覆盖至看不见种子为度，再覆盖一层稻草，便可引水沟灌，待湿透土壤即排。亦有采用条播，行距12～15厘米，每亩播种量30～35千克。
三、幼苗管理
在幼苗长出30％时抽去一半覆盖稻草，待苗长出80％时全部除去。随即培土以盖没暴露的种子，并灌水、淋水保持湿润。
幼苗生长到第一片真叶老熟时（开头长出两片小叶为子叶），即可施用1∶12（用水稀释）的人粪尿，每月2次，至11月施入土杂肥以利过冬并停止水肥施用，防止冬梢抽发遭受霜害。
龙眼实生幼苗主根发达，侧根生长受到抑制。在真叶长到4片时可用平头锋利之刀，距小苗主干35～50厘米处按45度斜插下，将幼苗主根切断，随即加强灌溉保湿，约1个月，主根断切处便可发出3～4条侧根。经过切根，幼苗虽暂时受到抑制但很快恢复生长，而最后生长较之未断根的良好，且便于移植。
冬季低温期间，最好用塑料薄膜覆盖苗床，提高苗床温度，防止冻害发生。
四、移植和移植后管理
龙眼
一般在播种后第二年春季移植，成活率高，管理较省工，恢复生长快。据一些育苗单位试验，提前移植有更佳效果。早期移植以播种后50天为移植临界期，一般掌握在幼苗第一次梢老熟后移植最佳，这时苗与核还连接在一起，种皮有光泽，种核内营养丰富，能提供幼苗生长所需，可弥补移植后苗根暂时吸收差的缺陷，移植成活率高，移后仍正常生长，基本上没有停滞期，但应注意精细管理和防范霜冻。
移植圃是龙眼苗较长期生长的场所，应提前搞好犁耙，施入充足有机质基肥（每亩可施腐熟厩肥5 000千克），再次犁翻耙平做畦。移栽株行距一般15～20厘米，每亩种11万～12万株，栽毕即淋足定根水。
移植初期，注意保持土壤湿润，保证成活，移植后萌发第一次新梢老熟，即开始施肥，以后每次新梢老熟时都施1次肥。苗木主干15厘米以下萌发的侧芽要及时抹除，集中养分增粗苗干，并使苗干平直光滑，利于嫁接。当苗干直径达到08厘米以上粗度时，便可进行嫁接。嫁接前1个月左右，最好再施1次肥，促进苗木生长，提高嫁接成活率。