伊斯特伍德始终不相信伤心岭战役有海军陆战队的功劳，派克和曼恩斯越想说服他，他就越有疑心。最后，他坚持要在剧本中加入一场戏以说明海威军曹在朝鲜战争期间服役的是陆军，后来才转人海军陆战队。
起初，伊斯特伍德希望《战火云霄》能在春天开机，但是，由于他竞选市长的缘故，开拍日期不得不推迟到夏天。弗里兹·曼恩斯开始在圣胡安卡皮斯特拉诺和圣克莱门特地区寻找可作为外景地的军营。他做好了一切前期准备工作，尽可能不让伊斯特伍德缺席一次市政会议。
在卡梅尔，伊斯特伍德正在成为闲言碎语的中心。他平时最爱穿的T恤衫和牛仔裤被认为有失市长的身份，于是不得不重新置换行头。他接受了马尔帕索服装设计师的建议，选择了他在《肮脏的哈利》中穿过的运动夹克，还戴上了一副平光眼镜，这样的装扮令他看上去既斯文，又不失干练。
他提醒自己要保持耐心，对人要谦和。但是，每当有人反对他的意见时，他的这种“美德”就会瞬间即逝。而他为自己的“失态”找到了一个很好的理由，“你的政治对手就是一群狼，”他说，“你必须大声呵斥才能吓倒他们。”
《战火云霄》的其他演员也已确定。与《义薄云天》失之交臂的玛莎·玛森扮演与伊斯特伍德疏远的妻子安吉。由于伊斯特伍德饰演海威军曹，他在野战排里的对手必须年龄上与他旗鼓相当，所以才会用1929年出生的莫塞斯·古恩。对于这个选择，派克中校不禁惊呼，“我的天呀，这家伙老得可以做我的祖父了！”博·斯文森和艾琳·海克卡特也得到了各自的角色。马里奥·范比尔斯扮演桀骜不驯的新兵，他与海威军曹形成了父子般的矛盾，这种设计是为了吸引更多的年轻观众。
爱德华·卡法戈诺依然负责布景的设计。杰克·格林凭借多年来对伊斯特伍德的一片忠心被提拔为摄影指导。乔尔·考克斯和伦尼·尼豪斯分别负责剪辑和作曲。
曼恩斯安排演员们在海军陆战队教官手下接受一天的新兵训练。伊斯特伍德的任务则是在一旁观察教官如何发号施令。他对这种繁琐的准备工作依然不屑一顾，但他模仿细节的能力却令人不得不钦佩。派克记得在一场戏中伊斯特伍德第一次行军礼，“当时我有点心慌，因为我还没有教他如何正确地行礼，”他说，“摄影机开动了，一名军官走向他，他立刻行了一个最标准的军礼，让你挑不出任何毛病。”
不过，海军陆战队出身的曼恩斯认为伊斯特伍德需要改变一下他平时的举手投足。他和派克都很推崇《铁血军魂》这部电影，弗雷德·德瑞耶在片中同样扮演一位冷血的教官。德瑞耶曾是洛杉矶公羊橄榄球俱乐部的四分卫，后主演过电视剧集《神探亨特》。“这是我看过的最好的一部描写教官的电影，”派克说，“它准确地刻画了他与他的部下以及他的上司的关系。它表现的是人，而不是面谱。”
弗雷德·德瑞耶的海报在军营里处处可见。曼恩斯犯了一个错误，他劝伊斯特伍德应该下到军营里面，体验一下真正的新兵训练。“弗雷德·德瑞耶就是这么做的，”他对伊斯特伍德说。“去他妈的德瑞耶，”伊斯特伍德回答道，“我没有必要浪费这些时间。”
一切准备工作都在按部就班地进行，而就在这时，美国国防部绕过海军陆战队行使了剧本的否决权。国防部公共事务的助理秘书鲍勃·西姆斯在看了拍摄台本后对通篇亵渎军方的立场大为光火，并且表示军方没有授权任何人在电影描写格林纳达战争。
军方高层的意见是要删除所有涉及格林纳达的部分，因为剧本在这方面的描写缺乏真实性。可是，伊斯特伍德的编剧们不仅参考了官方发布的有关格林纳达的材料，而且在创作中也征求了军方的意见。引起争议的部分包括一名通话员中弹身亡的那场戏，国防部声称战斗中没有一名海军陆战队官兵阵亡。另一场海军陆战队营救美国医学院大学生的戏也被认为是捏造的，因为实施营救的是陆军，而不是海军陆战队。
伊斯特伍德对这新冒出来的抱怨十分恼火。他已经把剧本统统改成了海军陆战队，但仍然受到国防部的阻力。派克中校给伊斯特伍德打气，坚信“军方抵制这部电影是因为海军陆战队夺走了他们嘴里的肥肉”。伊斯特伍德、曼恩斯和派克出席了国防部在华盛顿特区召开的通气会。尽管伊斯特伍德怒气未消，但为了能使拍摄如期进行，他勉强同意根据对方的要求修改剧本。
曼恩斯知道伊斯特伍德痛恨别人对他指手画脚，派克也很快领教到了这一点。在潘德莱顿军营开拍的第一天，派克从剧本里发现了～处疑点：这场戏讲的是海威军曹与一名少校军官一道参加军营的聚会，海威从裤兜里掏出一个烧酒瓶，他喝了一口，然后又递给他的上司。在剧本会上，派克向伊斯特伍德指出，这些角色去的是免费的酒吧，所以，为什么他们要站在外面喝自己带来的酒？
对于派克的疑问，伊斯特伍德并未给予回应。散会后不久，派克便听到道具工大声叫喊：“烧酒瓶在哪儿？烧酒瓶在哪儿？”“你说烧酒瓶是什么意思？”派克问。“这场戏要用的烧酒瓶，”道具工回答。“不，根本用不到它！”派克气不打一处来，他不能容忍自己好心的建议会被当成耳旁风。他首先找到曼恩斯。“克林特认为这场戏里应该有烧酒瓶，”曼恩斯对派克说。“不应该有，”派克斩钉截铁地说，“我们必须把它拿掉，否则这将是在潘德莱顿拍摄时间最短的一部电影，因为我会把你们从这里赶出去！”曼恩斯发现派克真的火了，于是连忙跑进了伊斯特伍德的房车。
几分钟后，一身戎装的伊斯特伍德走了出来，他来到派克面前说：“长官，我认为这场戏不需要烧酒瓶，因为它让我感觉不好，所以你不必担心。”
“跟克林特建立友谊大约需要20年，”派克后来说，“但摧毁它只需要20秒钟。在好莱坞几乎没有人敢对他说不，我这么做了，这也意味着我和他永远成不了朋友了。”
与此同时，随着美国国防部对该片的监督越来越严格，曼恩斯和伊斯特伍德之间的裂痕也愈发加深。在自己熟悉的军队氛围中，曼恩斯如鱼得水，相反他觉得伊斯特伍德扮演一位强硬的军人是一件可笑的事情。
参与该片拍摄的海军陆战队第七旅的官兵们也有同感，他们除了向伊斯特伍德索要签名之外，平时更愿意与曼恩斯交往。他们以兄弟相称，一起吃饭，一起开车兜风，而伊斯特伍德只有在一旁干瞪眼的份儿。
一天，掌管第七旅的上校军官光临拍摄现场，向曼恩斯颁发了锦旗。他在简短的发言中说，“我们很高兴看到我们中的一员能在娱乐业取得如此的地位……”当上校发现伊斯特伍德也在场时，连忙补充了一句，“当然，我们也要感谢伊斯特伍德先生给我们的军营带来了欢乐。”伊斯特伍德一动不动地站在那里，脸色铁青。上校转身问曼恩斯，“我说错什么话了吗？”曼恩斯回答说，“没有。克林特只是在想事情。”
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另一个晚上，伊斯特伍德和曼恩斯应邀出席军营中的某个庆祝晚会，大家事先说好要痛饮一场，一醉方休。“到晚会结束时，我已经喝得酩酊大醉，”曼恩斯回忆说，“海军陆战队的那帮兄弟认为我很够意思，不愧是他们的人。他们认为克林特是个娘们儿，因为整个晚上他都在假装喝酒，其实他的酒杯始终是满的。”
第二天，在开车回片场的路上，伊斯特伍德当着派克的面教训曼恩斯：“我想我必须告诉你要有自制，别再喝得烂醉，你让我感到惭愧。”酒劲还没过去的曼恩斯当即掉转车头，大声骂道：“去你妈的！在我的地盘上，我想怎么就怎么！”
在《战火云霄》拍摄阶段，伊斯特伍德与曼恩斯的关系紧张到了极点。
拍摄临近尾声之际，危机再度出现。伊斯特伍德带领剧组前往索拉诺海滩的一所私立学校拍摄美军营救医学院大学生的那场戏，派克因事不能随行，于是打电话给华盛顿特区的国防部公共事务部，让他们派人去现场监督。约翰·肖特威尔中校到现场后觉得有问题，因为在他的印象中这场戏原本是要求删掉的。肖特威尔打电话给他的上司沃尔特·布默尔将军征求意见。
凌晨4点，派克接到布默尔将军的电话，后者要求立刻停止拍摄。派克问清情况后表示他已经让伊斯特伍德删掉了所有有关营救行动的戏，只保留了一场海军陆战队乘坐登陆艇上岸的场面，为的是让影片在情节上有连贯性。但是，华盛顿方面坚持己见，布默尔将军干脆提出直接和伊斯特伍德对话。派克迫不得已只好在4点半时给伊斯特伍德打电话，告诉他国防部坚持要删掉医学院的戏。伊斯特伍德顿时暴跳如雷，“我要给罗纳德·里根打电话！他妈的，这一回我决不让步！”派克转身就在电话里告诉布默尔将军，“克林特正在给白宫打电话。他已经气疯了。”随后，派克和曼恩斯又分头致电国防部公共事务部，希望对方能高抬贵手。
没人知道伊斯特伍德有没有给里根总统打电话，但是最终布默尔将军却拨通了伊斯特伍德的电话，他假装什么事情也没发生，只是简单问了问影片拍摄的进展情况。
这种紧张的空气直到《战火云霄》于1986年圣诞节上映之前仍未消失。派克告诉伊斯特伍德，他必须亲自带着这部影片前往华盛顿放给国防部的官员看，因为对方不想通过任何人转达对该片的意见。几个回合下来，伊斯特伍德已经不把国防部放在眼里，他拒绝听从调遣，于是曼恩斯代替他登上了飞往华盛顿的班机。