文庙位于菏泽市巨野县城东南隅，永丰塔北约一百米处。文庙前后五进院落及东西跨院，共建有殿、堂、楼阁、斋、庑、亭、坊近百间。自南而北，以太和元气坊、棂星门、泮池、戟门、大成殿，、明伦堂、尊经阁等形成文庙，中轴线两侧建有进德斋、修业斋、东庑、西庑、名宦祠、乡贤祠、忠义祠、东华门、西华门等，东跨院为文昌祠，是儒学所在地；西跨院为启圣祠，后改作训导宅。
