真田幸昌和毛利胜家刚刚踏上安汶港的土地，看着这环绕海湾郁郁葱葱的群山，耳边听着海鸥的声声鸣叫，毛利胜家就忍不住对着身边的真田幸昌说道：“这里可真像是日本啊。”
真田幸昌看着安汶港码头那些荷兰式的建筑，不由下意识的回了一句：“我可不希望今后的日本会变成这个样子。”
毛利胜家顺着真田幸昌的目光向前望去，发现港口城镇内的土人看到大明军队的到来不仅没有露出半分敌意，反而载歌载舞的欢迎起明军的到来了。也许这些土人觉得明军的到来帮助他们赶走了荷兰人，但是他们心里可清楚的很，这座岛屿只不过是换了主人而已。
毛利胜家收敛了脸上的微笑说道：“日本自然不会变成他们现在的样子，因为日本还有我们在。只要我们在这场战争中展现出了日本的力量，皇帝陛下自然会意识到日本可用之处。教官们常说：弱肉强食乃是这个世界的法则，那么我们这些军人就应该努力不让日本成为弱者，这不正是吾辈的责任吗。”
真田幸昌没有继续回答，而是认真的打量起了这座岛屿。丘陵起伏的安汶岛是摩鹿加群岛中较小的一个岛屿，岛屿东西两侧有两个巨大的海湾侵入，差点就将这个岛屿一分为二了。西面的安汶湾最为深入岛屿内部，这也使得这处海湾成为了天然的良港，岛屿南部的安汶港也就成了整个摩鹿加群岛的贸易港口。
自古以来，从中国、印度而来的大型海船都会行驶到这个港口进行香料贸易，而群岛的土人则用小船将香料运送到这个大港，再把棉布和其他日用品运回自己居住的小岛。
当荷兰人来到此处之后，便看上了安汶港优良的港口条件，且安汶岛南部和北部只有一条不到2公里的陆地通道，让安汶港的地理环境变得易守难攻，于是荷兰人便强行占据了这里，然后通过这个港口控制了整个摩鹿加群岛的香料贸易。
自从荷兰人来到这里之后，其他各国商人便渐渐绝迹，因此港口城镇中荷兰式的建筑便越来越多，城镇中心也转移到了以荷兰商馆为中心的荷兰人居住区域。但是这次出征大明，巴达维亚也调走了驻扎在安汶港的荷兰船只及一部分兵力，导致普特曼斯舰队的败亡消息传回之后，安汶港的防御也出现了漏洞。
为了避免东协舰队步步蚕食，巴达维亚干脆就将安汶港的荷兰人撤回了巴达维亚城。因此当真田幸昌和毛利胜家跟着明军船只抵达安汶港时，这座港口就立刻向东协舰队投降了。
此时也是安汶港香料贸易开始的时期，走入港口的城镇内便能闻到浓郁的香料味道，荷兰人的逃离使得这些土人喜笑颜开，认为今年总算不用再向荷兰人缴纳重税了。当然，他们开心的未免太早了些。
舰队中的西班牙代表看到整个香料群岛毫无抵抗的落入到了东协手中之后，便立刻要求召开舰队评议会，成立香料群岛的代管委员会，避免今年香料贸易的税收流失。
原本目标就在于香料群岛的欧洲船长们，立刻便响应了西班牙代表的提议，对于继续南下进攻巴达维亚则失去了兴趣。
以为何昌旗代表的明海军将领自然不会认同这个短视的主张，双方从九月初争执到了九月中旬。直到张燮、李晨芳、许心素等人随着庞大的日本支舰队抵达了安汶岛后，这场争论方才告一段落。
张燮抵达安汶岛听说了争论之后，便撇开西班牙代表同英国、葡萄牙代表进行了秘议，随后三国代表便在评议会上修改了西班牙代表提出的代管委员会方案，否决了西班牙代表希望分割香料群岛的主张，认为香料群岛应当视为一个不可分割的主体，至于整个香料群岛的贸易税收及其他利益，应当在战争结束之后，根据各国在战争中的贡献交由东协会议进行讨论，而不是由代管委员会进行分配。
于是西班牙代表提出的建议，最终只是通过了一个设立香料群岛代管委员会的提议，这个委员会的权力也和西班牙代表的设想相去万里，且第一任代管委员会主席职务还落在了葡萄牙人的身上。
9月20日，关于香料群岛利益分配的争论告一段落，在明显占据了优势的中、英、葡三方代表的联手下，西班牙代表终于表示屈服，并赞成了南下进攻巴达维亚的军事计划。
在安汶岛上悠闲了半个多月的真田幸昌和毛利胜家等日本军校学员，再次登上了船只，准备跨海进攻巴达维亚。不过这一次他们就不是混在明军的队列中了，而是被李晨芳调入了麾下的大阪第二师团，恢复了他们联队长的职位。
此次日本出兵，虽然崇祯只是要求李晨芳调动一个师团的兵力就足够了，但是江户幕府听说之后也恳切的向叶雨轩提出请求，希望能够参与这场战争。江户幕府的这一行动不仅仅在于想要向大明示好，也是希望能够借助这场战争令江户幕府训练的新军见识下市面，在实战中了解下幕府新军同大明军队之间的差距。
因此日本此次出战的陆军兵力达到了近4000人，江户幕府派出的两个联队，加上大阪幕府派出的大阪第二师团。至于明军这边，也只是从台湾抽调出的一个陆军团，近2500人的兵力，不过这个陆军团的军官配置及火器装备却远远超过了日本派出的这一个半师团。
带领明军这只陆军团的，正是此前济州第一步兵团少校营长齐祖光，作为从四海营中出去的军官，他对于手上这只主要从四海营抽调士兵组成的台湾第三步兵团，丝毫没有陌生感觉。而他的军衔此时也已经晋升为中校，算的上是四海营出身的佼佼者了。
不过即便是如此，在李晨芳面前，齐祖光也保持了足够的尊敬姿态。如果说此前的作战都是海军舰队说了算，那么接下来的战争指挥权便又回到了陆军手中。作为荷兰人在东南亚地区经营了十多年之久的要塞港口，从海上进攻显然不是一个好主意，这也是巴达维亚坚持不投降的底气所在。
而东协舰队中能够指挥这场陆战的，便只有军衔最高的陆军上校兼日本大阪副总督的李晨芳了。东协舰队中除了日本陆军和大明陆军这两只成建制陆军部队之外，尚有英国、西班牙、葡萄牙拼凑出来了4个营，每营约500人。
李晨芳再检阅完所有的陆军部队之后，便将英国人和葡萄牙人的两营陆军排除在了进攻巴达维亚的序列，在他眼中这两营陆军只是一些没有经过系统训练的民兵，难以使用在进攻要塞的战场之上。
9月28日，毛利胜家带着自己的联队坐船前往占领苏拉威西岛的重要港口望加锡，也就在同日，真田幸昌联队前往了东爪哇的泗水。一日后，一个西班牙营坐船前往了婆罗洲岛南面的重要港口马辰。
10月3日，东协舰队主力出现在了三宝垄外的海面。到了10月17日，巴达维亚同外界的联系已经全部被东协舰队切断。爪哇岛西侧的巽他海峡及东面的龙目海峡，也都已经被东协舰队控制。
10月20日，在荷兰人及东协之间摇摆不定的马打蓝苏丹国的素丹·阿贡**·朗桑，再听说了东协舰队的船只充斥了从泗水到三宝垄之间的海面后，终于下定决心投靠了东协这边，驱逐了巴达维亚派来拉拢他一起对抗东协的使者。
从中爪哇内陆发迹的马打蓝苏丹国，此时还算不上一个封建集权国家，而更像是一个封建领主共治的社会。王国虽然领有中、东爪哇及西爪哇的一部分土地。但是国家的核心部分却只有素丹的世袭领地克腊帕亚克、马打蓝、巴章和葛都等内陆地区，其他地区则由亲王及贵族作为领主统治着。
**·朗桑再两次进攻巴达维亚无果之后，对于夺回荷兰人占去的西爪哇地区已经失去信心了。而此时看起来比荷兰人更为强大的东协舰队的到来，特别是爪哇岛曾经的宗主国中国的到来，更是让他不愿意加入到这场战争中去了。
**·朗桑虽然倒向了东协，却也只肯负责支援舰队的后勤工作，不肯派兵参加进攻巴达维亚的战争中去，显然这位苏丹对于东协的防备并不亚于荷兰人。
不过对于东协舰队来说，这位苏丹能够负担舰队的后勤已经足够了。爪哇岛土地肥沃，物产丰富，从当地获取物资补给，无疑给舰队减去了极大的负担。
在本地人的帮助下，李晨芳很快率领军队打到了西爪哇的中心城镇万隆，此地以出产优良的勃良安剑而闻名。万隆同时也是一处山间盆地，四周环绕着各种山峰及火山，因为地势较高，这里的气候终年在20多度，植物繁茂，环境优美，可算是爪哇岛上难得的避暑盛地。
荷兰人也在此处建立不少别墅，把这里当做了巴达维亚的后花园。不过现在么，这些别墅同样成为了东协军队的战利品。
战争打到了这个程度，东协军队面前也就剩下了一座巴达维亚城而已了。只不过巴达维亚城的位置实在是太好，周边沼泽、山林密布，除了海上的通道之外，也就只能从东西两面的道路进攻。
而西面的塔拉汉港同样受控于荷兰人手中，因此从陆地进攻的话，便只有东面一条道路可走。荷兰人在这条道路上修建了20余座堡垒，这也是**·朗桑两次进攻巴达维亚无果的缘由。
在万隆的一座别墅内，李晨芳等陆军军官和舰队船长们经过了一番讨论之后，决定把军队分为两路进攻。齐祖光带着台湾步兵团从海外进攻巴达维亚西面的塔拉汉港，而李晨芳率领剩下的军队从东面正面进攻荷兰人的堡垒。
对于大阪第二师团来说，从加拉璜、西卡朗、勿加泗到雅加达城外的这一百里路程，简直是用血肉铺成的道路。困兽犹斗的荷兰士兵，在初期战斗中宁可点燃火药桶和冲入堡垒的日本士兵同归于尽，也不可向日本士兵投降。
西卡朗之战中，荷兰人引爆的火药库，让整整一个大阪师团的步兵中队炸上天后，站在后方观战的李晨芳终于看不下去了，他把指挥作战的毛利胜家叫过来，在一干部下面前毫不留情的正正反反扇了他20多个耳光，把他的脸都打的红肿了，才算是放过了他。
之后李晨芳亲自接过了前线部队的指挥权，下令在原地开始修整，并从舰队上卸下了2门24斤重炮和4门12斤炮运到前线，这才算是彻底压制住了荷兰人依仗坚固堡垒的抵抗。于是战争很快变成了炮弹威力和堡垒坚固度的战争，日本士兵伤亡率终于降了下来。
不过即便是如此，打到雅加达城下的大阪第二师团也战损了将近一个半联队，但剩下的部队士气反而更高昂了起来。至于江户幕府的新军虽然只损失了半个联队，但是却完全被这样残酷的作战吓破了胆，李晨芳不得不将他们调到后方，让他们负责后勤保卫的工作去了。
这些日本人的牺牲，终于得到了观战的东协成员们的认可，他们在看过了惨烈的战场之后，终于同意了中国代表的意见，让日本派出代表参加东协，成为东协的观察国家。