邓玉函、陈实功两人倒是一时相见恨晚，成了一见如故的忘年交。之前几天，他们正在为肠痈的位置究竟在什么地方，进行了很激烈的讨论，但是在没有实际证据的状况下，谁都说服不了谁。
结果就是，胆大妄为的邓玉函趁着昨天兵变时，在西四牌楼为受伤的军士、百姓治疗的机会。把一名伤重不治死亡，而又没有家人收敛的军士尸体，悄悄的运到了太医院，并同陈实功和几位学生解剖了这具尸体。
在这解剖尸体的过程中，一名邓玉函刚刚招收的学生，对于解剖学并不了解，把这当成了巫蛊之术。
他斗争了一个晚上，终于决定还是向锦衣卫告发，把自己从这大案中摘出去。
结果刚好今日当值的是指挥使刘应袭，这位权欲熏心的锦衣卫首领官，正想做些事引起崇祯的注意，也就不管不顾的带人冲进了太医院。
听完了邓玉函和陈实功的解释，朱由检忍不住有些想要叹气，他顺手抓过了桌上的茶盏正想喝，却又想起了这好像是邓玉函拿过来的。
他顿时默默的把茶盏放了回去，在这个没有橡胶手套，没有肥皂的时代，他不清楚这两人在解剖完成之后是怎么消毒的。因此他并不打算，喝邓玉函碰过的茶盏。
“那么两位现在有结论了吗？究竟是谁判断的正确？”朱由检不由开口问道。
皇帝提出的问题，让两人有些意外，不过邓玉函还是快速的反应了过来，回答道：“陈老先生的判断更为准确。陛下，这件事都是我一个人所为，希望陛下不要因此而处罚其他人了。”
陈实功也颤颤巍巍的对着崇祯跪了下去说道：“臣同样有罪，不过还请陛下宽恕臣的这几个徒弟，参与解剖一事，都是臣令他们在旁观摩的，非是他们的本意。”
朱由检赶紧起身上前，扶起了头发雪白的陈实功，然后略带责怪的说道：“朕当初让你们交流东西方医学，原也没说不能学习这个解剖学。
只不过解剖尸体一事，在我大明还很少有人能够接受。朕又有些疏忽，没有替你们安排一个专门学习医学的地方，所以才导致了今天这个状况发生。
首先朕以为，出于治病救人的目的，通过解剖尸体来了解人体的秘密，并不是什么巫蛊之术。”
皇帝的肯定，终于让邓玉函、陈实功两人吃了定心丸。虽然刚刚崇祯出面包庇了他们，强迫刘应袭做了伪证，但是他们心中还是担忧，崇祯会否因为此事而排斥解剖学。
邓玉函是担忧，崇祯把解剖学当成邪术，从而把天主教也当成邪教，那他可真成了耶稣会的罪人了。
陈实功并不担忧自己，而是担心他的那班徒弟，和邓玉函刚刚招募来的助手兼学徒不同，他的几名徒弟都是跟随他多年，情同父子一般的存在。
“…不过嘛，为了不让京城百姓，朝廷上下物议纷纷。在大明还没有接受通过解剖尸体学习医学的做法之前，你们不要光明正大的进行宣扬。
这太医院作为朝廷衙门，又处于中央官署之中，要是引起了非议，朕也不能出头为你们说话。因此今后绝不能在这里，进行解剖实验。朕以为…”
朱由检停顿了半天，思考着什么地方比较偏僻适合。邓玉函不由插嘴说道：“陛下，臣以为宣武门内的象房附近比较僻静，没什么人住在左近，非常适合建立一所医学院。”
“象房么，靠近京城运送尸体出城的宣武门及广宁门，倒是一个不会让人引起怀疑的地方。”朱由检不由思考着。
他对着邓玉函点点头说道：“那就先暂时从象房借几间空置的房间，然后来年在附近找片地方修建医学院和医院。
不过我希望两位记住，今后对于没有做好献身医学，拯救世人病痛的学生，还是不要勉强他们学习这个解剖学了，免得再闹出事端来。”
邓玉函、陈实功顿时向崇祯点头应是，他们经过今天的事，也有些后怕了起来。
特别是邓玉函，解剖尸体在欧洲同样被视为魔鬼的行径，要是事情闹大了，被罗马教廷得知，他一样是要被开革出教门的。
朱由检停顿了一下，才小心的斟酌说道：“还有一事，你们在解剖时，最好能够绘成一本人体解剖图，先让初学者通过图画简单的认识人体的各器官，然后再让他们参与尸体解剖，也可以借此淘汰一部分心思不正之人。
至于解剖使用的尸体，朕会安排锦衣卫给你们送死囚的尸体过来，你们就不要再去冒险窃取尸体了。”
邓玉函、陈实功对此自然是毫无意见，陈实功的情绪很明显放松了许多。和邓玉函这种几近于科学怪人的人相比，盗取尸体进行解剖，对深受儒家伦理道德教育的陈实功而言，他精神上受到的压力更大。
紧接着朱由检便认真的说道：“此外朕希望能和你们做几个约定，希望你们可以做到。
一、解剖尸体之前，需要向参与解剖的人介绍尸体生前的名字，和死亡原因，参与解剖者要表示对其贡献出自己的身体进行医学研究进行感谢；
二、尸体解剖完成之后，尽量把尸体恢复原状，对伤口进行缝合，以保证他能安心离去，也作为对死者的尊重；
三、解剖完尸体后，所有参与的人必须要进行洗浴，身上的衣服也必须进行全部更换，换下的衣物必须要进行蒸煮消毒。特别是停放尸体的地方，清洗尸体的地方，必须要远离饮用水井，因为人的身体上有许多看不见的细菌…”
“不，不，陛下能看见。”邓玉函有些激动的说道，甚至都忘形的打断了崇祯的话语。
“嗯？”朱由检有些疑惑的看向了邓玉函，邓玉函双手比划了一下说道：“太医院有个叫吴什么的学生，听臣说了望远镜趣闻后，向臣请教关于如何制造望远镜的方法，想要用这个来找出什么细菌来。
臣对于望远镜了解不深，就把他介绍给了汤若望神父。结果这位学生用磨出的镜片，真的能够放大物体，虽然还看不到细菌什么的，但是已经可以把物体放大许多倍了，臣相信只要给他一些时间，一定可以找到观察到细菌的方法。”
“显微镜？”朱由检脑子里顿时浮现出了一个名字。显微镜对于近代医学来说，就是一件不可或缺的神器。重要的是，它在钢铁、矿石品位，土壤成分分析上也是相当有作用的。
望远镜是人类观察宏观世界的眼睛的话，那么显微镜就是人类打开微观世界大门的钥匙。
在朱由检的要求下，邓玉函顿时叫那位学生拿来了他发明的器具。
朱由检看到进来的学生，稍稍楞了一下，原来就是他在药铺遇上的，那位医学狂热爱好者。
随即他又把目光转向了吴有性怀中小心翼翼拿着的器具，这器具的模样和他记忆中的显微镜的样子可是大相径庭了。
在一个木头的支架上，竖立着4根木制的托。在朱由检面前放下器具之后，吴有性小心翼翼的从怀内取出了一个木盒子，打开木盒子，就能看到里面有八个小方格，每个小方格内都铺设着一小块细布，大约有4个小方格内摆放着4块镜片。
朱由检饶有趣味的看着，吴有性挑出两块凸透镜安置在了前两个木托上，又拿起一个蜡烛点燃后固定在最后的木托上，然后取过了要观察的物事放在了第三个木托上。
调整了将近一刻钟之后，吴有性才请崇祯进行观察。稍稍看了一眼，确定了的确有放大的效果之后，朱由检就开始观察起这具显微镜的本身起来了。
朱由检观察了镜片半天，才说道：“这个难道不是用玻璃磨制的吗？”
吴有性顿时点头说道：“是的，陛下。我在汤若望神父那里见过，用玻璃磨制的镜片，虽然号称无色，但是始终还是带有一些杂色和气泡。
这些是臣游历北上，经过淮安府海州时，收集的一些水精，原打算回乡时馈赠亲友。不过臣看了汤若望神父磨制的镜片之后，觉得也许可以用水精来磨制，就试了试。”
朱由检再次透过镜片观察了下，估算了下放大倍数大约在30-50之间。
列文虎克制备的单体显微镜，可是能达到近300倍的存在，不过现在这位显微镜制做专家应该还没有出名吧，否则金尼阁、汤若望等人就不会只献上望远镜和＆laquo;远镜图说＆raquo;了。
朱由检沉默了一会之后，就对着吴有性称赞道：“的确是很不错的东西，我想，如果你能够继续制作出，放大倍数更大的显微镜的话，你一定可以用它观察到细菌的存在。”
“显微镜？显示微小之物，不错，这个名字起的真好。比小民想的望微镜要好听多了，多谢陛下赐名。”吴有性有些兴高采烈的向崇祯感谢道。
朱由检笑而不语，要求旁人送来纸张笔墨，他按照记忆把后世显微镜的大致形状画了出来。
“朕觉得，你这个显微镜使用太不方便，应当稍稍修改下…”为了能够制作出适合使用的显微镜，朱由检不由向吴有性介绍起了，后世显微镜制作的原理起来了。