后金统治集团内部的残酷政治斗争，不会因努尔哈赤率领众子侄对神设誓而消失。同样，“怀礼义之心”的诸王贝勒，对于凯觎汗位者，必不能“化导其愚顽”。有汗位，就有激烈的争夺；有争夺，就有酷虐的斗争。这种为争夺皇位而骨肉相残的宫廷斗争史，后来一再重演。
努尔哈赤为加强汗权，同其胞弟舒尔齐发生了权力与财富之争。
早在努尔哈赤起兵之初，舒尔哈齐处于其副手的地位。在明官书中，往往努尔哈赤与舒尔哈齐并称。舒尔哈齐曾以建州卫都督等身份，多次进京“朝贡”，如：
万历二十三年（1595）八月，“建州等卫女直夷人速儿哈赤等赴京朝贡，命如例宴赏”（《明神宗实录》内阁文库本，第23卷）。
万历二十五年（1597）七月，“建州等卫夷人都督都指挥速儿哈赤等一百员名、纳木章等一百员名，俱赴京〔朝〕贡，赐赏如例”（《明神宗实录》第312卷）。
万历三十四年（1606）十二月，“建州卫都督都指挥速儿哈赤等入贡”（谈迁：《国榷》第80卷）。
万历三十六年（1608）十二月，“颁给建州右等卫女直夷人速儿哈赤等一百四十名，贡赏如例”（《明神宗实录》第453卷）。
舒尔哈齐多次进京“朝贡”，这在他兄弟五人中，除其长兄努尔哈赤外是仅见的。
另从朝鲜史籍中，也能反映出舒尔哈齐的显贵地位。如申忠一到费阿拉所绘建州首领住家图录仅二幅，即《木栅内奴酋家图》和《外城内小酋家图》。他所见舒儿哈齐“体胖壮大，面白而方，耳穿银环，服色与其兄一样”（申忠一：《建州纪程图记》图版17）。比申忠一先一月到费阿拉的朝鲜通事河世国，分别受到努尔哈赤和舒尔哈齐的接见与宴赏：
老乙可赤常时所住之家，麾下四千余名，佩剑卫立，而设坐交椅。唐官家丁先为请入拜辞而罢，然后世国亦为请入，揖礼而出。小乙可赤处一样行礼矣。老乙可赤屠牛设宴，小乙可赤屠猪设宴，各有赏给。（《李朝宣祖实录》第69卷）
朝鲜和明朝的史籍记载，都说明努尔哈赤与舒尔哈齐曾是主副配合、相辅相成的。
但是，努尔哈赤与舒尔哈齐之间的矛盾，在万历二十三年（1595）已见端倪。申忠一见舒尔哈齐家里“凡百器具，不及其兄远矣”；舒尔哈齐也向申忠一力言：“日后你佥使若有送礼，则不可高下于我兄弟。”（申忠一：《建州纪程图记》图版20）这表露出舒尔哈齐对已获权位与财货的不满。尔后，万历二十七年（1599）建州兵征哈达时，努尔哈赤在哈达城下当众怒斥舒尔哈齐，他们之间的裂痕加深。万历三十五年（1607），努尔哈赤以舒尔哈齐在乌碣岩之役作战不力，命将其二将常书、纳奇布论死，后依舒尔哈齐恳请，二将免死，罚常书银百两，夺纳奇布所属牛录。自此，努尔哈赤“不遣舒尔哈齐将兵”（《清史稿·舒尔哈齐传》第215卷），削夺其兵权。万历三十七年（1609）三月，舒尔哈齐被夺去兵权后，郁闷不乐，常出怨言，认为活着还不如死了好，遂移居黑扯木。努尔哈赤命收回其弟舒尔哈齐贝勒的财产阿哈，杀了他的儿子阿布什，又将他的部将武尔坤吊在树上以火烧死。同年，明辽东巡按熊廷弼行“间速酋以断其手足”之策（《熊廷弼书牍》第1卷）。万历三十九年（1611）八月十九日，舒尔哈齐贝勒死。据明人黄石斋《建夷考》载：
酋疑弟二心，佯营壮第一区，落成置酒，招弟饮会，入于寝室，锒铛之，注铁键其户，仅容二穴，通饮食，出便溺。弟有二名裨，以勇闻，酋恨其佐弟，假弟令召入宅，腰斩之。
另如《三朝辽事实录》也载：
奴酋忌其弟速儿哈赤兵强，计杀之。
据明人诸书所载，舒尔哈齐被其兄努尔哈赤加害，但清朝史书讳言。努尔哈赤为人威暴严厉，据《栅中日录》记：
奴酋为人猜厉威暴，虽其妻子及素亲爱者，少有所忤，即加杀害，是以人莫不畏惧。
据努尔哈赤的威暴性格及明代史书的有关记载，努尔哈赤为强化汗权，幽杀其胞弟舒尔齐贝勒是很有可能的。孟森先生断言舒尔哈齐之死，“实乃杀之”（孟森：《明清史论著集刊》）。
舒尔哈齐死后，汗位之争的焦点移向努尔哈赤的长子褚英。
禇英，母佟佳氏，万历八年（1580）生。他于万历二十六年（1598）率兵、征安楚拉库路，被赐号洪巴图鲁；万历三十五年（1607）在乌碣岩之战中立功，被赐号阿尔哈图土门；翌年，又偕贝勒阿敏等攻乌拉，克宜罕阿麟城。旋因居长，屡有军功，被努尔哈赤授命执掌国政。褚英柄政后，因年纪轻，资历浅，心胸偏狭，操切过急，受到“四贝勒”、“五大臣”内外两方面的反对。“四贝勒”即努尔哈赤“爱如心肝”的代善、阿敏、莽古尔泰、皇太极。他们各为旗主贝勒，握军队、拥权势、厚财帛、领部民，建州又无立嫡以长的历史传统，不满于褚英当嗣子、主国政的地位。他们上告长兄褚英，似有争嗣之嫌，于是争取同“五大臣”联合，倾轧褚英。“五大臣”即努尔哈赤所“信用恩养、同甘共苦”的费英东、额亦都、扈尔汉、何和里、安费扬古。他们早年追随努尔哈赤，威望高、权势重、历战阵、建殊勋，当克图伦时，禇英尚在襁褓之中，他们自然也不满于褚英专军机、裁政事的地位。他们首告嗣储褚英，似有贰心之嫌，于是也力求同“四贝勒”结合。
努尔哈赤嗣子褚英对这些建州的“柱石”和“元勋”缺乏谦恭之态，想趁父汗在世时逐渐削夺他们的财富和权力，以便巩固储位。这促使“四贝勒”与“五大臣”经过密议之后，联合向努尔哈赤告发褚英。努尔哈赤让他们每人写一份文书呈送。他们各写文书、联合控告褚英的“罪状”是：第一，使“四贝勒”、“五大臣”彼此不睦；第二，声称要索取诸弟的财物、马匹；第三，曾言：“我即位后，将诛杀与我为恶的诸弟、诸大臣。”（《满文老档·太祖》第3卷）努尔哈赤在权衡长子褚英与“四贝勒”、“五大臣”两方力量对比之后，断然寖疏褚英。尔后两次耀兵乌拉，努尔哈赤没有派褚英出征，让他留居在家中。“褚英意不自得，焚表告天自诉，乃坐咀咒”之罪（《清史稿·褚英传》第216卷），万历四十一年（1613）三月二十六日，被幽禁在高墙之中。万历四十三年（1615）八月二十二日，努尔哈赤下令将长子褚英处死，当时褚英年仅三十六岁。
此段史事《旧满洲档》载述较详：
聪睿恭敬汗以其长子阿尔哈图图们，心术不善，不认己错，深恐日后败坏治生之道，故令将其囚居于高棚（屋内）。经过二年多之深思，虑及长子若生存，必会败坏国家。倘怜惜一子，则将危及众子侄、诸大臣和国民。遂于乙卯年聪睿恭敬汗五十七岁，长子三十六岁，八月二十二日，始下决断，处死长子。
上述文中自“经过”以下，至“长子”以上的文字，在《旧满洲档》中被圈掉，故为《满文老档》所讳缺。
后金汗努尔哈赤为加强汗权而幽弟杀子，心怀惭德，久不平静。他年事渐高，不愿子孙们骨肉相残，要不咎既往，唯鉴将来，子孙环护，长治久安。天启元年即天命六年（1621）正月十二日，后金汗召集诸子侄及长孙，代善、阿敏、莽古尔泰、皇太极、德格类、济尔哈朗、阿济格、岳托等，对天地神祇，焚香设誓：
蒙天父地母垂祐，吾与强敌争衡，将辉发、兀喇、哈达、夜黑，同一音语者，俱为我有。征仇国大明，得其抚顺、清河、开原、铁岭等城，又破其四路大兵，皆天地之默助也。今祷上下神祇：吾子孙中纵有不善者，天可灭之，勿令刑伤以开杀戮之端。如有残忍之人，不待天诛，遽兴操戈之念，天地岂不知之？若此者，亦当夺其算。昆弟中若有作乱者，明知之而不加害，俱坏〔怀〕礼义之心，以化导其愚顽。似此者，天地祐之，俾子孙百世延长。所祷者此也。自此之后，伏愿神祇，不咎既往，惟鉴将来。（《清太祖武皇帝实录》第3卷）
后金统治集团内部残酷的政治斗争，不会因努尔哈赤率领众子侄等对神祇设誓而自行消失。同样，“怀礼义之心”的诸王贝勒，对于凯觎汗位者，必不能“化导其愚顽”。在后金统治集团中，有汗位，就有激烈的争夺；有争夺，就有酷虐的斗争。满洲这种为争夺皇位而骨肉相残的宫廷斗争史，后来一再重演。
褚英被囚死后，后金汗努尔哈赤的“建储”之争更为剧烈。这主要在四大贝勒中的代善和皇太极之间进行明争与暗斗。“天命年间四大贝勒各拥重兵，凯觎大位。顾阿敏为太祖侄，莽古尔泰之母则得罪太祖，故以代善与太宗最为有望。当开国之初，削平诸部，夺取辽、沈，二王功最高”（赵光贤：《清初诸王争国记》）。代善与皇太极，以序齿言，褚英已死，代善居长，皇太极为弟行；以武力言，代善独拥二旗，为皇太极掌一旗所不及；以才德言，代善宽厚得众心，皇太极则威厉为人畏惮。努尔哈赤自然决定让代善继褚英执掌国政。代善因被赐号古英巴图鲁，朝鲜史籍称他贵盈哥。《建州闻见录》记载，努尔哈赤死后，“则贵盈哥必代其父”。努尔哈赤说过：“俟我百年之后，我的诸幼子和大福晋交给大阿哥收养。”（《满文老档·太祖》第14卷）大阿哥即大贝勒代善，大福晋是努尔哈赤的大妃乌拉纳喇氏阿巴亥。努尔哈赤将爱妃大福晋和诸心肝幼子托给代善，即预定他日后袭受汗位。代善性宽柔、孚众望，军功多、权势大，自协助父汗主持国政后，凡努尔哈赤不在时，一些重大军机便先报告给他。然而，代善也有其弱点。随着代善的权位日重，他同其父汗及其弟皇太极的矛盾便趋向激化。
代善同努尔哈赤、皇太极之间的矛盾，以德因泽的告讦而爆发。《满文老档》记载，万历四十八年即天命五年（1620）三月，小福晋德因泽向后金汗告发道：“大福晋两次备佳肴送给大贝勒，大贝勒受而食之。一次备佳肴送给四贝勒，四贝勒受而未食。大福晋一天二三次派人去大贝勒家，大约商议要事。大福晋有二三次在深夜出宫院。”努尔哈赤派扈尔汉、额尔德尼、雅荪和莽阿图四大臣去调查，后查明告发属实。而诸贝勒大臣在汗的家里宴会、集议国事时，大福晋饰金佩珠、锦缎妆扮，倾视大贝勒。诸贝勒大臣虽内心不满，却因惧怕大贝勒和大福晋而不敢向汗报告。努尔哈赤对大贝勒同大福晋的暖昧关系极为愤慨，但他既不愿加罪于儿子，又不愿家丑外扬，便借口大福晋窃藏金帛，勒令离弃。小福晋德因泽因告讦有功，被升为与努尔哈赤同桌共食。或言德因泽告讦之谋出自皇太极。皇太极借大贝勒与大福晋的阴私，施一箭双雕之计，既使大福晋被废，又使大贝勒声名狼籍，并离间了努尔哈赤与代善的父子之情，为他后来夺取汗位准备了重要条件。
时后金汗努尔哈赤年事已高，选立嗣君的计划一次又一次地破产。这促使他试图废除立储旧制，改革后金政体，实行八大贝勒共治国政的制度。