梁清标，直隶正定人。明崇祯十六年进士，官庶吉士。福王时，以清标曾降附流贼李自成，定入「从贼」案。
本朝顺治元年，投诚，仍原官。寻授编修，累迁侍讲学士。十年五月，迁詹事。闰六月，迁秘书院学士。十二月，擢礼部侍郎。十一年，敕赈直隶八府灾民；清标与侍郎祝世允分赈保定所属二十州县、三卫、一所并顺天府属腾骧、永清二卫屯丁之在保定者。还，奏称旨。十二年，调吏部右侍郎。奉诏陈政事得失，清标疏言：『民生休戚，系乎牧令。请令督、抚重视州县官，勿使疲于趋承；假以便宜，俾兴利除害，无或掣肘。台臣职居言路，旧有部郎改授之例；宜令各部堂官择端方谠直者，与卓荐州县各官一体考选。吏部掌人材进退，宜于选、功二司设记功、记过二簿，于序俸、升选中仍分别察核，以昭惩劝。山林隐逸，屡奉诏荐举，未有应者；请敕九卿公举数人，礼聘入京，召见咨访，以收旁求实用』。下部议行。是年，转左侍部。以本生母丧，归。十三年四月，迁兵部尚书。八月，同尚书卫周祚等奉敕督赈顺天府属二十七州县。
十六年，海上郑成功由镇江犯江宁，给事中杨雍建疏言：『海氛告警，宵旰焦劳。枢臣职掌军机，于地形之要害、防兵之多寡、剿抚之得失、战守之缓急，不发一谋，不建一策，仅随事具覆，依样葫芦；不曰「今应再行申饬」，则曰「臣部难以悬拟」。既不能尽心经画，决策于机先；又不能返躬引咎，规效于事后。请天语严饬，以儆尸素』。诏兵部回奏。时尚书伊图奉使云南，清标同侍郎额赫里、刘达、李棠馥疏辩：『自有海警以来，凡调发机宜，随时斟酌，审势议覆；未敢依样葫芦，因循推诿』。得旨：『枢臣职司戒务，调度机宜尽心筹划，方为不负委任。此回奏巧言饰辩，殊不合理！着再回奏』。于是自引咎；下吏部察议，三侍郎皆降二级、清标降三级，各留任。十七年二月，京察自陈；谕曰：『梁清标经朕特简，畀掌中枢；自当殚竭心力，以图报效。乃凡事委卸，不肯担任劳怨。本当议处，姑从宽免；其痛自警省，竭力振作』。五月，上以岁旱，令部院诸臣条奏时务。清标与李棠馥疏言：『兵马往来之地，应用米豆、薪刍、牛酒、羊猪及锅囗〈算刂〉、槽桩诸物，上官取诸下司、下司取诸民间、赔累无穷。又奸民捏告通贼谋叛，蠹役贪官借端取货，生事邀功，致善良受害。应俱严行敕禁』。得旨：『所奏「上官取诸下司，下司取诸民间」及「借端取货，生事邀功」，着确指其人』。于是复奏：『迩年地方官藉兵马往来、滥派民间，则有丹徒知县陈经筵、合肥知县岳呈祥等，为巡抚张中元、总督蔡土英所劾。藉通贼谋叛名、鱼肉平民，则有桐城知县叶桂祖、常熟和县周敏等，为给事中汪之洙、巡按何元化所劾。其未经劾奏者，不知凡几。故请旨敕禁，惩前以毖后』。疏下部知之。
康熙五年，调礼部尚书。六年，充会试正考官。旋遇京察，革职。八年，辅政大臣鳌拜以专擅获罪拘禁，诏复前此无故黜革诸臣原官；清标预焉。十年，补刑部尚书。十一年，调户部尚书，充经筵讲官。十二年，平南王尚可喜请撤藩归辽阳，命清标在广东经理藩属迁移事。旋以逆藩吴三桂反，仍敕可喜留镇，清标还京。十八年，给事中姚缔虞请宽科道纠刻不实处分，许以风闻言事；上召询九卿等，清标奏曰：『言官奏事，原不禁其风闻。恐有藉称「风闻」挟私报怨者，是以定有「审问全虚处分」之例。宜如旧』。上是其言。二十一年，命九卿等议改「强盗不分首从皆斩」例，刑部尚书果斯海等议：「盗犯为从者免死」；清标与左都御史徐元文等谓「宜循旧例」，别为一议。上召询，清标奏曰：『法外施仁，原属至美之事。但强盗皆系凶恶，难分首、从；或罪果可矜，间行宽灭，应出自特恩。若预定一例，则将侥幸于不死而愈恣为盗』。上曰：『朕因每岁盗案处决甚多，究其所劫之物甚微；岂尽甘于为盗！或以饥寒所迫，深为可悯！故与尔等商之。今所言极是，当仍旧例；别思弭盗良法』。二十三年，命以户部尚书管兵部事。二十七年，授保和殿大学士。是年，湖北巡抚张汧贪婪事觉，清标曾保举为布政使，部议革职；得旨：降三级留任。
三十年，死。遗疏入，得旨：『梁清标简任机务，宣力有年，勤慎素着。忽闻溘逝，朕心深为轸恻』！下部议，赐祭葬如例。
所著有「蕉林文集」。
见原书卷七十九「贰臣传」（乙）。