最初的一个月，正好刮着强劲的西风，航行非常顺利。
不料，接着却遭遇到一场强劲可怕的大风暴，尼纳号几乎翻覆沉没，而且和宾达号失去了联络。
睡在床上的哥伦布突然被怒涛声惊醒，吊灯猛烈地摇晃，桌上的东西滑落满地。
在狂风怒吼、惊涛拍击声中，哥伦布听到瞭望楼上的船员在声嘶力竭地叫嚷，船身像荡秋千似的忽上忽下，哥伦布想从床上坐起身来，但立刻又被甩了回去。
经过一阵挣扎，好不容易扶着门框走出了船长室，然后握紧铁梯，欲跌还起身向上爬。
天空中繁星点点，海面上的巨浪像耸立着的岩石，风声、浪涛声以及船员们的惊呼声、嘶吼声交织成一片。
东北方连连出现闪电，哥伦布知道这是暴风来临的征兆。
这时候，一个巨浪袭来，哥伦布被淋得全身湿透，他用力甩了一下头，抹掉脸上的海水，镇静沉着地指挥着船员们。
浪涛像一座座的小山，一波又一波地袭来，好像不把船吞噬掉就不肯罢休的样子。布帆被狂风撕裂成碎片，发出令人战栗的噼啪声，桅杆被吹得沙沙作响，随时有折断的可能，船身更是像摇篮般，一下子被托向高空，一下子又沉向水底。
在这种情况下根本站立不住，船员们个个都把绳索捆在腰部，一端扣在桅杆上，这样万一落水的话可以被拖救上船。
哥伦布以信号灯和宾达号联络，叫他们不要远离本船，起先，还看得到对方的信号灯反应。可是，过了不久就失去了联系。
挨到天明，宾达号完全失去了踪影，现在只剩下尼纳号独自在怒涛中挣扎了。
天空中乌云密布，依然是狂风怒号，白浪滔天，丝毫没有平息的迹象，这真是一个天愁地惨的日子！
哥伦布心想：我不顾贵族、官员等人的反对，坚持信念要前来探险，承蒙女王的信赖，独排众议，她甚至把自己的珠宝变卖以供航海之用，这种知遇之恩一定要报答，没想到，在回航途中竟然遭遇到这场可怕的风暴，以眼前的情况判断，可能是凶多吉少了！
还有，留在岛上的40名部下，他们天天在盼望，万一我们船覆人亡，他们也就永远回不了故乡了！
我的重大使命是向东方传播基督福音，我要使西方和东方连接起来。如果我们遇难的话，这个联系工作就此中断，以后也就后继无人了！
想着，想着，不禁感慨万千，心酸不已。
哥伦布费尽气力，挣扎着回到船长室。他展开羊皮纸，准备写一封信呈给斐迪南国王和伊莎贝拉女王，报告此行的经过以及遇难的情形。
由于船身晃动得太厉害，墨水瓶滑来滑去，而且自己的双手发抖，哥伦布一只手扶着墨水瓶压住羊皮纸，一只手拿起羽毛笔，在极端困难的情况下，勉强写了一封字迹潦草的信函。在信函外面注明，任何人捡到这封信专程送到西班牙国王手里时，一定可以获得重赏。
哥伦布把它卷成一叠，用好几张涂蜡的布重叠着包扎起来后放进一个木桶并投进海里。
哥伦布做了这样的处理以后，心里也就踏实得多了，至于未来的情况，那就听天由命吧！于是，他又奋力地挣扎着爬到船舱里。
这时候，已过正午，红日逐渐西斜，船员们经过一天一夜的折腾早已筋疲力尽，脸色苍白，一个个东倒西歪地躺在那儿，被颠簸得滚来滚去，听候命运的安排。
时近黄昏，西方出现了晚霞，风势逐渐减弱，疯狂般的波涛也慢慢平息下来。
死里逃生的船员们在哥伦布的领导下，大声地祈祷、赞美、感谢神的恩典，使他们免于葬身鱼腹。
大伙儿饱餐一顿后，除了掌舵及瞭望人员外，全都酣然入梦。
1493年2月15日的清晨，瞭望人员突然大声叫喊：“陆地！陆地！”
这是亚速尔群岛中属于葡萄牙的圣玛利亚岛。
虽然陆地就在眼前，偏偏赶上顶头风无法前进，好不容易挨到第二天的傍晚才靠岸。
从船上看去，港口附近有教堂的尖顶出现，几位船员相约到教堂去礼拜祈祷，感谢这次遇险不死。
当他们祈祷完毕，走出教堂大门时，看到一位葡萄牙军官率领几个士兵站在那儿等着他们。
他们心中纳闷，深感诧异，只见那个军官走了过来问他们说：“你们是从哪儿来的？”
“我们是属于西班牙的哥伦布探险船队，在回国途中遭受暴风的袭击，被吹离航线而漂到这里的。”
军官一听是哥伦布的探险船队，马上板起脸孔问：“谁是哥伦布？”
“他在船上，没有上岸。”
“胡说！快从实招来！”
“真的在船上，我们都是他的部下。”
那个恶狠狠的军官考虑了一会儿，说：
“我先把你们扣留下来，叫哥伦布自己来出面交涉。”
于是，不由分说地把他们押走了。
原来，葡萄牙国王获悉哥伦布偷偷地出境，跑到西班牙，受到西班牙女王的援助组成探险船队去寻找新航路后，就下令给各岛总督，一旦发现哥伦布的船队立即把他抓起来，那样哥伦布寻到的财宝就是葡萄牙的了。
至于哥伦布呢，他本来打算为葡萄牙效力去发现新航路的，可是葡萄牙政府对他的建议不予重视，因此才怀着失望的心情转往西班牙去求助。
如今葡萄牙政府竟想不劳而获，坐享其成，这未免太卑鄙了！
当哥伦布在船上接到总督的通知后，怒不可遏，他回复使者说：“你回去告诉你们的总督，说当初是你们的政府不采取我的建议，我才转而求助于西班牙。如果你们不把我的部下释放，我就报告西班牙国王，他将会立刻派兵前来攻打你们，到时候你们可别后悔。”
岛上的总督被吓住了，只好乖乖地把那几名船员释放。
1493年2月24日清晨，尼纳号迎着朝阳，继续向东行驶，总算一路顺风，非常平稳。
不料，到了3月2日的傍晚，海上又刮起大风来了，已经破损不堪的小小尼纳号怎禁得起再一次的暴风袭击？大小帆篷，早已支离破碎，随时都有倾覆的危险。
一路上虽然不时出现山的影子，但是，果断的哥伦布严令不得靠岸，因为他知道那都是葡萄牙的属地，不能再冒险逗留。
这时候已近午夜，电光闪闪，分外恐怖，天空又降下一阵骤雨，处境更加危险。哥伦布指挥全船人员奋力拼搏，终于度过了漫漫长夜。
天亮以后，骤雨虽然停止，但是风势依然相当强劲，船员们实在疲惫不堪，无法再继续支撑下去了。
哥伦布知道前面就是葡萄牙的塔加斯港，到了这种地步，为了求生也只好冒险一试了。
3月4日，饱经苦难的尼纳号终于缓缓地驶进了葡属的塔加斯港。
这里似乎没有收到葡萄牙国王捉拿哥伦布的命令，他们对这一群脱险的人们寄予无限的同情和关怀，态度极为友善。
哥伦布一方面乘此机会把破碎的帆篷和船身略加修补，另一方面写了一封信函，派人火速地送交斐迪南国王和伊莎贝拉女王，让他们早日得知发现印度的经过。
善良的哥伦布仍然一心挂念着因暴风而失散的宾达号的安危。