冬瓜根结线虫病主要为害根部。在主根和侧根相连处，形成根结肿瘤，形状多为球形，有的呈团状，为害严重时形成一串，如串珠状。线虫侵染根部后，导致地上部生长萎缩，植株比其它健康植株矮小，叶片小，最后全株枯死。切割根部肿瘤，在一般放大镜下观察，能见到线虫。
线虫以卵或2龄幼虫随病株残根在土壤中越冬或越夏，借土壤、水流、农用机械等传播。地势高燥、疏松、透气的沙质土发病重。
防治冬瓜根结线虫病可采取以下措施：
（1）调节土壤pH，使其呈酸性或碱性，不能呈中性，创造不利于线虫发生的土壤环境条件。
（2）深翻土壤40厘米以上，使线虫暴露晒死。
（3）对线虫发病重的保护地，每年6～10月维持田间积水3个月以上，可有效防治线虫发生。
（4）药剂防治。每亩用10％福气多颗粒剂5千克，深翻土壤时用3千克，务必使其与土壤充分混匀。定植时用药剂2千克与100倍的干细土拌匀，2/3撤于穴底，1/3撤于穴表面。