当阿伯拉的孩子们四下躲藏的时候，海豹队员开始一个房间一个房间地清理主楼的第一层。尽管美国人曾经想过这栋楼里可能有圈套，但是已经杀到这里的海豹们则不这么认为。“你的警觉性无法保持这么久，”特种部队的军官说。“难道本?拉登每天晚上睡觉时都会想一下，半夜里他们会杀进来么？当然不会。也许只有头一两年会这样。但是现在则不大可能。”尽管这样，这栋楼的安全防范措施还是到位的。一道上了锁的金属门出现在通往二楼的楼梯口，这使得整个楼梯间就像是一个笼子。
在用C-4炸药炸开那扇门之后，三名海豹队员就冲上了楼梯。在上楼梯的过程中，他们遇到了本?拉登23岁的儿子，哈立德，他在墙角探了一下头。然后，他就拿着一支AK-47出现在了楼梯上方。哈立德穿着白色T恤，领口很松，短头发，胡须修剪过，他朝上楼的美国人射击。(有反恐官员称哈立德没有武器，但这并不能说明他就是没有威胁的。“你面对的是一个成年男性，时间是深夜，周围漆黑，在“基地”组织的房子里，下楼向你冲来——你只能假设他是一个有威胁的敌人。”)至少有两名海豹队员开枪射击，并且立即击毙了哈立德。根据发给海豹队员的小册子上的描述，这个院子里应该居住着至少5名成年男子。现在其中的三人已经被击毙；名单上的第四个，本·拉登的儿子哈姆扎，并没有在这栋房子里。楼房里的最后一个人就是本?拉登自己。
任务开始前，海豹队员用美洲土著部落的名称拟定了一个代表任务不同进度的暗语代码。每个暗语代码代表的是任务进行的一个阶段：比如离开贾拉拉巴德，进入巴基斯坦，接近的目标院落，等等。“吉罗尼莫”代表的就是找到了本·拉登。
三名海豹队员跨过哈立德的尸体，炸开了另一道金属门，那道金属门位于二楼到三楼的楼梯间。在黑暗中跃上楼梯转角后，他们开始搜索三楼的楼梯间。冲上三楼楼梯间后，最前面的海豹队员开始向右转；透过夜视镜，他看见了一个高个，四肢瘦长，胡子有一拳头长短的人正在打开卧室的门探头向外张望，两人的距离不过十英尺。这名海豹队员立刻意识到这个人就是“曲轴”。(有反恐官员说，海豹队员第一眼见到本?拉登是在楼梯间，并且朝他开了枪，但是没有击中。)
美国人迅速朝卧室的门冲了过去。最前面的海豹用力把门撞开。本?拉登的两个妻子出现在他的面前。阿迈勒?法塔赫是本?拉登的第五个妻子，她用阿拉伯语发出了尖叫声。她摆出的姿态像是要冲上来；这名海豹把瞄准线压了一下，朝她的小腿开了一枪。由于担心她们俩当中的一个或者两个都穿着自杀炸弹背心，他大步跨上前去，把她们两个抱在了一起，压倒在了一旁。他完全肯定当她们引爆时自己必死无疑，但是自己把她们抱住之后，爆炸的能量会被自己的身体吸收一部分，身后的两名海豹就有可能得救。最后，他幸运地发现这两个女人身上都没自杀炸弹背心。
第二名海豹冲进房间，M4步枪上的红外激光点指在了本?拉登的胸膛上。“基地”组织的首领，穿着棕褐色的伊斯兰长袍，头上戴着伊斯兰头巾，纹丝不动；他手里没有武器。9.11事件九年七个月二十天之后，一名美国人扣动了扳机，结束了本?拉登的性命。第一发5.56毫米口径的子弹，射入了本?拉登的胸膛。就在他向后倒下的过程中，开枪的海豹队员把第二枚子弹打进了他的额头，就在左眼上方不远处。他通过无线电报告说，“以上帝和国家的名义——吉罗尼莫，吉罗尼莫，吉罗尼莫。”暂停之后，他补充说，“吉罗尼莫E.K.I.A。”——“目标在行动中被击毙。”在白宫听到这句话之后，奥巴马撅起嘴唇，郑重其事地喃喃自语，“我们干掉他了。”
放开本?拉登的两位妻子之后，第一个冲进房间的海豹用塑料手铐把她们绑起来，带到了楼下。与此同时，他的两名战友，带着尼龙尸袋上了楼。他们用白布把本?拉登的尸身包裹起来，然后跪在本?拉登尸体两侧，把他放进袋内。此时距离海豹六队降落的时间差不多为18分钟。在接下来的20分钟里，任务的重点转移到了收集情报上。
四名海豹来到二楼，手里拿着塑料袋，收集闪存盘，光盘，DVD光盘，以及房间里计算机的硬件，二楼的这个房间曾经充当过本?拉登的临时摄影棚。在接下来的几周里，以中央情报局为首的专门小组审阅了这些收集到的文件，结果发现本?拉登对于“基地”组织运作活动的影响远远超出此前美国官员的想像。他一直在拟定暗杀奥巴马和彼得雷乌斯的计划，试图发动一场超过911的纪念袭击，并且攻击美国的列车。海豹们还找到了一堆的色情影碟。“我们总能在这些家伙呆的地方找到这样的东西，无论是索马里，伊拉克，还是阿富汗，”特种作战部队的军官说。本?拉登拍摄录影带时经常穿的带黄金线的长袍，就挂在临时摄影棚的隔帘后面。
楼房外面，美国人把妇女和儿童拉到了一起——每个人都用塑料手铐绑了起来——他们被要求背靠院墙坐下，正好面对着外面那架完好的黑鹰二号直升机。突击队里唯一一名能流利地讲阿拉伯语的海豹队员对他们进行了讯问。几乎所有的孩子都不到十岁。他们看上去并不了解房子主人的思想与追求，在他们的眼里他只不过是“一个老人”。没有一个女人站出来证明那个男人就是本?拉登，她们当中只有一个人称他为“酋长”。提供救援的支努干直升机最终抵达了，一名军医从上面下来后就跪倒在尸体旁边。他把一枚针管插入本?拉登的尸身，提取了两份骨髓样本。然后他用棉花棒收集了更多的DNA样本。一份骨髓样本被送到了黑鹰直升机上。另一份则被带到了支努干直升机上，和本?拉登的尸身放在一起。
接下来，海豹队员们要做的是销毁损坏的那架黑鹰直升机。那架直升机的飞行员取出专门为这种情况准备的铁锤，砸烂了仪表盘，电台，以及驾驶舱里其他的涉密设备。然后破拆小组上场了。他们把炸药布置在了航电、通讯、发动机、旋翼头等设备的附近。“你不是要隐瞒它是一架直升机的事实，”特种作战部队的军官说。“你只是要让它无法再使用。”海豹队员在机舱下面放了特别多的C-4炸药，然后朝直升机机身里丢了一枚铝热剂手雷，转身后退。就在破拆小组登上支努干直升机的时候，黑鹰一号腾起了一团大火。那些被留下给巴基斯坦政府处理的妇女和儿童，用迷惑、恐惧和震惊的目光看着海豹队员们登上直升机。阿迈勒，本?拉登的妻子，继续喋喋不休地说着什么。之后，一个巨大的火球从院墙上腾空而起，美国人的直升机就在火光中飞走了。
在白宫情况室，奥巴马说，“我要等到他们安全回来才会觉得是大功告成。”在经历了院子里的38分钟后，两支海豹突击队开始了返回阿富汗的长途飞行。黑鹰的燃料已经不多了，需要在靠近阿富汗与巴基斯坦边境的加油点跟接应的支努干会合——这个加油点还是在巴基斯坦境内。补充燃料的过程花了二十分钟。就在加油的过程中，拜登手里转着念珠，把头转向参谋长联席会议主席马伦。“今晚我们都应该去做弥撒，”他说。
凌晨3点左右，直升机降落在了贾拉拉巴德；麦克雷文和中央情报局在当地的主管站在停机坪边上迎接他们。两名海豹队员抬下尸袋并打开让麦克雷文和中央情报局官员亲眼目睹本?拉登的尸体。本?拉登的遗容被拍了照，然后是他的整个尸身。本?拉登被认为身高大约为六英尺四，但现场没有人有卷尺可以准确测量这具尸身的身高。因此，一名身高六英尺的海豹队员，并排躺在尸体边上：这具尸身确实比他要长出大约4英寸。几分钟后，麦克雷文出现在情况室的视频对话画面上，证实尸袋里装着的是本?拉登的尸身。这具尸体随即被送往巴格拉姆空军基地。
一直以来，海豹队员都想着把本?拉登的尸体丢进海里——这是一种终结本?拉登神话的直接方式。他们之前已经成功地这样做过一次。2009年9月海豹六队在索马里的直升机突袭行动中，他们干掉了萨利赫?阿里?萨利赫?纳罕，东非的“基地”组织领导人之一；纳罕的尸身被空运到了印度洋的一艘军舰上，在举行了必要的穆斯林仪式后，被扔到了海里。但是，就在要对本?拉登的尸身按照相同的程序处理前，约翰?布伦南打了一个电话。布伦南曾经担任过美国中央情报局驻利雅得站的站长，他把电话打给了沙特情报部门当时的合作合伙。布伦南把在阿伯塔巴德发生的事情向他说了，并告知他对本?拉登遗体的处理计划。布伦南知道，本?拉登的亲属现在在沙特王国仍然是一个很有地位的家族，他本人也曾经是一名沙特王国的公民。沙特政府是否会有兴趣拿回他的尸身？“你们的计划听起来是个不错的解决方式，”沙特方面这样回答。
天亮时分，本?拉登的尸身被送入一架V-22“鱼鹰”的机舱，同行的还有联合特种作战司令部的一名联络官和一队负责安全细节的宪兵。“鱼鹰”向南飞行，目的地是卡尔?文森号航空母舰的甲板——这艘一千英尺长的核动力航空母舰正航行在阿拉伯海上，距离巴基斯坦海岸不远。美国人又一次未经许可地飞越了巴基斯坦的领空。有官员担心，在单方面实施突袭阿伯塔巴德的行动给巴基斯坦带来刺痛之后，巴方可能会拦截这架“鱼鹰”。但是这架“鱼鹰”最终顺顺利利地降落在了卡尔?文森号的甲板上。
本·拉登的尸身被冲洗干净，用白色的葬袍包裹起来，加上了压重物，然后装入了一个袋子。联合特种作战司令部的联络官，护送尸身前来的宪兵，还有几名水兵把包裹起来的尸身放到了一个露天升降机上，把升降机下降到底部，即飞机机库的位置，从这个位置到海面大约有二十到二十五英尺，他们从这里把尸身送入了海里。