长期咽喉不适多是慢性咽炎的表现，目前治疗方法众多，根据病因进行有针对性的治疗，是有希望治愈的。但对于咽炎要一分为二的看待，那些有局部病因（比如鼻窦炎所致）或全身病因（比如糖尿病所致）的，要力求明确病因，对因治疗；没有（注意是没有而不是没找到）明确局部和全身病因的，引起咽炎的因素只能是存在于吸入的空气中和饮食中了，这样的咽炎是机体的保护反应，如果它引起了不适，可以对症治疗，也可以采用心理学手段干预而不必用药。
慢性咽炎西医一般注重局部用药，经常用复方硼砂溶液1：5000呋喃西林溶液或2%的硼酸液漱口，含漱时头微微后仰，张口鼓动液体发“啊啊啊”的音，使含漱液能清洁咽部后壁。也可坚持早晚用淡盐水漱口，漱口方法同上，漱口后可以喝一杯淡盐水，主要是对咽部杀菌、清洁和湿润，改善咽部环境，预防细菌感染，或者用2%碘甘油涂于咽壁。或用碘含片、度米芬、薄荷等含于口腔内等，都有一定缓解症状之功能。慢性咽炎一般不需要使用抗生素治疗，因为慢性咽炎并非细菌感染。但慢性咽炎极易反复发作，症状常发生在疲劳、受凉、烟酒过度、进食刺激性食物、气候突变及吸入寒冷空气后。除咽喉不适症状加重外，如果出现发热，检查常可见咽部黏膜急性充血、肿胀，血常规检查白细胞增高，中性粒细胞百分率增高。此时可在医生指导下使用广谱抗生素治疗，如红霉素成人每日0.75～2克，分3～4次，或螺旋霉素成人常用量1日6片（每片75万单位）分2～3次服用，或磺胺甲嗯唑0.8g，每12小时服用1次；或根据药敏试验选用敏感的抗生素治疗3～5天，急性症状消失后马上停药。同时，病人需休息，多饮水及进食流汁饮食。
中医学治疗本病着重于治本，按辨证分型法用药，疗效较好。一般用药为：阴虚火旺型者，用养阴清肺汤加味（麦冬、生地、玄参、白芍、甘草、生石膏、薄荷、川贝粉、丹皮、桑叶等）；痰阻血瘀型者，用消瘰丸加味（玄参，牡蛎、川贝、生地、麦冬、三棱、昆布、海藻等）；阴虚津枯型者，用生脉饮加味（白晒参、麦冬、五味子、石斛、玉竹、白茅根、竹茹等），每日一剂，频频润咽服之。局部对症治疗可以选用中成药，如利咽灵、草珊瑚含片、保安散、西瓜霜等，可同时配合泡茶饮：双花、麦冬、胖大海、生甘草各等份，开水冲泡频服。清咽饮：乌梅肉、生甘草、沙参、麦冬、桔梗、元参各50克，捣碎混匀，每日3次，每次服15克左右，以沸水冲饮。如果咽部的黏膜充血增厚，黏膜下结缔组织有增生，黏液腺肥大，分泌多，可以考虑激光治疗，症状严重的，激光治疗要分次进行；也可以用硝酸银、冷冻或离子治疗或电灼治疗。
此外，日常生活方式的改善是必不可少的。注意口腔卫生，坚持早晚及饭后刷牙，减少烟酒和粉尘刺激，纠正张口呼吸的不良习惯。应加强身体锻炼，增强体质，预防呼吸道感染，少用烟酒，积极治疗咽部周围器官的疾病。合理安排生活，保持心情舒畅，避免烦恼郁闷。保持室内合适的温度和湿度，空气新鲜。宜吃清淡、具有酸、甘味滋阴的一些食物，如水果、新鲜蔬菜、青果等。