9月7日上午，法军开始猛攻，战斗进行得异常激烈。法军先后发起7次冲击，都被俄军击退。在法军发起第八次冲击时，俄军统帅巴格拉季昂被炮火击中，被抬下战场。失去统帅指挥的俄军很快就抵不住法军的进攻了，逐渐退却。法军付出了巨大的代价才占领了博罗季诺。
经过10个多小时的激战，双方都损伤惨重，法军伤亡约2.8万人，俄军则达4万多人。博罗季诺战场上尸山血海，士兵和马匹的尸体堆积如山。这次战役也成为人类战争史上最为惨烈的一场恶战。拿破仑后来写道：
“在我一生的作战中，最令我心惊胆战的，莫过于莫斯科城下之战。”
拿破仑为法军的巨大损失唏嘘不已，但他也很兴奋，因为莫斯科就在眼前，克林姆林宫即将成为他的掌中之物了。
（四）
博罗季诺战役失利后，库图佐夫率领溃退的俄军来到莫斯科，并在莫斯科郊区召开军事会议。会上，库图佐夫宣布放弃莫斯科。
沙皇也很快就得知俄军不得不放弃莫斯科的消息了，这让他非常震惊和愤怒。莫斯科城人心惶惶，民众惊慌失措，纷纷逃命。莫斯科大撤退开始了，成千上万辆马车塞满了大路，车辆颠簸着缓慢行进。
库图佐夫派人告知拿破仑，要求在军队和民众撤出之前，双方暂停交火。拿破仑答应了他的请求，同时命令先头部队缪拉率军跟踪敌人，迫使俄军尽可能远离莫斯科。同时，他还下令莫斯科总督由迪罗斯内尔将军担任，带领足够的兵力随他进城，建立新秩序，占领公共建筑，并特别嘱咐要保护好克里姆林宫。
9月15日早晨6时，拿破仑到达护城河边，在那里下马等候俄国代表团前来欢迎他进入莫斯科城。但等了两个小时也没人来。拿破仑派人去打探消息，缪拉送来了报告：莫斯科城没有名流、贵族，也没有代表团，甚至连一个居民都没有了，它已成为一座空城。
没有俄国人的欢迎，拿破仑只好怅然地自己进驻了莫斯科。中午十分，拿破仑带着他的大军缓缓进城。莫斯科的街道异常安静，没有以前拿破仑攻占柏林、维也纳后所受到的热烈欢迎。除了法军，城里没有任何有生命的东西，连个人影也见不到。
拿破仑走在大军前面，径直向俄国沙皇亚历山大的宫殿——克里姆林宫前进。宫殿静悄悄的，拿破仑突然为这种安静和沉默感到窒息。他隐隐感到有些不安，似乎有不妙的事情要发生一样。
晚上8点，不妙的事情果然发生了：莫斯科城的中国区突然窜起火舌，熊熊大火很快就蔓延到市中心，整个莫斯科城都像一个巨大的火炉。
火势很快就窜到了克里姆林宫，拿破仑和士兵们一起参加救火的战斗，向房梁上泼水，眼红铁桶和扫帚扑火。
9月17日，持续了一天一夜的大火延伸到更为广阔的地区，法军进驻的北区和西区都已经燃烧起来，而且在风势的助推下，火势有增无减，豪华的剧场和大型建筑都笼罩在一片浓烟之中。火焰越过了克里姆林宫的城墙。
面对狂暴的火海，拿破仑面色苍白，他怎么也不相信，俄国人竟然会纵火烧毁他们的“圣城”。经过长时间的沉默，他不禁感叹道：
“多么可怕的景象！这是他们自己放的火！他们竟然有如此大的决心，这是怎样的人啊！这简直是一群野蛮人！”
克里姆林宫的大火已经无法征服，拿破仑被迫撤离莫斯科，将统帅部搬到城外数英里之遥的彼得罗夫斯克耶宫。
18日，老天帮了拿破仑一把，降下了一场大雨，大火被浇灭了，拿破仑再次回到克里姆林宫。在几天几夜的时间里，整个莫斯科城遭到了浩劫，四分之三的建筑——6000余幢的房屋被烧成灰烬，其中包括800多座教堂。
在这场大火后，拿破仑了解到俄国人战斗的决心有多么坚决。他决定诱使俄国提议停战媾和，尽快结束这场遥遥无期的可怕战争。
作为战争的获胜者，拿破仑要主动要求与战败国媾和，这还是第一次。
当时，法军的状况令人堪忧，由于后勤供应和补给跟不上，饥饿的队伍入城后到处抢掠，各种犯罪和暴行不断发生。尽管拿破仑多次严明军纪，但无济于事。
面对这一切，拿破仑的脾气变得异常暴躁，经常对周围的人大发雷霆，但有时又会在几个钟头里保持死寂一般的沉默。看得出，他的内心此刻忧虑重重，举棋不定。
拿破仑认为，现在最好的办法就是与亚历山大缔结和约，然后带着自己的军队体面地撤出俄国，而不是在莫斯科度过即将到来的寒冬。可是，亚历山大却杳无音讯。拿破仑为此整日坐立不安，他开始想方设法将自己和平的意愿传递给沙皇亚历山大。
终于，拿破仑找到了一位合适的传话人选，他就是莫斯科教养院院长图托尔明先生。他是俄国皇后慈善机关的负责人，与皇家有所挂钩。
拿破仑召见了图托尔明，向他反复强调，此次战役完全是处于政治目的，绝非因为个人野心。他叮嘱图托尔明，他现在的主要目的是以最快的速度获得和平。
彼得堡很快就收到了拿破仑的媾和建议，沙皇兴奋不已，他说：
“看吧，拿破仑已经山穷水尽了。不过，我们是决不会与他和谈的，这场战争不是他死，就是我亡！”
俄国宫廷以沉默的方式答复了拿破仑，这让拿破仑震惊了。他本以为已经战败的俄国会抓紧这个机会答应休战，可俄国人没有这样做。拿破仑一向习惯在被征服者的国家下达命令，但这次他的命令失败了。他觉得骑虎难下，并说道：
“我们占领了我国的‘圣城’，如果不签订一个和约离开这里，我们就会被看做是失败的。整个欧洲都在看着法国，没有和平协议，后果不堪设想。”
此后，拿破仑又几次派使者将自己要求媾和的愿望传达给沙皇，但沙皇亚历山大态度强硬如铁，始终不给拿破仑答复。拿破仑日益焦虑，他要面临的麻烦也接踵而至。
（五）
1812年10月13日，莫斯科降下了入冬以来的第一场大雪。望着纷纷扬扬的漫天大雪，拿破仑面色阴郁。不久，他就召开了军事会议。会上，将领们意见不一，有的主张进攻彼得堡，也有主张坚守莫斯科，等明年天气回暖再与俄交战。
拿破仑权衡再三，觉得以目前法军和俄军的状况，一旦发起激战，法军极难取胜。如果继续固守莫斯科，法军只会面临更加艰难的处境。
最后拿破仑下定决心，撤出莫斯科，一向无往不胜的法军铩羽而归。
10月19日，在占领了莫斯科36天后，拿破仑率领法军浩浩荡荡地开出莫斯科城。拿破仑下令由莫蒂埃元帅带领7000人断后，并于23日炮轰克里姆林宫，但莫蒂埃未执行拿破仑炸宫的命令。
此时的法军有近11万人，他们排成八路纵队在大道上行径，后面还跟着长长的几万辆装有战利品和大炮的马车。
拿破仑计划率军经南线的斯摩棱斯克返回，希望能在卢卡加打败库图佐夫，并借此为此次大规模撤退扫清道路。
但拿破仑的计划被俄国人猜到了，他们法军撤退的路上予以截击。10月23日，法军抵达波洛夫斯克。库图佐夫获悉后，立即将主力调到距离波洛夫斯克不远的莫洛亚罗斯拉韦茨，准备截击法军。
24日拂晓，两军前卫在莫洛亚罗斯拉韦茨展开一场血战。战斗整整持续了一天，双方损失都极为惨重。最后，俄军撤出了阵地。
10月25日，拿破仑在例行视察中险些被敌人擒获，多亏副官的保护才脱险。拿破仑非常生气，他决定改变原计划的撤退路线，停止向卢卡加进军，转而经奥什科夫到莫扎茨克。结果，这支庞大的队伍又改变方向，艰难撤退。
一路上，法军每天都会遭受哥萨克骑兵的袭扰，他们对每一个掉队者都不留情。法军被迫放弃许多伤员，就连满载有战利品的运输车也甩掉了。11月初，内伊奉命指挥后卫，其本部仅剩6000人了。
由于库图佐夫穷追不舍，11月3日，两军在维亚泽玛又恶战一场，法军又伤亡5000余人。
11月5日，天降大雪，这更加剧了撤退的艰难。法军没有像俄军那样，在马蹄上加上钉防滑钉，以致战马在穿越冰冻的江河湖沼时常常滑倒，马腿也不断摔断。
11月9日，拿破仑终于到达斯摩棱斯克，大军团残部到13日也相继汇集那里。此时，法军的生还者仅剩5万人，骑兵所剩战马无几。斯摩棱斯克本是法军交通线上的一个主要兵站，但此时存粮也已消耗殆尽，以致全军找不到任何可吃的东西。
11月14日，拿破仑率部离开斯摩棱斯克，但法军的情况愈加糟糕，许多人跌倒后便再也无力爬起来，以致活活被冻死。马匹大量死亡，骑兵不得不下来步行，最后大炮也不得不纷纷丢弃。到了夜间，天气异常寒冷，越来越多的士兵和马匹被冻死。在广袤的俄罗斯土地上，法军的尸体成堆成堆地暴露在外，被狼群啃咬着，被乌鸦啄食着。一位上校感慨道：
“这简直就是一个巨大的坟场！”
11月16日，欧仁的前卫在克拉斯诺被库佐里夫所阻。拿破仑到达后，将近卫军和达武军拉上去，才将俄军击退。同时，内伊的后卫部队也被俄军切断，经过一番激战，部队中的6000人仅剩800人冲出了重围。
现在，拿破仑的大军团正在面临着极其严峻的考验。本来拿破仑是想退往明斯克，然而当得知此地已被俄国海军上将奇恰戈夫占领后，他只能取道北面的一条线路退往维尔纳。在这条退路上，有一条列津纳河。法军要从俄国撤退，就必须渡过该河。然而此时，俄军已经抢占了河上的桥梁。
情势十分危急，许多人都开始绝望了，而拿破仑却很冷静。命运越是掐紧他的喉咙，他就越是强烈地反抗。拿破仑迅速下达命令：在部队的掩护之下，架桥过河。
11月25日晚，法军冒着严寒终于在列津纳河上建起了两座高架桥。然而当部队正在过桥时，俄军忽然从三面杀来，由于运输车辆引起混乱，桥上挤得水泄不通，法军又受了惨重损失，2.5万人在此伤亡。
12月3日，拿破仑抵达摩洛迪和诺，在这里收到了14封来自巴黎的信件。在阅读这些信件后，他决定将大军的指挥权交给缪拉，同时嘱咐元帅们不要将他离开的消息公诸于众，免得影响士气。
12月6日，拿破仑坐上雪橇秘密返回巴黎。
此次远征俄国，法军损失了近40万大军，1000门大炮，18万匹军马，以彻底失败告终。对于这次惨败，拿破仑慨叹道：
“从伟大崇高到荒谬可笑，其间只差一步。”