清理车间的麦仓、麦柜有保证正常生产、稳定流量以及进行润麦和小麦搭配的作用。毛麦仓可设于头道麦筛之前或之后。如果小麦已经过筒仓工作塔初步清理，而毛麦仓的数量又较多，则设在头道筛之前为宜，以保证小麦流量均匀并作小麦搭配用。否则，可将毛麦仓设于头道筛之后，使小麦经过头道清理后入仓，避免仓口阻塞。
毛麦仓的容量根据原料库的供料情况、加工工序的工作时间以及在毛麦仓是否进行搭配等因素来决定。在条件较好的大中型厂，其仓容量可供生产40～72小时用。
润麦仓的容量随粉间生产能力与润麦时间的长短而定。为适应加工原料的品质变化，润麦时间一般考虑为24小时。当加工硬麦时，润麦时间可增加到30～36小时。
为了保证粉间流量的均匀和稳定，在1皮磨之前，设有净麦仓。净麦仓容量为30～50分钟的生产量。如果小麦入磨前采用喷雾着水，则净麦仓还有润麦的作用。