面粉后处理的工艺可分为两类，一类是将配粉仓与面粉散存仓合二为一，它的优点是配粉仓兼作面粉散存仓，节省投资和动耗；缺点是由于配粉仓不能充分利用楼层空间，仓容受到限制。另一类是分别设立配粉仓和面粉散存仓的工艺流程，面粉散存仓的仓容较大，可以暂时贮存一定数量的面粉，缓解销售的压力，同时还设有倒仓功能，防止面粉结块，散存仓的面粉可以直接打包也可以入配粉仓进行配粉；其缺点是提升的道数较多，动耗较大。
面粉后处理工艺的流程一般为：面粉检查→自动秤→磁选器→杀虫机→面粉散存仓→配粉仓→批量秤→混合机→打包仓→打包机。