反流性胃肠道疾病指反流性胃底炎（RE），是胃十二指肠内容物反流入食管，造成食管黏膜的炎症，我国发病率为5.6%～7.8%；男女比例为2：3.包括胆汁反流、十二指肠内容物胆汁、胰酶及碱性内容物反流入胃（DGR）。大量动物实验和临床观察证明，胆汁和十二指肠内容物反流入胃引起胃炎，并发现胃炎的范围和严重性与胆汁浓度有线性关系，并与反流物成分有关。此外，十二指肠液反其道而行之有以下因素：胆汁在碱性介结中，特别在缺血条件下对胃黏膜损害加重；胆汁加胰液和含有溶血卵磷脂的十二肠液对胃黏膜的破坏作用最大；胃溃疡患者，胃内胆汁较高者，胃肠吸引液中革兰氏阴性霉氧菌的生长增多；胃排空迟缓，延长了胆汁和胃黏膜的接触时间。
不论何种反流，胆汁是主要的致病因素，因此，使胆汁回归常道是治本之法。《黄帝内经》中说：“善呕、呕有苦，邪在胆，逆在胃，胆液泄则口苦，胃气逆则呕苦，故曰呕胆。”《沈氏尊生方》云：“胃痛，邪干胃脘也，唯肝气相乘为尤甚，以木性暴，且正克也。”《医话拾零》说得更加明确：“西人谓：胆汁渗入十二指肠，能助小肠消化食物。此理《内经》未尝言之，似为中医疏忽之处，不知后世名医曾言之矣。”吴鞠通《医医病书》曰：“胆无出路，借小肠以为出路。”此非谓胆汁能入小肠乎？至于胆汁能化食之说，中医书中亦早寓其理。《神农本草经》之论柴胡也，谓“能去肠胃中结气、饮食积聚、寒热邪气，推陈致新”。夫柴胡为少阳胆经之主药，而其功效多见于肠胃者，为其善理肝胆，使胆汁流通无滞，自能入于肠中消化食物积聚，以成推陈致新之功也。至于徐灵胎注《神农本草经》则以“木能疏土”解之，是谓肝胆属木，脾胃属土。徐氏既云“木能疏土”，是明谓肝胆能助肠胃化食，而胆汁能助小肠化食之理，即在其中矣。如果木郁肝气犯土，邪在胆，或“胆胃上逆”，所以胆汁是产生胆汁反流入胃的主要原因。其病机主要是太阳、阳明合病，腑气不通，肝胆郁热犯逆脾胃，使脾胃升降失常，随胃气上逆，虽表现于胃，实在肝胆与肠腑之气不通，所以治本之法，应为疏利肝胆，通腑泻浊，使胆汁回归于肠，方为正治之法。历代医家虽然创立了众多疗法，但都与本病的病机不相吻合，笔者认为大柴胡汤当为首选之方，方中柴胡、黄芩疏利肝胆，半夏、生姜降逆止呕，枳实行气下气，大黄通腑泻下，使胆汁归流于肠，诸药共用，腑气通畅，胃气增强，反流消失，胃与食道免受胆汁之害，自然恢复正常。《得心集医案》曰：“记读《灵枢·经脉篇》云，足厥阴所生病也，胸满，呕逆。又仲景云，厥阴之为病，消渴，气上撞心，心中疼热，饥不欲食。故见嘈杂焦躁等症。知肝气横逆，郁火内燔，仿仲景治胸中懊恼例，用栀子、淡豆豉汤以泄郁火，参入叶天士宣络降气之法，以制肝逆。”