将母种的菌丝块转移到木屑、棉籽壳、麦粒等配制好的玻璃瓶培养料上制成的菌种称为原种。
金针菇生产上常用的原种培养料有以下几种：
（1）棉籽壳、麸皮（米糠）培养料。
配方：棉籽壳78％，麸皮（米糠）20％，石膏1％，糖1％。棉籽壳和麸皮（米糠）要新鲜、无霉变、无虫蛀，配制前棉籽壳最好经太阳晒1～2天。
配制方法：先将棉籽壳预湿透，再加入麸皮（米糠）、石膏和糖水，不断搅拌均匀。
（2）木屑、麸皮（米糠）培养料。
配方：木屑78％，麸皮（米糠）20％，石膏1％，糖1％。木屑最好放在室外雨淋日晒软化后再用，麸皮、米糠要新鲜、无霉变、无虫害。
配制方法：先将糖水溶于水中，再拌入料内，然后加水将料搅拌均匀。
（3）棉籽壳、木屑、麸皮（米糠）、玉米粉培养料。
配方：棉籽壳35％，木屑35％，麸皮（米糠）23％，玉米粉5％，石膏1％，糖1％。
配制方法：先将棉籽壳预湿，然后把木屑、麸皮、玉米粉、石膏、糖水混入搅拌均匀。
以上配方含水量以68％～70％为宜。
（4）麦粒培养料（基）。
配方：小麦（大麦）100千克，碳酸钙0．5千克，石膏1．5千克。
配制方法：选择饱满、无破损的麦粒，用水冲洗，把瘪粒捞出。浸12小时，待麦粒吸足水分，捞起清水洗净放入锅内煮熟，以煮熟而粒不破肚为宜。捞出后沥去多余的水分，摊开晾干后加入碳酸钙和石膏，拌匀，分装瓶内（装瓶量为瓶的1／3～1／2）。