原种转接到培养料上进行扩大培养，生长出的菌种即为栽培种。
栽培种的容器有罐头瓶、原种瓶、塑料瓶以及塑料袋等。由于国内大多是分散小规模栽培方式，没有统一的规格，有的用原种瓶栽培，由于瓶口小，菇蕾不能充分从瓶口长出，从而影响了产量。根据试验，以原种瓶栽培第一潮菇仅收到75～100克／瓶，第二潮菇几乎没有。同时，无论采用哪一种瓶，当子实体长到2～3厘米时均要套袋（筒），费工费时。
目前国内多采用塑料袋作栽培种，效果很好。其优点是袋口直径大，菇蕾能大量发生，加上通气性好，长出的菇整齐，产量高。同时，塑料袋上端既能保湿又能遮光，省掉了瓶栽套袋（筒）的工序，而且管理简便。但使用塑料袋栽培，由于塑料袋遇硬、尖物易损坏，造成污染率要比使用瓶栽的高10％左右。