（1）种苗生产落后仍然是制约黄鳝发展的主要因素。种苗是生产的基础，黄鳝养殖的快速发展与种苗供应严重不足的矛盾更加突出。
（2）天然黄鳝资源亟待保护。近年来的养鳝种苗主要依赖天然的捕捉，这使黄鳝资源受到很大的破坏。
（3）黄鳝的疾病成为制约生产发展的重要环节。随着养鳝集约化的发展，鳝病越来越多，据资料，目前各类鳝病已有近30种之多。
（4）配合饲料研制相当滞后。由于黄鳝特殊的食性，仅靠鲜活生物饵料不能满足规模化生产的需要。投喂配合饲料是大势所趋，然而，目前尚未研制出全价的黄鳝配合饲料。
（5）集约化养殖程度有待提高。我国目前的集约化养鳝单产为10～20千克/平方米，而日本、新加坡等国开发的立体集约化养鳝，不仅集约化程度高，而且单层产量达50千克/平方米。