在发动机大修之前，应认真检查所要更换配件的产品质量，不能错误地认为“新配件就是好件”。所换的配件一定要用量具逐个仔细地检查。更不能安装从市场上购来的“三无产品”。对有些部件一时拿不准时，可以与原车的旧件作对比性的测量，以确认其产品质量。
对电器元件，不能只采用仪表测量电阻值的方法来确定其产品质量，有条件时可以将它安装在同型号的摩托车上，作实际性能检测试验，以确认其性能的好坏。
发动机大修时应认真清洗拆下来的每一个部件，边清洗边检查，发现有问题的零件应作多次检查，实在需要更换新件时再更换。有些部件如果可以修理，应予以修理。修理后经检查合格再使用。发动机曲轴箱变形较严重、有裂纹、砂眼，曲轴箱轴承孔变形等问题的，应更换曲轴箱总成（不要只更换单面曲轴箱，有条件应更换左右曲轴箱总成）。
发动机曲轴总成的安装应采用热装工艺，以确保安装的质量。曲轴总成安装到位后，连杆应在发动机缸体的圆心。在不装活塞、缸体的情况下，用手轻轻转动曲轴，曲轴转起来应非常轻、很灵活、有惯性。
发动机的缸体、活塞、活塞环之间的配合间隙相当重要，一定要检查活塞环质量，简单的方法是：将其放入缸体内检查它的开口间隙，一般开口间隙应在0.10毫米以内。
检查活塞的简单方法是：
（1）在缸体内涂抹上少量机油，将活塞倒立放入缸体中，活塞慢慢的下落到缸体底部。活塞下落速度过快、过慢都说明活塞与缸体之间的配合间隙有问题。
（2）将活塞环安装在活塞上，在缸体内涂上机油并装入活塞，用旋具柄敲活塞顶（力量要轻），轻轻地敲一下，活塞能移动约3毫米距离。配合间隙太紧（用力较大活塞才能移动）、太松（敲了两三下活塞就下到底），都说明配合间隙不合适，应重新更换缸体或活塞、活塞环。
发动机的缸盖垫、缸体垫均为一次性使用件，不要重复使用多次。缸盖垫、缸体垫的厚度应以原车件为准，任何情况下都不能随意地增、减它们的厚度，否则会使发动机的压缩比发生变化，影响摩托车发动机的动力性能。
发动机组装完成后，不要急于起动发动机试车，要再作一次全面检查，然后用手转动磁电机转子，检查发动机是否有卡阻现象，并排掉机油泵中的空气，给变速器中加机油后，再起动发动机试车。