现在开始，弗洛伊德正领导一群人数日增的支持者，有时迂回而行，有时勇往直前，虽然横遭险阻，但是永远矢志不移地追求着理想。
弗洛伊德在1905年他的三本出版的书中，以不同的方式向理想迈进着。第一本书是《智巧的尝试》，书中所叙述的正如标题注明的是“智慧及其与潜意识的关系”。这本书和《日常生活的精神病理学》一样，阐释日常生活和潜意识的关系，使精神分析的学理易为一般人所接受。第二本是《少女杜拉的故事》，此书刚完稿时，因为怕被人指责为草率，所以一直没有出版。它与梦的分析有关。第三本是《性学三论》，在这本书里面弗洛伊德早先研究的神经官能症得以开花结果，叙述了“幼儿性欲”的逻辑理论，同时完成了他以后一辈子被人痛击的信念的主要结构。
在此大约五年以前，弗洛伊德为一个名为“杜拉”的十八岁少女作精神分析，她在十一周后就不再接受治疗了。1901年元月，他完成了杜拉的病例报告，于25日写信给弗莱斯说：“那是一个歇斯底里症的分析片断，分析环绕着两个梦而成，因此，它是《梦的解析》一书的延续。它也包括歇斯底里症状的解答。”他还说这篇文章已经被几位编辑接受了。但是他们老是改变主意。
事情发生于1900年10月，一位富商（他曾是弗洛伊德的病人）把他的女儿杜拉带到柏格街19号。杜拉的病情是呼吸急促、咳嗽不停，而且时常昏厥。在她来维也纳以前，曾经写过自杀的留条，但是她的父亲并不怎么在意。这所有的症状被认为是神经官能症的症状，而在弗洛伊德抽丝剥茧的追问下，发病的原因已显明了。原因太多，使这个病例读起来像小说，而不像是真实的故事。
杜拉的父母婚姻不美满，是另一对怨偶（弗洛伊德称他们为K先生和K太太）的好朋友。K太太后来成为杜拉父亲的情妇，K先生想要诱奸杜拉，却没有成功。K太太和杜拉之间，有恩斯特·钟士所说的“一种温暖，却不涉及肉欲的同性恋关系”。不仅如此，虽然杜拉严拒K先生，但她对K先生、父亲以及K太太，都有压抑的性欲。
弗洛伊德解释杜拉的两个梦而揭露了性动机的复杂迷宫，这是杜拉自己都不曾察觉的。但是她在十一周后结束了分析，表面上是要使弗洛伊德难堪，但极可能是抗议他所告诉她的事情。弗洛伊德相信神经官能症的产生与“性”有关，并以此理论来解决杜拉的问题。他于1905年出版的《性学三论》中对这个见解有更详细的阐述。
《性学三论》是一本仅有八十六页的书，书中贯穿了他从1880年以来的各种发现，是一种严谨的“性发展”理论。三篇论文讨论的是：“性的神经错乱”、“幼儿性欲”和“青春期的转换”。弗洛伊德不动感情的讨论态度以及它的主题，都使当时的人感到受到了冒犯。
弗洛伊德认为，幼儿的性欲有三种连续的类型。最初是“口腔活动期”，快乐源于从母亲的乳房摄吸奶汁；接着是“肛门活动期”，由于抑制住粪便而产生快感；第三是“阳物崇拜时期”，呈现出“恋母情结”的乱伦幻想。然后进入潜伏期，一直到青春期。弗洛伊德在《性学三论》里没有清楚地把这三种不同的活动划分开来，后来他估计，肛门阶段大约始于两岁。而性器阶段要迟一两年才会发生。
弗洛伊德后来从两方面来演绎性本能发展的理论：第一，他主张这些不同形式的性冲动的满足与表达，抑制和升华，都支配着成年人的性格。第二，他主张，任何一阶段的被抑制和以后的精神失调有关系。譬如说，在口腔阶段早期的被抑制，与提早衰老性痴呆症有关；口腔阶段后期的被抑制，与忧郁症有关。肛门阶段早期受抑制则会造成偏执狂，肛门阶段后期受压抑会引起分神精神病，而性器崇拜阶段的失调，则引起歇斯底里症。
这些理论的命运各有不同。许多证据似乎支持幼儿性欲的三分法，以及被压抑的冲动与精神失调有关的假设。比较无法证实的是，早年本能的满足、压抑和升华都会影响成年人的性格。弗洛伊德的《性学三论》在某些地区受到欢迎。在英国，《英国医学杂志》几乎用了一页的篇幅来赞扬弗洛伊德，并宣称：“当然，如果你对作者的睿智、勇气和追求真理的无止境耐心没有深切的认识，你是不能读这些论文的。读了它们后，就不会再怀疑，为什么我们需要对逐渐揭开的性生活有全部的知识和更谨慎的引导。”
从1905年年底开始，尽管弗洛伊德受到许多人的指责，但他的名声也正逐渐地提高。不久，他在英国、美国和瑞士又有了一小群支持者。
在英国，拥护者以恩斯特·钟士为中心，他是二十六岁的威尔士人，在伦敦大学附属医院工作。他身材瘦小，脸部轮廓很深，只有下西洋棋和花式溜冰这两种嗜好。钟士的工作能力极高，而且一直忠诚不移地支持精神分析。1905年他读到一篇介绍弗洛伊德理论的论文，从此知道了精神分析，并因此开始学德文，希望能阅读弗洛伊德的原文。