在这种方式下货物是以整箱方式交接的。装拆箱及运输两端集装箱堆场以外的费用是由发货人和收货人自己完成的，承运人负责运输两端集装箱堆场到堆场之间的一切费用。这种情况下的运费包括：装船港码头堆场服务费、装船费、海上运费及附加费、卸船费、卸货港码头堆场服务费、集装箱使用费等。
2．场到站（CY－CFS）
在这种方式下货物是以整箱方式交，拆箱方式接的。此时的运费包括：装船港码头堆场服务费、装船费、海上运费及附加费、卸船费、卸货港码头堆场服务费、拆箱服务费、集装箱使用费等。
3．站到站（CFS－CFS）
在这种方式下货物是以拼箱方式交，拆箱方式接的。此时的运费包括：装船港码头的装箱服务费、堆场服务费、装船费、海上运费及附加费、卸船费、卸货港码头堆场服务费、拆箱服务费、集装箱使用费等。
二．集装箱运费的计算方法
（一）拼箱货海运运费计算方法
集装箱运输的拼箱货运费的计算，基本上是按照杂货运费的计算标准来进行。其基本运费公式为：
拼箱货物海运运费＝基本运费＋各项附加费＝基本运价×计费吨＋各项附加费
该公式中，基本运价根据不同航线的运价率确定，计费吨和附加费按照运价本规定的计费标准确定。关于计费吨的选取通常采用重量吨（W）、尺码吨（M）、重量或尺码择大（W/M）、从价费率（Ad．val）几种形式。拼箱货也有起码运费，并按照提单所记载的货物收取。另外，在拼箱货海运运费中还要加收与集装箱有关的费用，如拼箱服务费等。由于拼箱货涉及到不同的收货人，因而拼箱货不能接受发货人提出的有关选港或变更目的港的要求，因此在拼箱货海运运费中没有选港附加费和变更目的港附加费。
（二）整箱货海运运费计算方法
对于整箱托运的集装箱货物来说，其运费的收取主要有两种方式：一是同拼箱货一样，按实际运费吨计费；二是根据集装箱的类型按箱收取运费，这是目前普遍采用的方法。当然在托运人委托承运人装货的情况下，承运人还要向托运人收取有关装货、理货和装箱的费用。下面主要介绍有关集装箱整箱运输中按照不同箱型计费时的主要方式。
1．统一费率
统一费率（Freight for All Kinds Rates，FAK）是指对相同集装箱内的所有货物收取统一的运价。它的基本原则是集装箱内装运什么货物与应收的运费无关。即所有相同航程的货物征收相同的费率，而不管其价值如何。它实际上是承运人将预计的总成本分摊到每个所要运送的集装箱上所得出的基本的平均费率。在采用FAK方式的航线上，一般对普通货物不分类，而对特殊货物进行以下分类：一般化工品、半危险品、全危险品和冷藏货物。这种运费形式是最常用的基本运费方式，因为船舶装运的以及在港口装卸的集装箱所占用的容积是相同的。但是，采用这种运价形式会对低价值商品的运输产生不利影响，因为运输低价整箱货物要支付与运输贵重整箱货物相同的费用。因此船公司为了公平起见，一般将货物分为5－7个费率等级收取不同的统一费率。
2．包箱费率
包箱费率（Commodity Box Rates，CBR），或称货物包箱费率，这种费率形式是按不同的商品和不同的箱型，规定了不同的包箱费率，即将各项费率的计算单位由计费吨简化为按箱收取。包箱费率的确定按照不同货物的等级制定，等级的划分与杂货运输的等级分类相同，也分为20级。这20级的集装箱货物费率可以分为4组：1－7级、8－10级、11－15级和16－20级；或分为3组：1－8级、10－11级以及12－20级。
3．运量折扣费率
运量折扣费率（Time-volume Rates，又称Time-volume Contracts，TVC）是船公司根据托运人托运货物的数量而给予托运人的一定费率折扣。这种方式对托运人来说，其所托运货物的数量越大，所支付的运费就越低。这种费率既可以是统一费率，也可以是某一特定商品的等级费率。
三．最低运费与最高运费
在集装箱运输过程中，由于集装箱货物既可以交集装箱货运站装箱，也可以由发货人自行装箱后整箱托运，因此在运费计算方式上也有所不同。主要表现在当集装箱货物是整箱托运并且使用承运人的集装箱时，集装箱海运运费有最低运费和最高运费两种形式。
（一）最低运费的计算方法
船公司在收取集装箱海运运费时通常只计算箱内所装货物的吨数，而不对集装箱自身的重量或体积进行收费，但是对集装箱箱内货物的装载吨数有一个最低要求，即最低装载吨。当集装箱内货物的重量达不到最低装载吨的标准时，按照最低装载吨所确定的运费收取。最低装载吨可以是重量吨或体积吨，也可以是占集装箱装载能力（载重或容积）的一个百分比。以重量吨或体积吨表示的最低装载吨数通常是依集装箱的类型和尺寸的不同而不同，但在有些情况下也可以是相同的。而当以集装箱装载能力的一定比例确定最低装载吨时，该比例对于集装箱的载重能力和容积能力通常都是一样的。
规定集装箱最低运费的主要目的是：若所装货物的吨数（重量或体积）没有达到规定的要求，则按该最低运费相应的计费吨计算运费，以此来确保承运人的利益。因此在确定集装箱的最低运费时，通常要包括托盘的重量或体积。最低运费的大小主要取决于集装箱的类型、尺寸和船公司的具体规定。
（二）最高运费的计算方法
集装箱最高运费指当集装箱内所载货物的体积吨超过集装箱规定的容积装载能力（集装箱内容积）时，运费按规定的集装箱内容积收取；即超出部分免收运费。对于集装箱箱内货物的费率标准，一般有以下两种方式：当箱内货物的费率等级只有一种时，则按该费率收取；当箱内装有不同等级的货物时，一种做法是箱内所有货物均按箱内最高费率等级货物所适用的费率计算运费，另一种做法是按费率高低从高费率起往低费率计算，直至货物的总体积吨与规定的集装箱内容积相等为止。若发货人没有根据承运人的要求，详细提供箱内所装货物的情况或相关资料，运费则按集装箱内容积收取；而且，费率按箱内装货物所适用的最高费率计。如果箱内部分货物没有申报数量，则未申报部分货物的运费按集装箱内容积与已申报货物运费吨之差收取。
规定集装箱最高运费的目的主要是鼓励发货人最大限度地利用集装箱的内容积来装运货物。为此，在集装箱海运运费的计算中，船公司通常都为各种规格和类型的集装箱规定了一个按集装箱内容积折算的最高运费吨，例如，20英尺集装箱的最高运费吨为31立方米，而40英尺集装箱的最高运费吨为67立方米。最高利用率之所以用体积吨而不用重量吨为计算单位，是因为每一集装箱都有其最大载重量，在运输中超重是不允许的。因此，在正常情况下，不应出现超重的集装箱。
（三）亏箱运费的计算方法