清朝对太监的管理相对规范，也更加严格。清初顺治帝便颁布了严禁太监干政的铁牌三块，分别立在交泰殿、内务府和刑慎司。清代较好地实行这个规定，没有出现以往各朝太监干政，搅得昏天黑地的情况。这得益于清政权的统治者对历史经验的总结和对太监本质的认识。康熙帝曾对太监有过如下评价："朕观古来太监良善者少……太监原属阴类，其心理与常人不同。有年已衰老而言动若婴儿，外似谨厚中实叵测。必人主精明，此辈始无由弄权……朕从不用便捷伶俐、言语不谨、奸诈之太监。"为此，对太监工作的各个部门都制定了严格的规矩，从摔了东西、吵架、睡觉误更、大声喧哗，直到偷东西、逃跑、自杀等各种情况，事无巨细都制定了详细的处罚条例。即便如此，宫中仍会发生各种状况，持刀行凶者有之，酗酒者有之，放炮竹者有之，肆口漫骂者有之，盗毁金册者有之，甚而"骗讹嫖赌、贪忍无耻者"亦有之。这些犯了罪的太监都会受到严厉的惩处。乾隆初年曾有太监（张玉）偷盗养心殿内银两，惹怒了乾隆。他下令"将张玉带至瓮山，着彼处圈禁之太监观看，即行杖毙"。也是乾隆年间，太监杨茂利用父亲病逝的机会交通外官。乾隆下令："着将杨茂交内务府总管，用九条锁锁着发瓮山铡草。"还有一太监高从云，"稍干涉外事，高宗遵世祖旨立时砍死"。
对太监的身后事，清廷给与一定关照。雍正早间曾在北京城西郊赐了一块地，给太监作墓地使用，位置在阜成门外八里庄西。墓地中间修关帝庙，庙名恩济寺，庙前立碑记述雍正赐地的经过。嘉庆四年（1799）前后，又赐了一些地作墓地使用。恩济庄墓地归内务府管理，清末时还有二千六七百个太监坟头。每年清明会雇人添土整地、种树，管理得有条有理。清末大太监李莲英死了以后就埋在恩济庄，其墓地前当时有一座拱桥，桥北为石牌坊，牌坊横眉刻着"钦赐李大总管之墓"几个大字。牌坊以北为神道，神道两侧有祭亭。东侧又立石碑，刻着李莲英的生平。神道尽头便是李莲英的坟墓，墓侧为"李公祠"。