李品仙、何键、刘兴、周斓、叶琪、彭振国等将领在唐生智下野之后，马上致电南京政府，请求息兵言和。他们在电文中称唐生智“不忍自相残杀，一再饬属退让，冀留合作余地，免深党军分裂之痕”，劝南京方面勿再进逼，否则师出无名。紧接着，经何键、李品仙与程潜往来电商，13日，双方同时下达停战令。于是，何键第三十五军由水路退至岳阳，刘兴第三十六军沿武长路退回长沙。次日，西征军夏威、胡宗铎部进抵汉口，叶开鑫部进入武昌，程潜第六军占领咸宁，陈嘉佑部克通山、崇阳，魏益三部进驻黄陂，方振武部由襄樊进驻孝感，鲁涤平部则占领仙桃镇。于是，武汉周围乃至整个湖北，都成了西征军和其他军阀的地盘。
虽然唐生智已经下野，其军队也退回到湖南，但是，南京方面仍不甘罢休，欲置之死地而后快。15日，南京政府下令通缉唐生智，称唐“背叛党国，阻兵殃民”，已畏罪潜逃，命令陆海各军及各省市政府通令严拿归案惩办。22日，南京各界还举行了讨唐胜利庆祝大会。非常有趣的是，在唐生智下野的前一天，蒋介石由日本回国，他极力反对特委会。在他的指使下，讨唐大会充满了反对特委会和西山会议派的气氛，这是特委会始料不及的。
唐生智部各军退出湖北后，力保控制湖南，待机再起。11月17日，何键就单独派廖汉瀛与南京军委会洽降。廖称何键始终未与唐生智合作，以求南京方面谅解。21日，李品仙、何键、刘兴与各师师长及省主席周斓在长沙举行重要会议，会商下一步的行动，决定：暂时保境休养，听候第四次执监会议解决；在长沙设立第四集团军办事处，推李品仙等七人为委员；分配各军防地，第八军、第三十五军、第三十六军分驻湘中、湘东、湘南；推张开琏代理财政厅长，月筹军费七十万元，并设财务委员会，推周斓等二十一人为委员。他们力图维持军队，保住湖南，不让西征军入湘。
可是，就在这时，西征军已逼近岳阳，与李品仙部稍有接触，李部采取忍让政策，向汉寿、常德、桃源退却。23日，西征军进入岳阳。第二天，程潜、李宗仁派袁家普、廖汉瀛赴长沙洽降，经与李品仙等晤谈，李表示服从。27日，李品仙、何键等也派代表曹伯闻随袁家普去武汉，与程、李商洽“和平解决办法”。
早在11月初，南京方面就决定取消武汉政治分会，改设湘鄂临时政务委员会，处理西征军与两湖民政、外交、财政、交通等方面事务。到了12月初，湘鄂临时政务委员会在汉口正式成立，以程潜为主席，接管两湖政权。桂系虽然兑付了让程主湘的诺言。但是却偷偷地把两湖的军政实权抢到了自己手里。
12月3日，原唐生智部彭振国第三十军驻花园、孝感第一、第三师被方振武收编，驻刘家庙第二师也由叶开鑫收编，军官给资遣散。唐军非嫡系部队首先被瓦解了。
唐部主力也面临被瓜分的危险，于是，12月6日，李品仙、何键、刘兴、周斓等又在长沙举行军事会议，决定：第四集团军对外持一致态度，分为两路，分别由李品仙、何键指挥；联络程潜及鄂省改进会派实行湘鄂联防；联合粤军，拒绝桂军假道南下；长沙以南、常德以东，决不允许他军侵入。他们仍然用第四集团军的名义从事扩充，新编周斓部、叶琪部为第十七、第十八军。并决定从1928年1月起实行新编制，下辖一、三、四方面军，分别由李品仙、何键、刘兴任总指挥。唐生智的弟弟、第十八军独立团团长唐生明部由第三方面军管辖。
11月中旬，张发奎在广州发动了驱逐李济深、黄绍竑的兵变。李宗仁、白崇禧担心张发奎与唐生智旧部结合，从而威胁广西及武汉的安全，于是，他们决定尽快派军入湘，解决唐生智的余部。12月19日白崇禧奉令赴武汉慰劳西征军，并代李宗仁兼第三路总指挥职务，必要时准备统兵解决湘粤。白崇禧旋即辞去淞沪卫戍总司令兼职，坐镇武汉部署入湘军事。唐部将领一面商讨对策，一面与桂系洽降。何键、李品仙、刘兴联名通电向桂系求和，表示服从命令，静候移师“北伐”。20日，第四集团军办事处改为湖南临时军事委员会。
蒋介石回国以后，与汪精卫联合，对桂系和西山会议派把持的中央特委会发动了强烈的政治攻势。桂系招架不住，便于12月底宣告取消特委会。次年1月8日，蒋介石又官复原职，重新上台，继续执掌国民革命军总司令的职权。
湘军将领利用蒋、桂矛盾和特委会垮台的时机，为自己谋生存。1928年1月5日，李品仙、何键、刘兴、周斓电令所部官兵拥护蒋介石、反对白崇禧。而做好了入湘准备的西征军便在白崇禧、程潜的指挥下于1月15日对唐部发起了攻击，分三路进兵湖南。西征军大部很快就进入岳阳，唐军向汨罗江退却。程潜进入岳阳后，命令所部强渡汨罗江，进行追击。
正在此时，蒋介石为阻止桂系势力向湖南发展，便通过贺耀组劝叶开鑫倒戈。1月20日夜，西征军第四路军叶开鑫第四十四军突然调转枪口，向程潜第六军猛袭，唐军刘兴、廖磊部趁机反击，重挫第六军。后来，白崇禧、程潜调重兵将叶部包围解决。
唐军在重挫西征军第四路军的同时，与其第三路军交火却受到很大损伤。21日，第三路军渡过汨罗江后，与湘军激战两昼夜，将第八、第十七、第十八、第三十六军及第三十五军之一部击溃，俘获一万五千余人，缴获枪械甚多，在西征军的一再进逼下，湖南临时军事委员会为确保实力，决定放弃长沙，分别退守宁乡、衡阳、醴陵、宝庆和湘西各地。25日，西征军进驻长沙。接着，白崇禧、程潜也相继抵达长沙，并决定由白率第七、十九、二十一军进攻衡阳、郴州、宝庆，由程率第六、十四军进攻沅江、益阳。与此同时，还成立了湘鄂临时政务委员会驻湘办公处和湘省临时政务委员会，代行省政府职权。
2月初，驻益阳之湘军何宣师投诚，西征军进驻益阳；李品仙部在胡宗铎、夏威进逼下，放弃衡阳，退守郴州。旋即，白崇禧进驻衡阳，亲赴洪罗庙督师，并电请粤方派兵夹击唐军。与此同时，白崇禧、程潜还分兵几路进攻湘西、宝庆，并截断了湘西与宝庆之间的联络，大有鲸吞整个湖南之势。2月15日，何键向程、白致电输诚，表示愿亲赴长沙面商一切，程、白未作答复。接着，西征军又占领宝庆，李品仙、刘兴、周斓仅率卫队数百人退至洪江、叙浦。西征军鲁涤平部自湖北向湘西、常德挺进，何键部退走临澧。唐生智旧部被西征军围追堵截，撕得支离破碎，士气不振，时有散失。
蒋介石为了釜底抽薪，于2月22日致电程潜，请其率军参加北伐。同一天，何键、叶琪通电表示愿意让出常德，听候改编，并派参谋长刘晴初赴长沙、宝庆面谈。程潜应刘之请求，下令停战，令何部集中桃源，叶部集中南县、华容等地，等候改编。24日，白崇禧从长沙致电蒋介石，报告湘鄂战事，答应在攻下常德、奠定三湘之后，率师北伐。第二天，何键、叶琪两军退走，西征军进驻常德。此时，李宗仁由南京来湘慰劳西征军将士，筹备北伐，与程潜、白崇禧会商军政事宜。
3月3日，叶琪赴长沙同程潜面商军队改编办法，程以叶首先输诚，准许维持原有建制。次日，李品仙、刘兴、周斓联名通电求和，表示愿意率所部集结湘西，听候命令，移师北伐。这时侯，白崇禧派人邀李品仙赴宝庆面谈，李征得刘兴同意后，前往晤谈。李品仙行至新化时，通过电话与白取得联系。白接受洽降，但也提出了条件，他说：“惟刘兴、周斓为唐生智嫡系，为消灭唐之残余势力计，对于处置方式，不能与吴尚、叶琪相同，先决条件须刘、周二人下野，交出兵柄，出洋游历，所余部队听候改编。”由此可见桂系对唐部嫡系斩草除根之决心。
3月4日，湘军第八军第二师师长吴尚抵长沙向程潜输诚，被委任为第八军军长，奉命移驻湘阴、平江一带“剿共”。同时，程潜还保举周斓为第十七军军长，廖磊为第三十六军军长。5日，湘鄂临时政务会还下令接收了唐生智原在衡阳创办、后随唐迁至长沙的《南岳日报》以及《湖南民报》，并恢复《国民日报》作为政务委员会的机关报。8日，程潜、白崇禧等会商湘省善后事宜，决定仍将唐生智旧部定编为第八、三十五、三十六军，以吴尚、何键、廖磊为军长。聘刘兴、周斓为高等军事顾问，给刘两万元出洋“考察”军事，如周愿意出洋，条件亦同。将收编的部队编为第十二路军，任命李品仙为总指挥。
周斓几经周折，总算被留在军队。桂系对唐生智的死党刘兴不放心，硬是使他脱离了军队，并推广西人廖磊继任第三十六军军长。其实，当刘兴部退到叙浦以后，蒋介石曾派刘文岛秘密赶赴叙浦，希望刘兴不要接受桂系的改编，暂在湘西和四川边界拖着，以便等待时机，经济方面蒋介石答应接济。可是，蒋却迟了一步，刘兴已与桂系谈妥下野。刘兴下野后，与刘文岛同行，不久即经汉口转赴上海去了。
3月11日，白崇禧、程潜、李品仙、叶琪、何键、廖磊等众多将领联名通电，宣布西征任务已经完成，准备移师北伐。
4月初，蒋介石将原来西征各军及两湖部队改编为第四集团军，分别以李宗仁、白崇禧为总司令、前敌总指挥，令其参加北伐，以分散桂系的力量。于是，李品仙、程潜、白崇禧商定，将两湖军队组成五个纵队，率第八、第十二、第十七、第三十六军等部参加北伐，留何键第三十五军在湖南剿共。这样，桂系通过拉拢何键第三十五军，吸收李品仙第八军，排斥刘兴让廖磊指挥第三十六军，几乎把唐生智的部队全部改编了。而且，他们还把其中的大部分带出湖南，让其参加北伐，以为这样就可以牢固地控制这支湘军了。
唐生智的部队虽然被桂系改编，其部将却得到蒋介石的关照。5月间，国民党中央特任李品仙、刘兴、何键、叶琪、廖磊、周斓为军事委员会委员，国民政府任命刘兴、何键、周斓为湖南省政府委员。后来，因战事需要，李品仙电请蒋介石起用刘兴，并从优录用，蒋立即复电嘉许。
唐生智旧部由白崇禧指挥，从武汉出发，一路打到河北、北平，与冯玉祥、阎锡山第二、第三集团军配合，击退了奉系张作霖，迫使奉军退往东北。旋即，张学良通电宣布与南京方面停止军事行动，绝不妨碍统一。
北洋军阀垮台以后，国民政府做出了裁兵的决定，要求取消各集团军，将现有部队编为四十几个师。将第八、第三十六军改编为第五十一、第五十三师，任命李品仙、廖磊为师长。原来的师改编为旅，其余的人事编制并无多大变更。白崇禧到达北平后，曾自请率部“开发”西北，但遭到阎锡山、冯玉祥的抵制，蒋介石也不会答应。这时，随奉军败退的直鲁军残部数万人，仍盘踞冀东，威胁平、津。于是，白崇禧奉蒋介石令出兵冀东，与张学良部合作，解决了直鲁军。白氏令第五十一师进驻唐山、第五十三师进驻开平。
至此，桂系很快就膨胀为以两湖为中心，南连广西，北接平津的强大军事集团，对蒋介石的独裁统治构成巨大的威胁。而且，桂系与冯玉祥、阎锡山等实力派联合抵制裁军方案，使蒋介石的编遣会议流于破产。于是，蒋桂矛盾日益激发。
1929年2月下旬，桂系操纵的武汉政治分会以亲蒋的鲁涤平清共不力，免去鲁本兼各职，指定何键为湖南省主席，同时，派夏威、叶琪两部入湘。夏、叶两部进驻长沙后，仍紧追不舍，鲁措手不及，慌忙乘外轮逃往南昌，史称“湘案”。蒋以军队“编遣”期间，地方无权任免特定区域内官员为借口，对桂系大加挞伐，并调动军队，向湖北进逼。