几天后的朝会上，众大臣几乎是以沉默来对待赵昺。好在这几天赵昺大致考虑了一下现在大宋国主要面临的一些任务和要重点解决的问题，把一些重要的事件拿出来，相应的机构也就容易敲定了。
按现在的宋朝发展过程中的重点中心，赵昺决定成立一些新的机构，主要是教育部下设一个宣传处，宣传处下设一个新闻署，直接对赵昺负责。
专门成立国家安全部，简称国安部，由江璆任部长，暂时下设对内、对外两个局，对外情报局由江宗杰负责，对内情报局先由禁卫军张达负责，等有相关人员后再重新任命。国安局直接对赵昺负责。
皇城司改制，重组为公共安全部，简称公安部，第一任部长人选由朝中大臣选举，由赵昺任命。公安部为预防、制止和侦查违法犯罪活动；防范、打击恐怖活动；维护社会治安秩序，制止危害社会治安秩序的行为；管理交通、消防、危险物品；管理户籍、出入境事务和外国人在中国境内居留、旅行的有关事务；警卫各项任务及治安保卫工作；具有独立的侦察、抓捕及执行法律判决任务及管理犯罪人员任务，没有审判权。
御史台改组为监察委员会，独立于朝堂之外，直接对皇帝负责，主管朝中官员及军队人员的监督、调查、取证、公诉等任务。委员长有朝中推举公正、严明、清廉人员担任，任期五年。任期满后，由委员会重新选举。委员长最多可连任两届。委员会委员若干名，暂时由委员长推荐，经朝廷审查后由皇帝批准上任，任期五年。各级地方政府下设监察处、局、科等级别单位，办员由监察委员会直接任命，独立于地方政府和军队，行使对平级及下级政府和单位的监督、取证、公诉等任务。
现在粮食问题是大宋的主要问题，农林渔牧是朝廷考虑的首要任务。这样，户部增加农业处和水利处两个机构，管理人员由朝中大臣推选懂行人员充当处长。
工业和建设已经成为大宋发展的主要方向，工部新增工业处机构，赵昺提议由许茂中担任第一任处长。这许茂中自上次被赵昺摆了一谱后，老实了许多，从此放下了身架，全心致力于自己的工作，干得有声有色，获得各部门的好评。而且许茂中又是一个懂技术的内行，在朝中人缘也好，被赵昺任命为工业处处长，大家也很容易通过。
鸿胪寺从礼部独立出来升级为外交部，部长由杜浒任第一任部长。主要职责代表国家维护国家主权、安全和利益，代表国家和皇帝办理外交事务，承办国家领导人与外国领导人的外交往来事务。同时兼有调查研究国际形势和国际关系中全局性、战略性问题，研究分析政治、经济、文化、安全等领域外交工作的重大问题，朝廷制定外交战略和方针政策提出建议。而且外交部有权按皇帝和朝廷和外国缔结各项条约，协调和管理大宋臣民驻外事务；管理和指导驻外使节。
赵昺的这些提议既有新增部门，扩大了人员的安提，又有减免六部中部分机构的权力，一下如油锅里倒了一盆凉水，朝堂上顿时一片沸腾。
但赵昺冷眼看着下面的反应，只淡淡地说了一句话：“新增部门的长官人员安排，除了朕直接任务的以外，大家讨论一下，就执行吧。”
大家都知道赵昺是下了决心要搞成这些事，即使反对，效果也不是很大，但并不是没有人反对。
“臣有本奏。”那个监察御史吴道和再次站了出来。
“哦，吴御史有何奏本，请讲。”赵昺这次可算是记住此人，而且这个人虽然官不大，确实是个正直无私之人，只是有点死板，注重自己的清流之名。
吴道和大声说道：“自我大宋三百年，祖宗之法不可变。陛下，王安石变法，朝野动荡，不可不防。今日陛下改制，毁祖宗之制，臣认为实为不当之法。”
赵昺本想懒得和他讲解，但他知道，朝中大臣并不只是这一人反对他的做法，如果不说清楚，大家心中有想法，对朝政总之不好。于是他对着吴道和说道：“朕知你忠心，一心为国。但是，朕曾说过，穷则思变，变则通久。祖宗之法有好的，朕也没有改变呀，不足之处才要改变。改变就是为了越改越好。”
“但臣认为自古以来，变法之事都促使了乱世之事。陛下深思呀。”
“不会吧？上古以来，至今几千年了，人类在进步，社会在变化，制度也在改变。这个社会应该是越改越好吧？”赵昺不由问道。
“臣还是认为古风维美。现在人心贪婪，人心不古。如果再改来改去，圣人在世，也不会同意的。”
“呵呵，你这个人很有意思呀。崇尚古风，朕不反对，但古时物质基础严重不足，文化严重落后，所以，为了生存，才共同生产共同支配财产。现在物质相对丰富，对于物质的支配范围扩大，当然支配物质的权欲也就越来越重。这正是社会发展进步的一个过程呀。你怎么能不理解呢？”
这边赵昺想法设法说服这些大臣们，把自己改革机构原因和好处从各个方面反复解释。总之，直昺也不想搞得太僵了，以后自己和大臣有隔阂。
放下赵昺的机构改革不谈，元朝那边忽必烈也是忙忙乱乱的。
八月时，占城听闻忽必烈出兵腼国，企图攻占安南，占城怕元军涉及自己，遣使奉称臣进贡，以免战火。占城离海南岛很近，顺风舟行一日可抵。而这时与蒙元交好的马八儿国，也就是位于南印度半岛的一个小国，也各元朝称臣进贡。一时元朝上下，更是自信大发。忽必烈对于征日灭宋更是充满了信心，只等过年战船造好，就发兵攻打。
而此时太子真金的老师，集贤院大学士兼国子祭酒许衡致仕，而他的另一个老师姚枢病逝。真金一边沉浸在悲痛中，一边又失去了自己的两个最大的汉支持和出谋划策，一时，在朝中的地位有所下降，更是被自己的政敌所排斥。而真金政治上幼稚的一面在朝政上表现出来，让忽必烈十分不满，总觉得立真金做太子是否失策。
但好消息紧接着就来了。高丽王王暙远来朝靓，自言征兵三万，准备做元朝攻打日本的马前卒。高丽和日本两国关系一直紧张，互相瞧着对方不顺眼。现在高丽归顺了蒙元，正好借蒙古之势，一举攻下日本。不想上次攻打日本，因兵力过少，又遇台风，在败而归。这次，高丽是下了决心要拿下日本，以报上次兵败之仇。
忽必烈当然乐意有人充当打手，于是以范文虎、实都、洪俊奇为中书右丞，李庭、张巴图为参知政事，并行中书省事。同时重新启用水军万户都元帅张禧，大造战船，在东海进行训练，以待来年战船造好，分两路东进日本。
转眼到了十月份，罗施鬼国，也就是大理国的一支彝族部落复反元朝，虽说不久就降服了罗施鬼国的复叛，在云贵地区设宣抚使，但元朝调动部队进入云贵丛山深林之中，一时难以再调兵，反而让福建的陈吊眼和广东的马宝南稍微松了口气，两人趁机扩大根据地建设，严惩降元官员和地方势力，严格按赵昺“打土豪分田地”的政策来执行，调动广大农民反抗蒙元的积极性。
不过，赵昺较为关心的是郭守敬在十一月时，申报了《授时历》，这可是当时世界上最先进的历法。赵昺为不能拥有这样优秀的科学家而失落，给国安部下了令，让他们想法把此人策反过来，如果不行，就绑架过来。
十二月了，就要到年底了，太子真金的好友崔斌被冤杀。
原来江淮行省平章政事阿里布、右丞雅克特穆尔和左丞崔斌三人，发现阿哈玛特贪污，阿哈玛特怕这三人揭发自己，就恶人先告状，忽必烈下令把三人抓捕下狱，然后才派人去审核案件，不想，这三个人却被害死在狱中。崔斌和真金交好，又数通汉学，两人相谈甚欢。听说崔斌被杀，连吃饭的筷子都扔了。后悔自己救助不及时，心里更加对阿哈玛特及他的主子阿合马更加怀恨在心。但他的帮手不是死就是因病致仕或被排挤，一时势力大减，即便想反扑也是心有余而力不足。从此更是心情沉闷，常驻家中，招几位汉臣喝酒做诗，不理朝政。这样，忽必烈就更瞧不上真金，父子两人的关系日渐恶劣。
福建元军势力大减，陈吊眼把握机会，领兵四处征讨，一时，福建八百里急报不止，忽必烈本想征调范文虎调集人马南征，但范文虎以正在海上训练为由，不愿意出兵南下。忽必烈没有办法，只好任命鄂勒哲图为大元帅，高兴为副元帅，组兵福建，同时，改建宁、雷州、廉州、化州、高州为路，防止陈吊眼进一步扩张，以肇庆路隶广南西道，防护广东，防止马宝南西进。