直到最近，分子生物学的迅速发展似乎提供了新的解决工具，研究人员在小鼠和果蝇身上作了大量实验，把那些模式生物的性别取向搅了个乱七八糟，比如有一种黄果蝇在某条染色体位点发生了突变，从而出现了同性恋倾向，有着不同凡响的奇特恋爱品味：所有雄性都有着柳下惠般坚定的品质，即使有雌性投怀送抱也丝毫不为所动。然而，当这些雄性果蝇兄弟被放到一起时，却不约而同地向对方展开了求爱行动。这一研究清楚地表明，同性恋受到了基因控制，因而可以遗传。
在人类身上似乎也有相同功能的基因，比如所谓“男性基因”和“女性基因”，可以决定胎儿的性别发展方向。但是，性别决定过程非常复杂，基本不可能是单个基因作用的结果，单基因控制也很难从逻辑上说得通，否则同性恋在一代之内就足以灭绝。所以几乎所有研究都遭到了其他研究的驳斥和非难，折衷的观点是，就算同性恋与基因有关联，也应该是不同基因复合作用的结果，而集中起一套复合基因很难，就像集齐七龙珠那么难，因此同性恋个体很少。
如果同性恋是众多基因共同作用的结果，就需要更多的样本去寻找这套基因的所有成员，可我们很难圈养一大批人来做相关研究，最好的办法是研究双胞胎，然而同性恋双胞胎并不容易搜集，早期研究发现，同卵双生双胞胎同时成为同性恋的机率为100%，也就是说，如果其中一人是同性恋，另一人肯定也是同性恋。而异卵双生的双胞胎同为同性恋的比例仅为15%，但这一结果被认为水分过大而饱受质疑，直到2007年，美国开展了规模足够大的相关研究，他们收集了一千对同性恋兄弟，最终表明，肯定有几个基因共同决定了同性恋倾向，至于具体是哪几个基因，现在仍是一头雾水。
退一步而言，如果真的存在某些控制同性恋的基因组合，它们又是如何得到遗传的呢？难道不应该被自然选择不断淘汰掉吗？
有些学者认为，同性恋本身虽然不具备繁殖优势，但可能伴随着其他适应性，就像是镰刀型贫血症，在特定环境下反倒可能提高个体存活率。同性恋相关的基因可能同时也具备其他功能，使他们更加敏感、温柔，更容易吸引女性，尽管他们本身对女性并不感兴趣，但一厢情愿的事情总会发生。类似的观点认为，男同性恋的基因遗传性能虽然有所降低，但他们的母亲或者姨妈和同胞姐妹的生殖能力却因此而更强，能够生下更多的兄弟或者侄儿，正好弥补了相关基因损失。换句话说，男同性恋基因有利于女性基因传递，这就是意外的好处。
这种观点其实和另一个理论不谋而合，好人理论主张同性恋只是某些基因的副产品，这些基因与善良或多愁善感等阴柔的个性有关，而这样的男人非常容易吸引女人。问题是这些好品质不容易聚集在同一个男人身上，大部分男人都不是十全十美的好男人，他们有这样或那样的缺点，一言以蔽之，那些缺点被叫作阳刚之气。当某些特殊的男人聚集了所有优点时，就会变成同性恋。也就是说，同性恋是优秀男人品质的副产品——他们好过头了。
这个理论的缺点在于，虽然男同性恋者比普通男性更敏感、更有同情心、更少攻击性，但不能据此就认为他们全是好人，更不要说女性并没有选择此类男性的偏好，她们反而更喜欢据有阳刚气质的男性，即所谓的坏人。好人理论也无法解释为什么同性恋比例如此之低，如果好人基因可以聚集，并受到自然选择的青睐，应该迅速聚集在某些个体身上才对。
正因为困难重重，同性恋基因的相关研究进展极为缓慢，甚至有学者沮丧地认为，过去关于同性恋基因的理解过于简单，决定性取向的等位基因可能多达数百甚至上千，要研究透彻可能需要几十年时间甚至更久，这或多或少会让人感觉无奈。有学者干脆提出了更为直接的相反理论，认为同性恋与基因根本没有任何关系，那只是一种传染病，可以通过性方式传播，但现在没能找到任何相关传染源，并且，传染病理论无法解释同性恋明显的遗传性，难道这种传染病可以出现代际感染吗。
补充的观点认为，男同性恋只是一种普遍行为，是男女博弈失败的表现，就像离婚一样，是两性关系崩溃的结果，离婚也对后代不利，但我们并不会因此寻找所谓“离婚基因”，同性恋也一样——可能根本不存在相关基因。
这个问题在短时间内可能很难得出权威结论，但同性恋本身是实实在在的客观现象，既然存在，就应该有存在的策略和博弈的手法。我很早以前曾经认为，中国古代男同性恋盛行，可能是应对一夫多妻制的策略，因为他们找不到足够的女人，所以不得不转向男人，但现有的研究成果似乎否定了这个观点——事实上那些玩同性恋的家伙完全有能力娶两个以上的女人。不过有一种理论正好和我的观点一致：同性恋属不得已而为之，是雌性缺乏的结果。
有人用斑鸠做过一个有趣的实验，发情的雄性会对雌斑鸠大献殷勤。研究人员把雌斑鸠拿走，另放进一只母鸡，雄斑鸠也照单全收；如果连母鸡也没有，可怜的雄斑鸠甚至会对着一堆脏兮兮的抹布表达浓浓的爱意。有人甚至亲眼观察到发情的青蛙在水中把金鱼强暴致死。所谓理解万岁，它们实在是为情所困。发情期的雄性会被性激素折腾的晕头转向，那些可怜虫产生了强烈的交配冲动，但是只有极少数优秀雄性可以赢得交配机会，它们只能游走在主流交配圈之外，眼看别人在毫无羞耻地猛烈运动，内心的郁闷可想而知，此时除了惺惺相惜一解饥渴之外，还能指望什么呢？同性恋是解除生理危机的有效手段，毕竟同性也是发泄的有效出口，总比没有任何发泄途径好得多。基于这个原理，军队和监狱中男同性恋的比例大大高于自由社会，因为那里缺少足够的女人。美军不得不在二战中制定严厉的军纪禁止同性恋，免得他们在战壕中抓错了枪管。
男同性恋另外一个好处是可以缓解社群压力。倭黑猩猩是典型的例子，这些小个子家伙特别容易激动，经常为了一些鸡毛蒜皮小事争斗不已，但从来不会持续很久，平息争斗的重要途径就是彼此发生性行为，无论同性还是异性。如果是同性，它们就会互相摩擦生殖器，如果是异性，大家就玩真的。几个回合下来，所有仇恨烟消云散，遍地精子的群体总比血流成河的群体更加安全，也更容易保存后代。
我们曾一再介绍过的亲缘选择理论也对同性恋作出了自己的解释，同性恋者虽然不会留下自己的后代，却可能对亲属成员投入更多的服务，从而补偿了放弃繁殖带来的损失。但这一说法只是听起来感人，在实际社会调查中却很难发现足够的证据。甚至有学者认为，与异性恋相比，男同性恋对家庭并没有表现得更加慷慨，这使得亲缘利他理论进退两难。
很多同性恋者都令父母倍受困扰，但有一理论却认为，部分同性恋其实是父母操纵的结果。从进化角度而言，父母关注的是基因遗传效率，至于哪个孩子完成这个任务并不重要。为了实现这一目标，父母可能会减少某个后代的生育机会，将其培养成同性取向，作为家族内抚养孩子的助手，并尽量把有限的资源分配给生殖能力更强的子女身上。
该理论的证据主要来自出生顺序对同性恋的影响。在一个兄弟众多的家庭中，排名靠后的小弟弟更具同性恋倾向，每多一个哥哥，弟弟的同性恋概率就增加三分之一，哥哥越多，弟弟的女性特质就越是明显。除了激素的影响，极可能是因为母亲希望弟弟像女孩那样辅助抚养哥哥的后代。
其实父母操纵理论可以看作亲缘选择理论的翻版，只不过亲缘选择可能出于自愿，而父母操纵则明显被动，但结果相同，遇到的麻烦也相同，就算那些小弟弟容易出现同性恋倾向，也不表明他们就会把更多的精力用于抚养侄儿，现实生活中我们也看不到这种现象普遍存在。
一种最近提出的比较新颖的结盟理论认为，同性恋取向并不重要，重要的是结果，和同性结盟不但可以产生性愉悦感，还有更多的社会收益可以弥补相应的遗传损失。因为同性性行为有助于形成长期互助的同盟关系，特别是从等级更高的男性那里获取更多的资源，当遭到其他个体侵犯时也能有效抵御。所以结盟行为是有效的个体生存策略，甚至是获取异性配偶的重要手段，因为结盟理论并不排除双性恋，这种逻辑虽然奇怪，但却不无道理——如果连一个同性朋友都没有，那也很难找到如意的异性伴侣，只有善于和朋友打成一片才会成为异性眼里的抢手货，独自仗剑走天涯的孤独侠客恐怕只有继续孤独。我们往往会看到这样一种社会现象：朋友越多，则情人也越多。所以男人往往为了择偶而去交朋友，而找到同性朋友的有效方法，无外乎大碗喝酒大块吃肉，所谓洒肉朋友，其实只是同性恋的初级形式，也就是说，同性游戏可能只是与异性相处的预习功课。
表面看来，男同性恋者非常注重穿衣打扮，对年龄要求也很高，这说明其中明显存在功利性意义，只有年轻的男性才更具有资源竞争力，这样的结盟也更有意义，所以结盟理论似乎给同性恋赋予了一定的功能。水泊梁山就是很好的证据，可以想像，那群孤独的土匪将如何解决自己的****，在女性极度缺乏的情况下，搞同性恋是最简单的策略。
但结盟理论的困难在于无法回答这样一种责难：他们为什么不是简单地结盟，而非要靠牺牲色相为代价呢？难道水浒中的三十六天罡和七十二地煞全部都是同性恋吗？难道刘关张的桃园三结义也是建立在同性恋基础上的吗？真正的结盟其实并不需要肉体介入，因为性关系很难维持大量人群的稳定。
这个理论最大的麻烦在于无法解释同性恋的排他性——难道结盟不是多多益善吗？但我们很少看到规模宏大的同性恋***场面。此外也没有证据表明，同性恋者确实获得了相应的结盟收益，他们并不会因此拥有更多的金钱和更多的女人，他们就只是同性恋而已。
但这种理论给了我们新的启发，同性恋行为可能既不是适应性的，也不是不适应的，就像人类的指纹图谱，那就是一种普遍的中性现象，没有受到自然选择的青睐，但也没有被淘汰。同性恋者只是为了好玩，是一种爱好的延伸，是动物追求乐趣的简单结果，有人喜欢喝酒，有人喜欢踢足球，有人喜欢同性恋，他们觉得那样更有趣，而且未尝不可，如此而已。这种行为可能对繁殖确实没有意义，却可以让生存变得更加有趣，而生存和生殖是两大重要生物学任务，完成其中的一条，总比一条都没完成好得多。
但这样一来，问题又回到了原地，既然同性恋很难留下后代，那么这种爱好是如何得到进化的？
真相说不定非常简单。
奇怪的是，我们在谈论同性恋时，往往忽略了他们的生育能力，事实上同性恋者也有孩子，而且超过半数是亲生的。一项可靠的调查表明，平均每对男同性恋配偶至少会有两个孩子。如果考虑到许多男同性恋者都没有亮明身份，他们强行抑制了自己的同性倾向，用形式婚姻应对社会压力，他们不得不结婚生子，这意味着在相当长的时间里，男同性恋的生育率可能更高。所以同性恋基因的遗传没有任何问题。如果没有问题，那么也可以认为同性恋之迷已经得到了解决，因为那个问题根本不存在——这是最不负责任的态度，但却可能是有效的态度。
无论如何，我们应该大方地承认，同性恋也是人类情感交流的重要方式，是正常行为模式之一，不应该受到歧视或指责，只要他们能够享受到爱的美好，谁又有权去指责他们呢。毕竟，一些异性恋夫妻都未必能够享受真爱的感觉。
在暮色苍茫的田间小路上，如果见到有人满脸兴奋地冲到你的面前，用神秘兮兮的神情对你说：同志，你让我找得好辛苦。那时，请你不必急着说出接头暗号和深藏不露的国家机密，而首先要考虑对方是“攻”还是“受”。