①清朝的地方行政制度是省、府（直隶州、直隶厅）、县（散州、散厅）三级制。清初，分全国为18行省。沿用明制，陕西布政使司统领今陕西、宁夏及甘肃之地。康熙三年（1664），分陕西为左、右布政使司，康熙五年（1666），改陕西右布政使司为巩昌布政使司；七年，又改为甘肃布政使司，徙治兰州，陕甘两省分治，陕西的区划确定下来，辖治与今省境相当接近。不过，凤翔府西部稍稍入甘肃境。甘肃省庆阳府北部则伸入陕西约1960平方公里。陕北界以明长城为界，但长城以北地区（今府谷、神木、榆林、横山诸县西部，定边、靖边北部）属蒙古。参见薛平拴著：《陕西历史人口地理》，页177~178。康熙三年（1664），分陕西为左、右布政使司，析临洮、巩昌、平凉、庆阳四府，以陕西右布政使司领之，驻巩昌（今陇西），河西及宁夏各卫所之地亦皆属之。六年（1667），改陕西右布政使司为巩昌布政使司，七年，又改甘肃布政使司，徙治兰州。乾隆二十九年（1764），裁甘肃巡抚，以陕甘总督治兰州，行巡抚事。三十八年（1773），置镇西府于巴里坤，迪化直隶州于乌鲁木齐。因此新疆北路的一部分便归甘肃行省管辖。咸同时，甘肃省辖兰州、平凉、巩昌、庆阳、宁夏、西宁、凉州、甘州、镇西等9府，泾州、阶州、秦州、肃州、安西、迪化等6直隶州，辖境除今甘肃全境外，还包括今宁夏全境、青海东部、新疆北路部分、内蒙古阿拉善、额济纳二旗部分。参见《清史稿》卷六十四“地理志·甘肃”；及郭厚安、陈守忠：《甘肃古代史》，页509。
①《世宗宪皇帝实录》（二），卷九十四，中华书局版《清实录》第八册，页二五七。
②张集馨同治三年（1864）九月十七日日记，见《道咸宦海见闻录》，327页。
③上谕，《钦定平定陕甘新疆回匪方略》（后注简称《方略》）册三，卷三十九，页十八。
①金吉堂：《中国回教史研究》，页95。
②白寿彝：《中国回教小史》，页33。
③参见白寿彝：《中国回教小史》，页81。另，关于陕甘之役的介绍，见傅统先：《中国回教史》，页93-96。金吉堂：《中国回教史研究》，页82。
①师古《清代的回汉纠纷》，《震宗报月刊》，1941年第六卷第8、9期合。
②雨辰：《西北过去回汉纠纷之误会谭》，载《绿旗》1940年第一卷第4至6合期。另有马宵石《从西北回汉问题说起》，载《突崛》，1935年卷二第6期。醉生《论汉回两族之种种关系》，载《清真汇刊》，1917年第1期。苏盛华《回汉纠纷经历录》，载《禹贡》卷七，第1、3合期。梅贻宝：《西北概况与回汉问题》，《成师校刊》第四十一期。马鸿达：《西北回汉问题之解剖》，载《清真铎报》1941年新第一号。
③马瑞图：《咸同滇乱记略》，《清真铎报》1941年新第3号。
④马观政：《滇垣咸同十四年大祸记》，《清真铎报》1947年新第23、24号。
⑤穆永贞：《回乱欤？革命欤？》，《伊斯兰青年》1936年卷二第八期；沙婉：《回族革命与改编清史》，《伊斯兰青年》1936年卷二第十期；张穆：《陕甘回族革命起因之探讨》，《伊斯兰青年》1936年卷三第四期；张穆：《回乱即是革命》，《伊斯兰青年》1936年卷三第六、七期合；郁素福：《清季陕甘回回大革命》，载《月华》1947年12月号，收于《西北民族宗教史料文摘（甘肃分册）》，页162-165。
⑥民国时期的回族伊斯兰教刊物相当一批有“新闻”、“时事”类栏目，刊载国外土耳其、埃及等伊斯兰国家的革命运动情况，回族学者也撰述了不少专题论文。如1935的创刊的《晨熹》，几乎每卷每号都有关于土耳其改革的文章，驻土耳其公使、后任甘肃代主席的贺耀祖因此写了《土耳其之宗教与中国回教青年》一文，载《晨熹》1936年十月号。另有特瓦杜阿《世界回民运动与中国回民运动》，载《回协》1938年四月号；马存德的译文《回教民族运动的两个倾向》，载《突崛》1940年第六卷第7、8期合。杨敬之则直陈《论中国回教运动》，《突崛》1944年第六十九期。更多章目参见雷晓静编：《回族近现代报刊目录提要》，及《中国伊斯兰教经学院图书馆馆藏民国时期伊斯兰报刊总目》，本书不一一列举。
①王树民：《乾隆四十六年河州事变歌》载《西北通讯》第3卷第2期。收于李兴华、冯今源编：《中国伊斯兰教史参考资料选编》上册，页802-819。
②载《西北民族宗教史料文摘（甘肃分册）》，页179-187。
③张中复：《清代回民事变：社会文化适应与民族认同的省思》，页273。
④何志明：《从〈回回民族问题〉看回族在中国共产党民族政策发展史上的重要地位》，《回族研究》2006年4期，页136。
⑤张中复：《清代回民事变：社会文化适应与民族认同的省思》，页263。
①当时在回族内部的反封建特权主要是针对苏非派教团进行的。如批判哲合忍耶门宦当时的“老人家”马震武及上层。运动以伊协刊物《中国穆斯林》及各回族聚居省区的报纸为阵地开展，因而产生了诸如《西及滩》（姚以壮、赵千里编，刊于《中国穆斯林》1959年6期）这样具有强烈批判色彩的文学剧本。
②李松茂：《白寿彝与中国回族研究》，《云南民族学院学报》3期，页45。
①马长寿主编：《同治年间陕西回民起义历史调查记录》，张岂之“出版序言”。
②参见白寿彝主编《中国回回民族史》，第六章第三节“回民起义史料的扩大收集与研究”，页79-81。
①马重雍，原名马殿武，是哲合忍耶门宦创始人马明心的第四代后裔，第七辈教主马元章之弟马元超的六子，继为哲派北山分支的负责人，教众尊称为“兰州六爷”。
②马培清先生是原国民党第35师（师长马鸿宾）骑兵团团长。1949年9月19日，马培清代表国民党第81军军长马惇靖与马鸿宾一起率领军部和第35师、第294师、第358师共约1.6万余人在宁夏中卫与解放军协商起义。
③马丕烈，是马占鳌的后代，马步芳之子马继援的舅舅，曾任国民党军青海暂编第九师军需处处长、12军副官长、国民党甘肃省政议、青海省财政厅厅长。建国后，任临夏专署民委主任，甘肃省农业厅厅长、省第六届人大常委会副主任，甘肃省委副主任委员。
①白寿彝：《回回民族的新生》，《白寿彝民族宗教论集》，页111-134。
②收入中国社会科学院民族研究所、中央民族大学民族研究所回族史组编：《回族史论集：1949－1979》，页7。
③白寿彝：《在陕西回民起义（清代同治年间）学术讨论会上的讲话（代序）》，载冯增烈、李登弟、张志杰编《清代同治年间陕西回民起义研究》。
④李松茂：《回族史研究的四十年》，《史学史研究》1981年4期，页16。
①据统计，“文革”10年中，回族史研究仅发表5篇文章，研究处于停滞状态。参见答振益：《1949—1999年回族研究的回顾与思考》，《中南民族大学学报》，2001年1期。
②吴万善：《清代西北回民起义研究》，页144。
③吴万善：《1862－1873年的西北回民起义》，《历史教学》1963年3期。
①邵宏谟、韩敏：《陕西回民起义史》，页40。