长期光吃素不进荤，会造成营养不良。因为蛋白质是生命的基础，是人体一切细胞的主要成分，而纯素食中所含的蛋白质、脂肪等营养成分，不能满足机体对新陈代谢的需求。
动物蛋白食物含人体必须的氨基酸比较丰富全面，易被人体吸收合成为人体蛋白质，这是植物蛋白食物远不及的。长期素食者，其机体得不到充分的动物蛋白质，会使人体内营养比例发生紊乱，蛋白质入不敷出，会造成人体消瘦、贫血、消化不良、精神不振、记忆力下降、性功能和免疫功能降低、内分泌代谢功能发生障碍，并且容易感染疾病，加剧早衰和易发生肿瘤。
蛋白质不足是引起消化道肿瘤的一个危险因素，特别是肾功能不好的人，摄入过多的植物蛋白还会加重对肾功能的损害，引起血氮质增高。
另外，长期素食者还会导致不育。因为男子体内缺少锌、锰，会影响脑垂体分泌性腺激素，引起机能性减退，精子数目减少，活力降低，且性功能减弱，影响生育能力。女性长期素食也会影响体内性激素的分泌，造成婚后不育。