孙朝宗中医世家历代以来均重视对经方重点及难点内容的深入研究，尤其是对经方的诸多脚注内容更是进行了深入细致的研究，现择其部分内容罗列如下。
1. 桂枝去皮桂枝本不去皮，其误在晋（误在肉桂去老皮）。仲景指出：“桂枝者，取枝上皮也。”枝上皮，实指桂枝之梢，其味辛轻扬，上行解表。《医宗金鉴》指出：“夫桂枝气味辛甘，全在于皮，若去皮是枯木也，如何有发汗解肌之功，宜删去皮二字，后仿此。”
2. 咀据《说文解字》记载，，嚼也。咀，含味也。是指品尝药物气味，以鉴别药物的真伪。李杲所谓“古无刀，以口咬细，令如麻豆”，非也。
3.煮米熟汤成白虎汤、白虎加人参汤、桃花汤，皆注“煮米熟汤成”之词。粳米即今之秫米，一般煮20分钟即熟。通过实践证明，米已煮熟了，而白虎汤、白虎加人参汤中之知母饮片、人参饮片以及桃花汤中的干姜饮片却尚未煮透，还有夹生者，所以，米熟尚不可言汤已煮成，必须再加以煎煮，以饮片煮透，效力完全释出为度。此外，方中之石膏亦必须杵为细末入于煮剂。孙氏中医世家在应用此汤时，通常先以宽汤煮粳米，取汤纳诸药煮之，方得药味之全。
4.温粉扑之应用大青龙汤发汗过多，仲景用温粉扑之以止汗，此临时急救之法，后世效之，方法甚多。如《千金方》以煅龙骨、炼牡蛎、黄芪、粳米为粉；《总病论》加陵零香，名辟瘟粉；《肘后方》《活人书》《医方考》《伤寒类方》《产宝》等书，都有不同程度的发挥。近代陆渊雷还用市售之爽身粉以扑之。总之，后世止汗之粉，皆由温粉演化而来。
5.去上沫麻黄、葛根二药，入煮剂，仲景皆注“去上沫”三字。麻黄煮沸，其沫略褐；葛根煮沸，其沫白灰。因沫有“令人烦”及“呕吐”的副作用，故去之。再者麻黄取效在皮，功在发散表之风寒；葛根取效在筋络，功在升散清阳，故而均宜去沫。
6.黄耳杯麻黄杏仁甘草石膏汤脚注“黄耳杯”，此乃古代富家之饮具，有陶制品，还有漆木制品，大小不等。北京博物馆现存有陶制品，盛水量约150～200ml。
7.再煎“药物与水同炖曰煮，单煮药汁加以浓缩曰煎”。仲景柴胡类方，皆注“去滓再煎”。历代医家对此众说纷纭，孙氏中医世家认为，去滓再煎的目的，是以融和药性，使其刚柔相济。
8.子即今之棋字，赌博用的棋子。所谓“如子大”，乃斟酌之意。
9.先食温服桃仁承气汤、乌梅丸、茵陈五苓散、桂枝茯苓丸、己椒苈黄丸等，皆先食服，亦即今之空腹服药法，因病在下焦，使其药物至下焦而发挥效力。《神农本草经》所谓：“病在心腹以下者，先服药而后食”即是。
10.之、洗之 “含水喷洒为，浇灌为洗”，乃古人采用的一种最为简单的退热方法，今人以酒精擦身，亦属此法。
11.糜粥自养十枣汤方注有“糜粥自养”，关于糜粥，《说文解字》曰：“黄帝初教作糜，释名糜，煮米使糜烂也。”这种糜粥，非大麦、小麦之粥，即今之小米粥、谷米粥。此处用之以调补胃气。
12.时当下血抵当丸方后注有“时当下血”，时为一昼夜。抵当丸为破下焦瘀血之品，所下之血，指瘀血。
13.渍之、须臾绞去滓附子泻心汤方中之大黄、黄连、黄芩，取麻沸热水渍泡之。时间不要太长，绞取汁而去其滓。此乃取三药之气，非取其质，故不入煮剂。
14.更衣此指入厕大便，古人衣着富丽堂皇，凤冠霞帔，大便时必须更衣，故名。
15.尿如皂角状服茵陈蒿汤，尿如皂角汁，色正赤，一是湿热下注，一是药物之色素。
16.潦水李时珍说：“降注之水谓之潦……气味甘平无毒”。麻黄连翘赤小豆汤用之以内清湿热。
17.猪肤猪肤汤之猪肤，指猪肤之外皮，含胶质较厚，煎之为胶汁，其味清香，有清热润燥、利咽止痛之效。若言肤内白肉，则与猪膏发煎方之猪膏同，当予以鉴别。
18.白粉、白饮白粉即米粉（大米、小米均可），米粉煮成薄薄稀粥为白饮，或煮米之薄薄黏汤，亦为白饮，临床有啜粥之意。
19.苦酒即今之米醋。
20.刀环历代关于刀环说法不一，实际是指大砍刀刀柄后的圆环，其环之大，正容下一鸡子壳。
21.清浆水亦名浆水，指淘米泔水，待其味酸为佳，腐臭者，勿用。枳实栀子汤用之以清热除烦、行气消痞。
22.食顷啜热粥发服瓜蒌桂枝汤，以取微汗出，因汗不得出，饮热粥以助其汗。
23.麻豆大麻杏苡甘汤、防己黄芪汤皆为“煮散”之方，以祛在表之风湿，必挫碎，细如大麻豆许，唯有这样，才会使各种药物的效力同时释出。
24.煮饼百合洗方，借甘温之洗法，以祛除周身弥漫之虚热。服煮饼亦啜粥之变法，饼指今之面条，为小麦面轧成。小麦性味甘寒，既补脾阴亦生肺津，主开发玄腑而达邪外出，乃内外兼顾之法。《千金方》作饼，刘禹锡作“汤饼”均是。
25.大便常如漆百合诸方中，唯百合地黄汤言“大便常如漆”，此乃因地黄汁的缘故，别无他意。
26.赤小豆浸令芽出、曝干赤小豆发芽而曝干，由血药而变为清气之品，用以清热解毒、消肿排脓。唐容川云：“赤豆发出芽，则能排脓，盖脓乃血后气而化者也，赤豆属血分，而既发出芽，则血从气而外出矣，故以治血从气化脓，其治先血后便，亦是治痔毒消脓者也。”
27.心中恶寒不足者《经方方法论》云：“心中恶寒不足者”，指中风症，其标为实，其本属虚，后世云脱症者，更类于此，心气不足，悸惕畏寒者，临床不可不仔细观察，侯氏黑散方后本云：“心中恶寒不足者”，今人多忽视，实际上乃诊断之要妙处，医乃人命系之，万万忽视不得。
28.韦囊韦囊是用牛皮制成的皮袋囊，为古代军人使用的箭囊，医人用之以盛药可防潮湿。风引汤乃是一种散药，以韦囊盛之，亦便于携带。
29.簿复脊，凭几坐，汗出则愈服续命汤后，以衣被覆盖脊背，以促汗出，如不汗出，更服。这是一种服药后的护理方法，与防己黄芪汤“服后当如虫行皮中，从腰下如水，后坐被上，又以一被绕腰以下，温令微汗，瘥”的治法是一致的。防己黄芪汤的功效是益气除湿、健脾利水；续命汤的功效是扶正祛风、养血通络。风痱之病，簿覆其脊乃“取其祛风走表，安内攘外，旋转上下也”。
30.炼蜜为丸如弹子大薯蓣丸，由炼蜜合成，如弹球之大，即指传统配制之蜜丸，亦即所谓“每丸三钱，折合今之九克量”。
31.枣膏皂荚丸，因其药力猛悍，为防其损伤胃气，先煮大枣二三沸，去水，再以新水煮大枣熟烂如稀膏状，以送服丸药。
32.石膏如鸡子大厚朴麻黄汤，石膏如鸡子大，约相当于今之60～70g。
33.心下毒痛白术散，为健脾除湿、温中安胎之方。心下毒痛，为肝气郁结而痛甚，心下毒痛倍以芎，因川芎为血中之气药，此方用之，有温肝络、行气血、止疼痛之功。
34.白酒近代医家考证，白酒为初熟的米酒，或今之黄酒。瓜蒌薤白白酒汤之白酒，若用市售之白酒，五六十度许，“七升，取二升”，虽云“分温再服”，亦足以酩酊大醉，用黄酒则无此弊矣。
35.清酒清酒，古人亦称美清酒、无灰酒，实则今人之黄酒（如镇江老酒），古人以酒煎煮药物或浸泡药物的历史很久，非但取其通经活络、调补气血，抑且用之以矫正药物的腥臭气味。
36.井华水、泉水井华水，指清晨井中之水。《本草纲目》说：“平旦第一汲为井华水。”虞博说：“新汲井华水取天一真气浮于水面，用以煎补阴之剂，及炼丹煮茗，性味同于雪水也。”意思是通过沉淀了杂质的水，非常清净。泉水亦同于井华水，清净凉爽，可用于“调中下热气”，主治酒后热痢、消渴以及痈肿热痛等。
37.甘澜水茯苓桂枝甘草大枣汤乃温通心阳、化气行水之方，取用甘澜水煮药，仲景有作甘澜水法。甘澜水亦名千里水、东流水、劳水，实江河之水，其水偏于甘淡，甘淡之性属阳，即指阳水。实践证明，取江河之水浇灌庄稼、蔬菜、花卉，比取泉下之水（阴水）浇灌生长得更加茂盛。仲景取此水，以治脾肾虚弱、五劳七伤、伤寒欲作奔豚及霍乱吐利。历代医家皆以为其“气味甘淡无毒”“甘而轻，不助肾邪”“动则其性属阳”，说明我国古人通过大量的实践，认识到水的性质种类不同，在临床治疗上会起到不同的效果。
38.地浆水亦名土浆水。“掘地深三尺，取其下土三升，以水五升煮数沸，澄清汁”即是。《金匮要略》二十四篇、二十五篇中主治：“食生肉中毒”“食诸菌中毒”“误食蜀椒中毒”。考地浆水《本草纲目》谓：“气味甘寒无毒，解中毒烦闷……”《千金方》《卫生宝鉴》《圣惠方》《肘后方》《集简方》等，都有关于其应用的记载，总之不外主治霍乱、中暑、食物中毒、腹痛烦闷者。
39.冷粥、热粥《伤寒论》桔梗白散治寒实结胸，《金匮要略》三物小白散治疗肺痈，云其“不利，进热粥一杯，利过不止，进冷粥一杯”。《经方方法论》说：“以上二方，方药同而名异，实为一方，所不同的是：进热粥以助巴豆之力，进冷粥……乃缓解巴豆的峻猛之性。”
40.小麦汁、大麦粥《金匮要略》白术散之“服之后，更以醋浆水服之，复不解者，小麦汁服之；已后渴者，大麦粥服之，病虽愈，服之勿置”。枳实芍药散方以“麦粥下之”，此处指大麦。硝石矾石散方“以大麦粥汁和服”，厚朴麻黄汤方用小麦粥汁，“是以小麦煮汁以除肚痛而止心烦，大麦粥以生津液而止渴”。小麦气味甘，微寒而无毒，只取其汁；大麦性寒咸，无毒，黏而滑，除热下气，可取其粥。
41.一帖《金匮要略》柴胡饮子方后注“一帖”。帖亦做贴。古人的药包上覆以帖封之，一帖，即今一剂。