急性泄泻及痢疾的治疗，中西医联合用药很快都能控制症状，但对于久泄不愈或病情缠绵的慢性患者，就应究其原因，查明病机。临床实践证明，此病多为祛邪末尽，闭门留寇所致。如秦皇士在《症因脉治》中记载：“古云：大肠受病，则气凝注而成白痢；小肠受病，则血凝注而成赤痢；大小肠均受病，则赤白相杂。即《经》曰：肠下血，肠下白沫，肠下脓血。诸条皆以肠字为主，先生论中，脱却肠字本题，而独重于脾肾。而脾泄、肾泄，脏气不足，内伤之虚，脏证也。夏秋之痢，胃肠受邪，外感之实，腑证也。内伤不足，外感有余，二者天壤，先生言言牵带脾肾，妄存温补固涩，横格胸中，致有初痢胃肠壅滞，热郁于内，反见外寒兼化之象，误认虚寒，妄施温补，证重者为害非轻，证轻者迁延变重。”
人体的消化吸收是一个有序的、动态的生理过程，如果受各种因素的影响发病，邪气未尽，均可作用于任何一个局部影响全身的气机升降，导致脾胃升降功能的再次失常而发病。大肠为“传导之官”，小肠为“受盛之官”，前者司“变化”，后者主“化物”，一旦肠腑发生病变，必然“变化”无权，“化物”少能，于是曲肠之处形成积滞。因此，对急慢性泄泻、痢疾，有邪必先祛邪，祛邪宜早，祛邪务尽。对于邪滞日久，留恋于肠壁，用药宜量大力宏，直达病所，中病之后，衰其大半，应重新调整方案，或减轻药量或扶正祛邪并用，这样才可不留后患，禁防余邪未净，或宿积未净，病邪又生。所以，在常规用药的基础上，用升麻、槟榔之品，升清而降浊；用紫苑配桔梗，一升一降，开上而达下；用瓜蒌和五灵脂，活血而祛邪；用晚蚕砂、五灵脂通下邪毒。还可用六一散，祛邪从小便而去，或用败酱草、生薏仁解毒排脓。如此毒邪必去，正气来复，疾病向愈。