叶天士氏治痢，提出奇经之论，他认为“久泻无有不伤肾者”；“自三阴经及于奇经……冲任脉乏”。治疗“由脏腑络伤，已及奇经，前议轻剂升阳颇投，仍从下论”。“其外邪为少，而内损为多，八脉无权，下元收摄，漏质不已，理必生阳虚，下焦冷，此皆阴阳二气微绝，治病则笨，治本为宜。”参茸汤为其代表方。
究其原因，多为痢久伤肾，阴阳两伤，由脏腑络伤，危及奇经，冲任督带为伤，则见痢下日久，少腹肛坠，连及腰胯脊髀酸痛，药不入奇经，何能见效。病先伤在阴，宜用血肉有情之品，温补冲任督带，方可取效，用叶氏鹿茸菟丝方（人参、鹿茸、菟丝子、茯苓、茴香、补骨脂、砂仁），或参茸汤（人参、鹿茸、附子、炒当归、茴香、菟丝子、杜仲）去附子、茴香、菟丝子加沙苑、茯苓。另外，叶天士补养奇经，一种是温润，一种是升阳，一种是温涩。温润，用巴戟天、菟丝子、补骨脂、葫芦巴、杜仲、枸杞、当归身、苁蓉、益智仁等补肾中择其温润。升阳，用鹿茸、附子、茴香、菟丝子等补肾中择其升阳。温涩，用紫石英、赤石脂、禹余粮等补肾中择其温涩。亦可仿此用仲景温经汤以调补冲任，可取良效。药用吴茱萸、阿胶、牡丹皮、川芎、干姜、甘草、白芍、麦冬、党参、当归、桂枝、半夏等。
“典型病例”
郝某，女，73岁，家住内蒙古阿拉善左旗，初诊2004年9月7日，主诉及病史：一年前，喝牛奶后脓血便4月，服各种药物时好时坏，久治不愈，现大便一日一次，色不正常，为青绿色，中有少量黏液，纳可，饮食不适，则腹痛腹泻，伴有乏力，头晕，时有呃逆，小便正常，舌红苔黄腻苔心黑，脉沉细。体格检查（实验室检查）：心肺（-），腹软，大便常规无异常。中医辩证为：久泄不止，伤及奇经，治以调补冲任，温肾止泻。温经汤加减。方药：吴茱萸10g、阿胶10g、牡丹皮10g、焦槟榔10g、川芎10g、干姜10g、麦冬6g、当归15g、瓜蒌10g、薤白10g、半夏10g、乌药10g、焦乌梅10g、焦三楂12g、秦皮12g、藕节10g、龙胆草6g、神曲12g、生牡蛎15g、莱菔子10g，六副，每日一剂，水煎服。
服药一周后，症状明显减轻，照原方继服一周，症状消失，改汤为散，每次3g，每日3次，调成糊状冲服，3个月后，纳食增加，症状完全消失，至今再未发作。