常用的母种培养基材料有马铃薯、葡萄糖（蔗糖）、琼脂、磷酸二氢钾、硫酸镁等。
马铃薯含有相当丰富的营养物质，它含有20％淀粉，2％～3％蛋白质，0．2％脂肪，还有多种无机盐、维生素及活性物质。
葡萄糖是菌丝易于吸收利用的碳源。也可用蔗糖，蔗糖经分解后，可成为菌丝易吸收的葡萄糖和果糖。
磷酸二氢钾含有磷、钾元素。磷是核酸组成和能量代谢中的重要成分，没有磷则碳和氮也不能被菌丝很好利用。钾在金针菇的细胞组成、营养物质的吸收和呼吸代谢中都十分重要。
硫酸镁是硫和镁微量元素的来源，一般在培养基中需要量极少，自然培养基中不需要另加，合成培养基中加入少量能促进菌丝生长健壮。
琼脂又称洋菜，是培养基中常用的凝固剂。