影响氨化秸秆质量高低的因素有环境温度、氨化时间、氨的用量、秸秆水分、秸秆种类和部位（叶、茎）等。
（1）环境温度。环境温度越高氨化所需的时间就越短。一般来说，化学反应随温度升高而加快，温度升高，氨化秸秆的消化率和含氨量也相应提高。在45℃下氨化3～7天就可大大改进秸秆的消化率，而在－20℃低温下氨化反应就非常小。秸秆氨化应在秸秆收割后不久、气温相对高的时候进行。
（2）氨化时间。秸秆氨化处理时间的长短决定于环境温度。例如，温度在17℃～25℃时，处理时间可少于4周，0℃～4℃时氨化约需8周，而采用氨化炉来氨化，炉温可达85℃，只需氨化24小时就可以了。
一般氨化时间可按下列温度梯度考虑。当环境温度为0℃～5℃、5℃～15℃、15℃～20℃、20℃～30℃、85℃时，则氨化处理时间分别为8周以上、4～8周、2～4周、1～3周、24小时。
（3）秸秆含水量。秸秆含水量是决定秸秆氨化效果的另一重要因素。一般认为，用液氨处理秸秆时，秸秆含水量以30%为宜。提高秸秆含水量，对改善秸秆消化率有好的作用。秸秆含水量较高，有利于提高秸秆的消化率，在便于操作、运输和保存以及保持秸秆不致霉变的前提下，以秸秆含水量较高为好，但是含水量过大，既不便于操作运输，也易引起秸秆霉变。
（4）氨的用量。生产实践表明，氨的用量与氨化效果密切相关。据报道，将氨的用量从占干秸秆的1%提高到2．5%，秸秆消化率明显提高；氨的剂量从2.5%提高到4%，秸秆消化率提高较小；氨的剂量超过4%时，消化率提高甚微。因此，人们认为，氨的经济用量以2.5%～3.5%为宜。
（5）秸秆的类型。一般说来，秸秆经氨化，其营养价值提高的幅度与秸秆原有营养价值的大小呈负相关，即品质差的秸秆，氨化后营养价值提高幅度大，而品质好的秸秆，提高的幅度较小。因此，如果秸秆的消化率达55%～65%，一般用不着氨化。例如，消化率为65%～70%的粗饲料以及幼嫩青干草就不必氨化了。
（6）压力。如在氨化炉内进行秸秆氨化，容器内的压力也是影响氨化秸秆质量的重要因素。据报道，压力在98.07～490.33千帕的范围内，压力的增加与秸秆消化率的提高呈正相关。因此，将氨化秸秆轧制成颗粒，有助于反刍动物的消化，并可提高含氮量。