永历六年，曾德事件导致施琅与郑成功公开决裂。自从郑芝龙降清后，曾德似乎不大得志，在郑成功军中受施琅节制。施琅既被削去兵权，曾德为求出头之日，利用过去在郑氏家族军队中的关系投入成功营中充当亲随。施琅听到消息后，大为愤慨，派人把曾德捉回斩首。郑成功“驰令勿杀”，施琅却悍然不顾，“促令杀之”。
郑成功见施琅违令擅杀郑氏旧将，断定他是反形已露，就在五月二十日密令援剿右镇黄山以商量出军机宜为名逮捕施琅之弟施显，同时命右先锋黄廷带领兵丁包围施琅住宅，将施琅和他的父亲施大宣拘捕。施琅被捕后，在一些亲信部将和当地居民的掩护和帮助下逃到大陆。郑成功获悉施琅已经逃入清方管辖区后，怒不可遏，在七月间把施大宣、施显处斩。施琅得知父亲和弟弟被杀的消息，对郑成功恨之入骨，死心塌地投靠清朝，一意同郑氏为敌。
永历五年下半年，郑军在闽南小盈岭、海澄（今龙海市）等地战斗，获得了磁灶战役、钱山战役和小盈岭战役的胜利，克复平和、漳浦、诏安、南靖等地。年底，包括定西侯张名振等人皆来投靠，使郑军的声势愈形高涨。
这期间，张煌言与张焜言一直带领自己麾下的义军跟随郑成功南征北战，然陈氏在英秀儿死后，颇受刺激，没过多久，便染病身亡了。临死前，她握住张焜言的手，说道：“一定要……找到那个小妖妇，亲手杀了她，为娘、为英秀儿报仇！”张焜言含泪不语，陈氏紧紧攥住张焜言的手，咬紧了牙关，说道：“答应娘，啊，你答应娘啊。”张焜言点了点头，说道：“娘，我记住了。”陈氏这才放心，长舒了一口气，撒手人寰。
永历六年正月，清海澄守将赫文兴向郑成功投降。二月，郑军攻长泰，清朝派遣陈锦率大军前往救援；两军于江东桥展开大战。郑成功仗着对闽南地形较为熟识，在江东桥附近安排了许多伏兵，大败陈锦，歼灭多数清军，取得江东桥战役的胜利。攻克长泰之后，郑成功集结大军进攻漳州府城，将之层层包围。同年九月，清军将领固山额真金砺率领了万人大军开抵福建，进入泉州府；郑成功才下令解除漳州之围以待敌军。郑成功将部队布置于漳州龙溪古县，欲用击败陈锦的同样方式，来伏击金砺军，谁想却遭金砺固山识破，两军展开混战。
混战之中，张煌言见阵型散乱，号令不行，已无秩序可言。为整顿行伍，带兵杀出重围，张煌言身先士卒，冲在头阵，不期敌方一阵炮火袭来，张煌言须发皆被燎光。