执政府成立之初，为了控制法兰西的各条命脉，拿破仑任命自己的亲信担任政府各部门的部长，这些部长全都是精明的人士，而且大都是拿破仑在雾月政变中的得力助手。另外，在这新成立的政府当中也有许多以前督政府的人员。拿破仑之所以这么做，一方面是执政府刚刚成立，需要拉拢人心，巩固统治；另一方面，拿破仑用人通常是不计前嫌，贤能者居之。看到这些人心甘情愿的为新政府卖命，拿破仑当然是求之不得。
解散了督政府，废除了旧宪法，刚刚成立的执政府需要一部新的宪法。于是这项重大的任务便落到了法学家出身的西哀士身上。实际上，西哀士最大的心愿就是在法国施行新的宪法，他欣然接受了这项任务。
新的宪法秉承“信任自下而上，权力自上而下”的指导原则，立法机关分为参政院、保民院、立法院三个部分。参政院提出法案，保民院予以评议或同意，立法院只是听取那些法案。这三个机构彼此对立。
对于新宪法，拿破仑基本上表示赞同，却对其中的一条表示坚决反对。为了防止独裁政府的出现，西哀士在新宪法中规定：“由元老院选出终身大选长。这位大选长居住在凡尔赛宫，有权任命两个执政分别负责战争与和平，接见外国使节，以他的名义颁布各种法律。大选长是国家荣誉、权力尊严的唯一代表。但如果大选长或者是某一高级官员企图永远独裁的话，元老院可立即将这人吸收到元老行列中，或者予以罢免。”
拿破仑对于大选长权限所加的限制表示强烈的不满，西哀士将首席官员贬低到了一个只是徒有虚名、无所事事的地步，这种做法无疑是把雄鹰飞翔的翅膀绑上绳索，或者更是像剪断他的翅膀，把他关到笼子里供人观赏。拿破仑无法容忍别人约束或者是和他共享权力，他说过：“我有野心，对我来说，那是很自然的，是天地赋予我的，它同我的生命联系在一起，正像流在我血管里的血液和我呼吸的空气一样。权力是我的主妇，我花了很大的力气才得到她，不容她从我这里被夺走，即使有人艳羡她也不行。”
拿破仑向西哀士提出了抗议，最终让这条提议从草案上消失。拿破仑推翻了原来精巧均衡安排的官僚制度，由一个几乎是权力无限的独裁制度取而代之。
1799年12月15日，新方案以成功的形式提交法国人民，要求他们接受。公告是这样结束的：“公民们，大革命已经回到了它当初借以发端的原则。大革命已经结束。”代表革命完成的新宪法一经传播，就受到了民众的热烈欢迎。
1800年初，这部经过拿破仑修正的宪法草案交付给全民投票表决，法国民众以压倒多数——3001007票赞成，1563票反对——接受了这部宪法。其实，民众希望的是能够结束革命和动乱，过上安定的生活，对于政府的权力究竟是一个人独揽还是几个人分配，他们并不关心。
拿破仑终于如愿以偿地拥有了至高无上的权力，牢固地坐稳了第一把交椅。身为第一执政，拿破仑有权力任命政府各部长、参政院成员及各省省长；有权任命免驻外人员、军队将官及法官；有权签署对外条约。他不但掌管了一般政府官吏，而且掌握了陆军、海军和外交官员的生杀任免大权。