自大清朝建立起来之后，朝廷内外，满汉之争就从来没有间断过。在大清王朝，为官要做得顺当，除去本人的能力之外，其中最重要的一点，就是得到满清亲贵的认可。在这一点上，冯国璋以他圆滑的为人，做得非常出色。
1905年，袁世凯的北洋六镇编练成军。拥有这只崭新军队的袁世凯立刻遭到满清亲贵的忌妒，开始采取惯用的明升暗降之法，解除袁世凯手中的兵权。同时，对北洋将领的升迁，全面冻结。
往日里随着袁世凯升迁也不断升迁的北洋将领们，如今官做到哪就是哪了，甚至在以后的五六年里都再无升迁。在这件事情上，唯独冯国璋例外。
第二年，清廷模仿袁世凯，要建一所完完全全属于自己的陆军贵胄学堂。学员清一色满人蒙人，目的就是要培养满蒙的高级军事人才。
可谁来做这学校的总办呢？朝廷在满蒙人中找了个遍也找不出一个合适的人选来。因为这人不但要有带兵、实战的经验，还要有治军才能，特别得有最先进的军事理论知识。
要找这样的人已经是很不容易了，在上述条件的基础上还得再加上一条，就是必须对清廷忠心耿耿。因为这诸多条件，满蒙人中找不到，汉人中提了许多名也得不到几个赞同的。只是到了后来，当有人提到冯国璋时，情况就截然不同了。
首先是朝廷重臣荫昌立即赞不绝口，接下来是当时清廷的排汉代表、少壮派军官良弼，竟然也对冯国璋推崇备至。有了这俩人投赞成票，冯国璋很快做成了陆军贵胄学堂总办。
冯国璋能得到满人的一致推崇，这与他平时的为人分不开。
对他推崇备至的良弼，是大清开国大功臣多尔滚的后代，毕业于日本士官学校，壮志凌云，决心效仿日本明治维新，重振大清。朝廷练兵处成立，良弼立马调集各地士官生，以此来对抗北洋派，由此与北洋派磨擦不断。
有一次，良弼同军令司的一名军官发生争吵，弄得军令司正史段祺瑞很生气，一时控制不住，当众指责良弼说：
“良大人，你的手是不是伸得太长了些，我们军令司的事，也要让你来插？”
良弼身为王室之后，何人敢如此斥责他，一时恼羞成怒，大声与段祺瑞理论起来。段祺瑞生性耿直、脾气较大，而且手握重兵，岂能容得了一个少壮派军官在自己面前高声大叫，便猛一拍了桌子，指着良弼怒斥道：
“你不要在这里吵闹，这是我的地盘，不欢迎你！”
良弼听了，顿时羞得满脸通红，气得浑身发抖。他何曾受过这般羞辱，两眼瞪瞪地看着段祺瑞，眼看着更大的冲突就要发生。这时，身为军令司副使的冯国璋闻讯赶到，看了段祺瑞一眼，一手拉着良弼，一边拥着他往外走，一边赔着笑脸说：
“赉臣啊，你可别跟芝泉在这种事上生气，他这个人就这脾气，不是冲你一个人，他和我也经常这么的。我们走，我请客，喝酒去！”
就这么连推带劝，冯国璋使良弼下了台阶，也保住了面子，一顿酒之后，良弼对冯国璋说：“你这个人，行！今后一定比那姓段的混得好。”
良弼一句无心的话，没曾想后来倒成了真，到黎元洪下台后，冯国璋的职位还真跟段祺瑞的掉了过来。这是后话。早些年，冯国璋在做驻日本公使裕庚的随员时，就是利用随员的身份，结识了日本军界的一些能人，为他“兵书”的编撰提供了方便和帮助。现如今，他做了陆军贵胄学堂总办，权力提升倒是其次，有了这顶官帽，便有了许多接近满蒙亲贵、朝廷政要的机会，这对于冯国璋仕途的发展，这可是大有裨益的事情。
特别好的美事还有，学堂附设了个王公讲习所。授课的主讲老师，就是他冯国璋这个学堂总办。常给王公亲王们讲课，与这些掌控大清国臣子，特别是汉臣的王族们的关系，自然就密切了许多。再加上，关于军事科学，冯国璋本来就深有研究，如今站在讲台上，引经据典、深入浅出、娓娓道来，使得那些王公亲王们，一个个屏息禁声、伸脖子瞪眼、听得津津有味，对冯国璋的渊博军学，无不翘指夸赞。
本来就已经得到清廷的认可，如今又得了王公亲王们的欣赏，冯国璋的仕途，在袁世凯及其属下受妒忌而被打压时，仍能一枝独秀，一如既往地节节攀升。
1906年，冯国璋任陆军贵胄学堂总办的同时，被授正黄旗蒙古副都统。年底，清政府在河南彰德举行南北两军第二次秋操，又做南军审判长。1907年，清政府陆军部附设军谘处，冯国璋在众多王公亲王们推荐下，出任军谘处正使。
接下来的1908年，到了11月14、15日这两天，光绪皇帝和慈禧太后，这一对生前的冤家祖孙，竟都相邀着在20小时内先后离开人世，冯国璋有幸当上清西陵梁格庄值班大臣。
这对冯国璋来说，自然是件天大的好事，清廷把老祖宗的墓地都敢交由他来负责，足见对他的信任。可是，由于光绪皇帝的死去，也发生了件令冯国璋非常担心的事情。
因为光绪皇帝的死，醇亲王载沣的儿子溥仪做了嗣君。这载沣，正是光绪的亲弟弟。冯国璋知道，光绪帝被囚于瀛台，维新六君子被杀，都与袁世凯的告密有关。这回因嗣君溥仪年级尚小，按照祖例，由父王载沣监国摄政。
“这载沣，是一定会报袁世凯‘出卖’他哥之仇的，袁世凯性命甚忧！”冯国璋这么想着，额头上急出星星点点的汗珠。
紧接着发生的事情也确实如此：载沣执政后的第一件事，就是要除去袁世凯。实际上这是件于公于私他都得做的事情。
于公来说，当时全国有战斗力的军队的军权几乎都掌握在汉族将领手中，特别是袁世凯掌管的北洋新军，形成尾大不掉之势。于私，对袁世凯出卖光绪，载沣早就已经恨之入骨，非欲除之而后快。
可是，当他与大臣商量怎样除去袁世凯时，许多人都说不能杀，大家担心杀了袁世凯会引发北洋新军大乱。载沣本来就生性懦弱，听了大臣们的意见，正在犹豫，袁世凯自己来了，提出有足疾，需回家养病。
这一来载沣松了口气，正好借此解除袁世凯的一切官职，让他回籍养病。
有足疾一说，实际上是袁世凯有意为之。对于载沣做了摄政王后自己的危险处境，对于怎样才能化险为夷，袁世凯其实早已成竹在胸。
就这样，袁世凯运用智慧以退为进，主动请归故里，免去一场灾难，当他举家离京时，与昔日权重一时、处处八面威风的种种场面相比，未免显得有些凄凉。瞬间成了一介平民的袁宫保，往日的同僚属下因恐于当朝的摄政王载沣迁怒，此刻一个个都藏匿在家，就是想也不敢前来送行。
深谙世故的袁世凯，当然知道会是这样的结果。他神定气闲、微闭双目，安然地坐在车里。
“大人、大人！”
竟还有十分恭敬的声音在呼唤，袁世凯睁开眼来，面前站的果然就是冯国璋。
“我就知道你会来，只是你还是不该来。”
“我应该来。”
“是应该来，但还是不该来，因为我知道你。”
听到自己的恩人这么说，冯国璋感动地流下泪来，颤声地说：“大人此去保重，我会常来看你的。”
“一定不要来。”袁世凯肃然地说，见冯国璋一脸困惑，这才又补充道：“有事时，我会派人来找你。有什么新的趣事，你只需派个人来相告一声就行。”
“这……”
“必须这样，也只能这样！”
冯国璋这才番然醒悟，连连点头。
“我今日如此，影响你们发展了。要多加注意，尽量减少我对你们的影响。北洋复兴，该是有日的。”袁世凯最后一句，说得斩钉截铁。
载沣早在18岁这年（1901年），曾为庚子年德国公使克林德被杀事件出使德国，向德国皇帝赔礼道歉。正是这个吃力不讨好的差事，使年轻的载沣得以见到西方的军校、军火企业、博物馆、电机厂、造船厂，由此大开眼界。当时的载沣，“举凡外洋风土人情，随地随时留心考察”。
袁世凯“开缺回籍”后，载沣决心效法德国，紧锣密鼓地采取一系列军事措施，为的就是加强清皇室对全国军事力量的控制。
为此，他下达了一连串的命令：编练禁卫军，作为直隶摄政王的亲军；裁撤近畿各省的新军督练公所，近畿各省新军均归陆军部统辖；贵胄学堂，专收满人……到1909年，他干脆代皇帝任全国陆海军大元帅，宣布统一全国军政大权。
如此般条条命令，种种作为，就是要让清室控制军队。他任用满人载泽、毓朗、善耆等掌握建立新军事务；任命桂良、风山为江宁、广州将军，荫昌为陆军大臣；委派胞弟载洵、载涛分赴欧美各国考察陆海军……
如此一来，在这段时间中，汉族官员们一个个除了受到排挤压制，压根就没有升迁的可能，特别是袁世凯旧部的军官们，差不多个个都遭到贬黜，就连备受清廷推崇的段祺瑞，也被明升暗降夺去了兵权。
1910年5月25日，清廷以段祺瑞督办北洋陆军学务有功，赏头品顶戴。12月18日，又加侍郎衔，外放任江北提督，留驻江苏清江浦，负责本地治安。
惟有冯国璋，都处贬黜之外。1909年，军谘处改为军谘府，冯国璋还擢升军谘使，恰逢宣统登基，再加封一级。此前冯国璋就任清西陵梁格庄值班大臣时恩诏加一级，同年底因效忠清廷，恭逢恩诏又加一级，如此连加三级，这在北洋派里绝对是绝无仅有的。
载沣对冯国璋的器重，由此可见，其趋势，大有以他冯国璋来代替袁世凯。能得到载沣如此重视，冯国璋自然是分外珍惜，在军谘使的职位上，他倾尽智慧和经验，就中国当时的练兵方法、军事教育的加强、军队素质的提高，以及认识利用中国地理条件、改置军事区划，等等方面都作了精辟分析，提出了必要的改进措施。
遗憾的是，此时的载沣，为加强清皇室对全国军事力量的控制，任用依靠的一群满清亲贵，大都是些无能却权欲极重的庸才。冯国璋的洋洋数万言的改进措施，一句也得不到采纳。
这对冯国璋来说，是一个沉重的打击，对清廷失去信心。从这以后的一段时间里，他“钳口结舌，随声画诺，不复言天下事了”。
而载沣的一套亲贵揽权的做法，结果不但达不到巩固清室江山，加强皇室地位的目的，反而是加快了清王朝的覆灭。
对清王朝心灰意冷时的冯国璋，刚到知命之年，正是干大事的时候，满腹经纶、壮志凌云，却无施展才华之地，于是乎越发地怀念起自己的大恩人、老上司袁世凯了。