陈务笃说：“我看坏就坏在司令搬到‘惠安’号时，没有降下‘永嘉’上的令旗，而‘惠安’上又没有及时升起令旗，有些舰长就误会了，以为司令还在‘永嘉’上呢。‘永嘉’一跑，很多舰只就盲从，像‘楚日’舰就是这样。”陈务笃又将“楚日”舰经过他时，舰长说的话重复了一遍。
林遵一听如梦初醒，后悔不已。这时，参谋长戴熙愉急忙建议道：“假如是误会，我们就用报话机叫他们，也许能把他们叫回来。”
毛泽东与张爱萍（左三）等人接见林遵（左五）时的合影
林遵说：“那好哇！你快通知报务员，用报话机叫他们回来。”
陈务笃说：“司令自己叫，不然他们不相信。”
于是，林遵就用报话机喊话，叫各舰立即回来。听到司令的喊话的声音，那些尚未走远的受骗上当的舰艇都调转方向，驶回来了。
当天晚上，林遵派参谋长戴熙愉亲去浦口，找到了三野三十五军联络部长张普生。张普生握着戴的手说：“我们知道你们起义，可是到处找不到你们。现在你们来了，我们热烈欢迎！”
1949年4月23日，国民党海军第二舰队“惠安”、“江犀”、“联光”、“太原”、“吉安”、“永绥”、“楚日”、“安东”、“美盛”9艘军舰和第一、第二两个机动炮艇队宣告战场起义，弃暗投明。
随后，由于飞机轰炸，各舰按照指示拆下轻武器和仪表，起义人员撤到旧海军总部。不久，这些军舰都被飞机炸沉。
1949年5月，中国人民解放军海军建立，林遵任第一副司令。1959年任中国人民解放军南京军事学院副院长。1974年任东海舰队副司令。1979年7月病逝于上海。
蒋介石的杭州机场会议
江阴要塞失守后，蒋介石立即通知南京的军政要员们速到杭州机场开会。4月22日清晨，李宗仁偕同何应钦、白崇禧、翁文灏、张群、顾祝同、周至柔、桂永清、吴忠信、黄少谷等飞往杭州，人人怀着紧张不安的心情，齐集笕桥空军学校会议室内。在凝重的气氛中，翁文灏低声问李宗仁：“自从政变以后，3个多月来，你还是第一次同他见面，还主张打下去吗？”
李宗仁也低声说：“不，不，不能说是政变，给他们听到，我又吃不消了。”他苦笑：“至于打下去，翁者有高见吗？”
翁文灏忙摇手说：“我什么意见都没有，我只是奉命前来。”正说着，蒋介石拖着病弱的身体，手持拐杖缓步而来，蒋经国、陶希圣左右侍候，背后一大堆侍卫官。双方一番寒暄，两旁坐下，蒋介石朝众人苦笑一声，强打精神说道：“现在，这个，这个局势，大家都看到的了。我以为没有关系，我们还有大西南大后方做基地，还有几百万人，还有海空精兵，比共军当年在延安时好得多，而且我们还有美国援助，大家，大家不必灰心。”
众人闻言，齐在心头叹气。接着讨论南京，上海要不要守？结果讨论纷纭，最后蒋介石说：“这样吧，守南京似乎不易，上海非守不可，我们在上海的准备，共产党有300万人马也攻不进，我认为应该守住上海，以及沪杭路一带。”他吃力地说：“长江，给他们过了；钱塘江无论如何要守住！浙赣路，是我们今天的主要防线，大家有什么意见？”
何应钦叫嚷道：“我们要抵抗到底！”
蒋介石说：“对于共军不是抵抗到底，而是戡乱到底。”
李宗仁说：“我认为今日之下，过去我们苦守据点的战略该检查检查，是否合适。守据点本来不错，无奈一个个据点都给对方吃掉，这就说明了这个战略毛病百出！我主张从今以后要同共产党从事机动作战，再也不能打阵地战了。”何应钦对此也表示赞同，主张今后以打运动战为宜。
我军在南京市郊追击敌人
蒋介石对李宗仁的意见却不以为然，反问道：“那么南京非放弃不可了？”
李宗仁硬着头皮反问：“如果不放弃，汤司令有妙计可以挽回劣势吗？”
“今天不是个人问题了，”蒋介石知道李宗仁同汤恩伯之间的摩擦，冷冷地说，“李代总统都不能想个办法守住长江，汤司令怕更没用！”
会议正在进行期间，前方又打来电话报告说：“沪宁线已被共军切断，在西起湖口，东至江阴的千里战线上，国军不是被围，就是在后撤，南京危在旦夕。”蒋介石随即命令：将南京的火车站、码头，水电厂都炸掉，把所有的部队都撤到沪杭一带。这仍是他持久坚守淞沪，重点经营台湾，等待第三次世界大战，伺机反攻的方针。
会后，蒋介石又同李宗仁进行了单独谈话：
蒋：南京沦陷后你准备去哪儿？
李：我？当然去广州啦。
蒋：对于和谈还有什么打算？
李：我准备再派人去北平商讨一次。
蒋：不用了，不必再谈了，过去共产党因为在军事上没有部署好，所以才同意和谈，现在他们已经渡江，再没有谈判余地了。
李：你当初要我出来，为的是和谈，现在和谈已经决裂，南京马上就要失守，你看怎么办？
蒋：你继续领导下去，我支持你到底，不必灰心！
李：你如果要我继续领导下去，我是可以万死不辞的。但是现在这种政出多门，一国三公的情形，谁也不能做事，我如何能领导？
蒋：不论你怎样做，我总归支持你！
4月22日傍晚，李宗仁返抵南京“坐镇”。这时南京城内已闻解放军枪炮声。李代总统在南京的这最后一夜，“辗转反侧，未能成寐”。4月23日清晨，李宗仁就乘飞机逃亡桂林去了。虎踞龙盘的金陵古城，当日即获得了解放。风雨苍黄，世道沧桑，蒋家王朝已不复存在了。
24日上午，人民解放军第三十五军从浦口渡江在人群夹道欢呼声中进入南京城。码头的里里外外拥满了欢迎的人群，穿着各式服装的工人与市民，男男女女的大、中学生，还有南京治安维持委员会的工作人员，迎着解放军夹道欢呼：“欢迎解放军解放南京！”“解放军同志们辛苦了！”“中国共产党万岁！”“毛主席万岁！”
庄严整齐的解放军队伍，沿着中山马路阔步行进。太阳高高地升起在紫金山上空。马路两旁满是欢迎的人群。许多楼房的窗口，探出人头，露出一张张的笑脸。有人向解放军挥手，有人扔出雪片似的花纸；许多工人、学生热情地跑上来，和战士们握手，他们激动地说：“天天盼，夜夜盼，终于把你们盼来了！”
三首长齐聚总统府
25日这一天，中山门两旁人山人海，红旗如林，锣鼓震天。学生们扭着秧歌舞，打着腰鼓；工人们举着“天亮了！”、“解放了！”的标语。鞭炮在空中炸响，彩花在头上散落，人们潮水般的涌向街头，欢迎人民的队伍，庆祝南京解放。
4月27日，总前委领导人邓小平、陈毅来到南京，总前委机关也从合肥移驻南京城。
4月28日，总前委宣布成立中国人民解放军南京市军事管制委员会，任命刘伯承为主任，宋任穷为副主任。可是，此时的刘伯承却还正在匆匆赶往南京的路上，他没有想到南京解放得如此顺利。
1949年4月23日，我军解放了国民党反动统治中心——南京，宣告了“蒋家王朝”覆灭。这是我军占领国民党总统府的情形
4月29日，刘伯承风尘仆仆从安徽桐城第二野战军指挥所赶到浦口，望着苍茫之中的扬子江，刘伯承感慨万千。想不到国民党军队这么不堪一击，原来总前委决定，陈赓的第四兵团协同进攻南京，可是现在只从正面一打，南京就解放了。
刘伯承一行人踏上轮渡，登上南岸。由于临行仓促，没有事前与南京守备部队取得联系，所以一下船却不知该去何处。他们只好包租了一辆公共汽车，等到大家上了车，警卫员突然拍着右额大叫一声：“唉呀不好，还没有叫人号房，这么大的一个南京城，车子该往哪里开呢？”
刘伯承一听，呵呵大笑，说：“到了家门口，反倒找不着家了。”他略一沉思，果断地说：“直开‘总统府’，到了那里就好办了。”
果然，一到总统府，就与南京警备部队联系上了。陈毅闻讯，亲自坐车赶来。两人一见面，陈毅就说：“想不到你这个南京市长，乘公共汽车来上任，对不起得很。”
5月1日。在南京“人民大会堂”里，中共中央华东局召开了解放区与地下党干部的会师大会。华东局和第二、第三野战军的领导邓小平、刘伯承、陈毅等出席了大会。会场里洋溢着热烈、欢乐的气氛，口号声，歌唱声此起彼落。
邓小平代表华东局讲话。
陈毅代表第三野战军讲话。
刘伯承代表第二野战军讲话。
刘伯承说：“国民党22年的反动统治被推翻了，中国人民渴望的日子到来了！然而，正像毛主席教导我们的：‘这只是万里长征走完了第一步。’我们要把革命进行到底，要下苦功夫，花大力气，建设人民的新南京。”
5月9日，南京市人民政府成立的前一天，坐落在市中心的南京市人民政府大院里张灯结彩，喜气洋洋。一块印着“南京市人民政府”字样的闪闪发光的大牌子，被人们抬进办公室。刘伯承见此点头表示满意，诙谐地说：“我这个市长走马上任，理当有一篇就职演说吧！”
当天，刘伯承专门召集市政府局长以上干部开会，发表了一篇精彩的就职演讲。
面对即将管理南京的数十名干部，刘伯承说：“南京在4月23日解放，从这一天起，国民党反动统治中心南京就成为人民的南京了，南京的人民大众在共产党领导之下，从这一天起由被统治者变成统治者了。国民党集中表现的帝国主义、封建主义、官僚资本主义的统治，在南京永远被消灭了，从此南京将永远成为人民的南京。因此，23日这一天是一个划时代的日子。”
国民党在南京的军事抵抗结束了，但是斗争仍然非常尖锐。刘伯承谈到这些，语调变得严肃起来。他说：“现在我们是胜利了，敌人是失败了，但敌人失败不等于完全停止抵抗，相反地，是企图从各方面继续抵抗。现在敌人一般是由集中的公开的转为分散的和隐蔽的斗争形式，来反对中国人民争取中国成为独立自主、富强繁荣的国家。尤其是南京解放不久，潜伏的敌特会用各种办法来反对人民的统治，如造谣破坏、挑拨离间，利用各种合法名目一面掩护活动，一面破坏我们和民主人士的合作。所以在军事管制中必须加强警惕。不仅要注意公开拿枪的敌人，而且要注意隐蔽的不拿枪的敌人，以确保人民民主秩序迅速建立。”
解放军占领南京，没有费多大的力气，然而要把南京建设好可不那么简单。解放前，南京是蒋宋孔陈四大家族鲸吞豪夺的指挥中枢，成为畸形的、消费型的城市。它的特点是工厂少，衙门公馆多；工人少，公务员多。少数“国营”工业，多属官办消费性质，半殖民地色彩尤为浓厚。解放后，官僚企业陷于停顿，公务人员闲散街头，私营企业开工不足。致使失业人数急剧增加，要求就业、复业与救济的比比皆是。
步兵乘汽车进入南京
作为南京市军管会和市政府的主要领导人，刘伯承对大家提出了今后的任务：“我们今后要做什么？首先是要进行生产建设并作为中心工作。自然，我们军管会首先要把南京顺利地接下来才能好好地管，而管就要把官僚庞大消费的南京逐渐变为人民生产的南京，这就是如何实行毛主席指示我们的经济纲领中的发展生产、繁荣经济、公私兼顾、劳资两利。”
刘伯承毫不留情地批评政府工作人员中滋长起来的严重脱离群众、贪图享乐、甚至腐化堕落的现象。“我们的干部一到南京，骄傲蜕化的现象已经发生。……不要忘了我们的母亲是谁，敌人就隐蔽在我们的卧榻之侧，窥伺我们，挑拨我们，使我们脱离群众，以便打倒我们。我们一定要警惕起来，与这些恶劣倾向作斗争，尤其要以此作为教训，丝毫不能放松，让它们发展。”