仇士良控制朝政以后，愈加专横跋扈，气焰嚣张。“迫胁天子，下视宰相，凌暴朝士如草芥。”
郑覃、李石相继拜相后，每逢在延英殿议事，仇士良总是旁若无人之姿，凌驾于两宰相之上。两宰相欲有所奏，常常要遭到仇士良的斥责，并以李训、郑注事相批驳。不过，两宰相偶尔也与其针逢相对，反问：“训、注为乱道，但不知训、注始因何人得进？”仇士良无言以对。
仇士良专于朝政，其爪牙也跟着“鸡犬升天”，他所统领的禁军恣意横行，强暴朝野。京兆尹张仲方出于对仇士良的畏惧，对禁军的胡作非为连问都不敢问。宰相以其不胜任，而奏请改司农卿薛元赏代其为京兆尹。薛元赏常去李府拜会李石，一次，他刚到府中，就听见李石在厅中与人争辩甚烈，便让人前去窥视，回秉说对方是位神策将军。薛元赏便快步走入厅中，对李石说：“相公辅佐天子，纪纲四海，今近不能制一将军，使无礼如此，何以镇服四夷！”遂命左右将那神策将军擒住，押往下马桥听候发落。待等薛元赏来到下马桥，那将军已被脱去衣服，跪在道旁听候处置。这时，已有其党羽飞报仇士良，仇士良匆忙派一宦官赶来，说仇中尉请京兆尹前去有事相商。薛元赏说：“属有公事，行当继至。”遂命杖杀了那个将军。然后，薛元赏换上待罪的素服去见仇士良。仇士良盛气凌人地质问：“痴书生何敢杖杀禁军大将？”薛元赏说：“中尉大臣也，宰相亦大臣也，宰相之人若无礼于中尉，如之何？中尉之人无礼于宰相，庸可恕乎！中尉与国同体，当为国惜法。元赏已囚服而来，惟中尉死生之！”薛元赏理直气壮，且又有节制，使得仇士良顿减了几分威风。他想，军将已死，无论如何也不能死而复生，薛元赏之举亦符合法度，难于强加其罪。于是，他命人备酒设宴以酬元赏。仇士良变满腹恼怒为强作欢颜，变欲加其罪为以酒酬赏，愈发显示出其狡黠无比。此举，既可笼络人心，亦可粉饰自己，同时还掩饰了他图谋报复的阴险心理。
开成元年（836年）夏，文宗临朝紫宸殿，宰相因奏事拜谢，外面便立即风传：“天子欲令宰相掌禁兵，已拜恩矣。”由此弄得朝廷内外气氛极度紧张。世人皆知仇士良的残暴狠毒，不禁人心惶惶，京都士民连续多日不敢解衣就寝。面对一触即发的危急形势，李石为了息事宁人，便忍辱负重上奏文宗，请召出仇士良等，当面解释此事，才避免了一场险风恶浪，其实，仇士良未必不知传言纯属虚无，但他却推波助澜，并列出箭在弦上之事，弄得上至天子、宰相，下至官吏、百姓无不为此惶惶不可终日，这是他有意为之，意在威胁君臣莫做削其权势之梦，同时也是向天下张扬其权倾朝野之威，以利其稳固朝政。
仇士良如此欺君抑相，文宗又无可奈何，于延英殿叹息地对宰相说：“朕每与卿等论天下事，则不免愁。”甚至悲戚道：“有势未得行者，退但饮醇酒求醉耳！”李石等亦无能为力。不过，李石还是时常与仇士良抗争的，力图振举朝纲，以强皇权。因此，仇士良对李石恨之入骨，可又无法公开将其除掉，于是便采取了暗杀的卑劣手段。
开成三年（838年）正月，李石骑马入朝，中途突然遭到刺客用箭射杀，左右侍从惊呼而散，幸而伤势不重，马受惊后驮其疾驰回府。不料府第坊门处又有埋伏，刺客挥刀砍来，马尾被砍断，人幸免遇害。文宗闻听大惊，命神策遣兵护卫李石，并下诏追捕刺客，然而毫无所获。致使百官入朝胆战心惊，甚至有些官员都不敢入朝。过了数日才稍微安定了些。李石非常清楚，此次暗杀乃仇士良所谋划指使。为了免遭杀身之祸，李石决定避位告退。李石数次向文宗上表说自己有病，请求辞去相位。文宗深知李石辞职之缘故，亦爱莫能助，只好让他仍挂相衔，出任荆南节度使，这样，朝廷又失去了一位令宦官们畏惧的宰相。仇士良等人就更恣意横行了。
开成四年（839年）十一月，早患风痹的文宗，身体每况愈下，一日，他坐在思政殿，思前想后，不免暗自悲伤，召来当直学士固墀，问其自己可与前代何主相比。周墀违心说他乃尧、舜之明君。文宗说：“朕岂敢比尧、舜！所以问卿者，何如周赧、汉献耳！”周墀惊道：“彼亡国之君，岂可比圣德！”文宗道：“赦、献受制于强诸侯，今朕受制于家奴，以此言之，朕殆不如！”所谓家奴，就是指仇士良这帮窃权的宦官。文宗言毕，不禁泪沾衣衫。堂堂的一国之君，居然让家奴欺侮到如此地步，足见仇士良猖獗奸佞之甚！
开成五年（840年）正月，文宗病情加剧，自知已朝不保夕，便命知枢密刘弘逸、薛季陵和宰相杨嗣复、李珏入禁中，商议奉太子监国。开成三年（838年），太子永神秘地暴死。尔后，在宰相李珏的力主下，文宗立敬宗之子陈王成美为皇太子。如若太子监国，那就意味着皇位继承人的最后确立。仇士良等惟恐“太子之立，功不在己”，于是以太子年幼且有疾为由，主张“更议所立”。宰相李珏驱斥道：“太子位已定，岂得中变！”仇士良等自行起草矫诏，立文宗弟颖王为皇太弟，代文宗掌管国家大事。并率兵将颖王迎至山阳院，命百官谒见于思贤殿。宰相李珏等见事情已被仇士良操纵，无法挽回，也就只好听之任之。
两天后。33岁的文宗驾崩于太和殿。皇太弟继承皇位，是为武宗。仇士良以文宗之名，行自己之意，轻易地废掉了太子的继承权，而拥立颖王即位。在他看来，颖王本无皇位可言，是他替其夺来的，那么，颖王自然会感恩于他，宠幸于他，他就仍可以继续把持朝政，武宗不过像文宗一样是个傀儡而已。