（1）连锁书店自身的优势。连锁经营带来的规模效益是其他业态形式所不能比拟的。连锁经营自身的灵活性使人们能按照自己的需要灵活地选择经营模式，如经营初期发展正规连锁，成熟期发展特许加盟连锁。连锁书店在满足读者需求上也有优势，它庞大的销售网络能更全面地收集读者需求信息，而连锁总部的实力又使快速配送成为可能。
此外，不论独立书店还是连锁店，店堂位置都非常重要，而连锁书店的资金优势使它能获得最佳的店堂位置。
（2）连锁书店与出版社的特殊关系。从明处看，连锁书店是利用其规模和数量优势从出版社获得低折扣，但实际上它还从与出版社的合作宣传和广告中隐蔽地获利，而独立书店则无此优势。
（3）定价的放开使独立书店失去了保护伞，却对连锁书店有利。由于政府不再规范定价，连锁书店可根据销售策略随意打折，尤其是在销售旺季。这种做法使大多数独立书店因其价格劣势而生意惨淡，最后不得不宣布破产，而连锁书店却因其价格优势而生意喜人。