因为担心自己会被库布里克逼得丧失理智，尼科尔逊在拍用球棒打死哈罗兰这场戏之前，要求为克罗瑟斯找一个替身。库布里克随即在整个伦敦寻找与克罗瑟斯身材相仿的替身演员，条件是能经受得住击打。最终他选中了一位刚刚人行的年轻演员，但经纪公司担心会出现伤害事故，特地派了一名秘书跟到片场。结果，库布里克并未使用这名年轻人，而是让这位秘书又当了他的替身。
库布里克在现场很少指挥尼科尔逊，这让一位前来实习的录音师大为失望，本来他希望能学到库布里克指导演员的方法。有一次，当库布里克叫停并让尼科尔逊跟他一起喝茶时，这位录音师偷偷调大了尼科尔逊佩戴的无线麦克的音量，结果听见库布里克在对尼科尔逊说，“你注意到了那个茶水女郎的胸脯了吗？”
继《2001年太空漫游》之后，《闪灵》是库布里克第二部同步拍摄幕后纪录片的电影。纪录片的导演和摄影是库布里克的女儿维维安，当时她只有18岁，野心勃勃地想从事电影这一行。她没受过任何专业训练，库布里克认为学习电影的最佳途径就是身体力行地拍一部电影，他给了女儿一台16毫米摄影机，告诉她想怎么拍就怎么拍，但他会参与最终的剪辑。因为是库布里克的女儿，而且既聪明和漂亮，所以维维安能够在片场畅行无阻，甚至拍到了尼科尔逊在化妆间里脱裤子以及和剧组成员聚在一起吸可卡因。《拍摄<；闪灵>；》这部纪录片最终由老鹰影片公司发行，并在英国电视上播映过。库布里克删掉了其中一些有关他自己的画面，将该片作为《闪灵》的宣传片在海外放映。然而，维维安并未因此实现拍电影的梦想，她的下一个也是最后一个涉足电影的举动就是担任《全金属夹克》的作曲。
杰克在旅馆和迷宫里追杀温迪和丹尼的一组戏用到了斯坦尼康，库布里克雇来了发明斯坦尼康的盖瑞特·布朗亲自掌机，而约翰·阿尔考特只负责照明。-由于习惯了亲自操控摄影机，库布里克养成了一个陋习，当布朗工作时，他会下意识地握住机柄，一边晃动一边说“往左来一点，往右来一点”。布朗警告过他不要影响他的工作，但库布里克根本听不进去。
为了让库布里克改掉这一陋习，米尔索姆建议布朗从维维安那里下手，因为他知道库布里克只听女儿的话。于是，高大魁梧的布朗故意当着维维安的面说，“你知道吗？我曾经打断过西尔维斯特·史泰龙的鼻子。”
“为什么？”
“他总是抓住斯坦尼康的机柄摇来晃去，结果有一天我忍无可忍将他教训了一顿，从此他再也不敢了。”
第二天，布朗高兴地看到库布里克的手从机柄上拿开了，说话的语气也变成了“劳驾，你能往左移一点吗？”
在看了布朗拍摄的样片后，库布里克嫌拍摄的角度太高，尤其在跟拍丹尼时，他希望摄影机能擦着地面前移。“我试过端着摄影机尽可能低地拍摄，”布朗说，“但很难保证镜头在一个水平线上。”
库布里克建议用他在拍摄《发条橙》时使用过的轮椅。这样，当布朗坐上去时，镜头可以只离地面1英寸，而且相当平稳。由于还要坐上录音师和负责为摄影机调焦的米尔索姆，库布里克专门定做了超大号的轮椅，需要几个人才能推得动。最后，他自己也坐上去了，普通的轮胎无法支撑这么大的重量，于是他又派人装上了特制的坚实轮胎，这辆“库布里克号”轮椅也成了电影史上的一大奇观。
《闪灵》原定17个星期的拍摄周期先是翻倍，接着又延长了3倍的时间。当拍到谢莉和丹尼逃出旅馆跑进雪地的那场戏时，库布里克已经能在真正的冬天里拍摄了，因为这时已接近圣诞节。库布里克原本打算让摄制人员与摄影机为伴，而不是回家度假。这一提议立刻遭到了拒绝。
早在两年前，史蒂文·斯皮尔伯格就预定要在榆树片厂拍摄《夺宝奇兵》，之后还有沃伦·贝蒂的《赤色分子》，但片厂经理不难看出《闪灵》起码要拖到1979年的春天。更令他们担心的是，库布里克的电影由于使用了大量照明灯具，拍摄现场的温度急剧升高。即便空调机开足马力，加起来700万瓦的照明灯也能使现场温度高达43度。
最终布景着火，不仅烧得光光的，还把片厂的屋顶烧出了一个大洞。由于只剩下几个特写镜头要拍，榆树制片厂希望库布里克马上撤出，但库布里克却坚持要重新搭建毁坏的布景。
主体部分的拍摄直到4月才告一段落。安吉丽卡·休斯顿前来与尼科尔逊会合，恨不能马上将他带离这个“魔窟”，因为她发现尼科尔逊几乎变得认不出来，每天坚持到晚上10点才结束的拍摄使他筋疲力尽，回到旅馆倒头就睡。
8月，泰晤士电视台的戈登·斯坦福思接到召唤，将协助库布里克和雷伊·洛夫乔伊一起剪辑《闪灵》。库布里克决定将剪辑机房设在查尔德威克伯里，将堆积如山的胶片搬进了家里的储藏室，这里不仅没有温控设备，而且拥挤不堪。更可怕的是，由于合成还需要在榆树片厂做，所有经过剪辑后的胶片必须运回到片厂。库布里克临时雇来了6名剪辑助理，他们每天的工作就是在查尔德威克伯里和榆树制片厂之间来来回回地运送胶片。
直到1980年春天，剪辑工作才宣告结束。库布里克开始着手配乐，他又一次决定不找人谱曲，而是在现代古典音乐中寻找素材，尤其是东欧的音乐。格里高利·利格蒂曾因《2001年太空漫游》篡改他的音乐而将米高梅公司告上法庭，但此刻他已经不再计较，同意库布里克将他的“咏叹调”部分地用于这部电影。库布里克还截取了贝拉·巴托克“为弦乐器、打击乐和钢片琴而作的音乐”中的部分乐章，而主旋律则出自波兰作曲家克日什托夫·彭德雷茨基之手，他的音乐一直很适应电影，曾经影响过杰里·戈德史密斯等好莱坞作曲家。彭德雷茨基的合唱曲，尤其是他创作的弦乐，缔造出了一种恐慌的气氛，配以旅馆内的追杀场面是再好不过。
华纳兄弟公司要求该片于当年夏天上映，朱利安·塞尼尔尽可能用外交辞令敦促库布里克加快进度。多亏音响和剪辑部门加班加点，合成只用了11天时间。临近结束时，库布里克又提出要修改，删掉了一、两个画面，而每次改动都需要重铺音乐。
在《闪灵》剪最后一版时，《夺宝奇兵》进驻榆树片厂。此前的那场大火令斯皮尔伯格和乔治·卢卡斯受益匪浅，他们得以掀掉屋顶，加高了摄影棚天花板的高度，以便有足够的空间搭建两尊阿努比斯神的塑像。片厂的化妆间里放进了养了数千条蛇的大缸。摄影棚的地板被抬高了7英尺，地板下面是运来的沙子和蛇，这些蛇有些是用塑料做的，有些则是真的，但并非毒蛇。哈里森·福特和卡伦·艾伦将在这里上演从蛇窟里逃生的那场戏。
维维安是动物保护主义者，她确信这些蛇受到了虐待，因为她亲眼看到摄影棚外面有扔出来的死蛇。于是她向动物保护组织提出申诉，要求中止《夺宝奇兵》的拍摄。然而，维维安绝非老道的斯皮尔伯格的对手，当动物保护组织派人实地调查时，他们看到的是一排排摆放整齐的塑料水箱，每只水箱里只有3、4条蛇在悠然自得地游来游去。库布里克也专门从查尔德威克伯里赶来察看。“每当有此类丑闻发生时，斯坦利总是站在维维安这一边，”斯坦福思说，“这件事令他与斯皮尔伯格之间的关系迅速恶化。我清楚地记得斯坦利一边掐灭手中的雪茄，一边咬牙切齿地说，‘史蒂文是个滑头。’”