历史上率先提出日本开国神武天皇为中国人的，是中国清代同治年间（1862——1875年）驻日公使馆一等书记官黄遵宪。他在所著《日本国志》一书中指出:“至徐福之事……今纪伊国有徐福祠，熊野山有徐福墓，其明证也。日本传国重器三，曰剑、曰镜、曰玺，皆秦制也。君曰尊，臣曰命，曰大夫、曰将军，又周秦语也。自称神国，立教首重敬神；国之大事，莫先于祭；有罪则诵禊词以自洗濯，又方士之术也。崇神立国，始有规模，计徐福东渡已及百年矣，当时主政者，非其子孙殆其党徒欤？至日本称神武开国基，盖当周末，然考神武至崇神，中更九代，无事足记，或者神武亦追王之辞乎？”
台湾学者卫挺生所著《徐福入日本建国考》一书于1977年在日本出版，书名即为《神武天皇——徐福传说之谜》，副题干脆就叫《神武天皇即徐福》。徐福即神武天皇的观点得到了昭和天皇的弟弟三笠宫的赞同。他在香港徐福会成立的贺词中动情地说：“徐福是我们日本人的国父。”日本前首相羽田孜先生也多次表示，羽田家族来自中国，祖先是徐福。他曾于2002年专程到连云港市赣榆县徐福村祭奠。在日本，徐福是作为日本先民的引导者和日本文化的开拓者的形象出现的，因此日本各地对于徐福的崇敬程度更要超过中国，由这种崇敬心理而引发的祭祀活动，更是层出不穷，热闹红火。
现在多数日本人倾向于认为日本开国天皇是中国人徐福。
近年来，国内外关于徐福的研究方兴未艾，一个个谜底得以破解。譬如徐福的出生地，共有三处，即江苏的赣榆、山东的琅琊和黄县（今山东龙口市）。经过考证研究，已在史学界取得了基本一致的意见。史学家们根据《史记》和《齐乘》关于徐福是“齐人”和“徐乡”、“盖以徐福求仙而得名”及有关史料和出土文物考证，认为今龙口市徐乡为徐福的家乡，从而推翻了江苏赣榆徐福村一说。有关徐福东渡起航港及航线的争论也渐趋统一。
近代，日本、朝鲜均出土战国末年最流行的青铜货币——明刀，也证明战国后期，中国就和他们有贸易关系或有人移居该地。
关于徐福东渡，近年来引起了国内外有关学者，专家以至有关地方政府的关注，徐福及其东渡的作用也日益被重视起来。
徐福研究在近现代已经成为一门显学，中日官方与民间的各种学说纷纭迭出。
历史学家翦伯赞认为徐福东渡是当时山东滨海一带商人探险家企图假借国家的力量，打通与日本的商业通道，并向日本移民。安作璋教授称徐福是“中国伟大的航海家、中日友好的使者。”近年来，人们对徐福东渡给予很高的评价，认为是“中日交通与文化交流史”中“一颗最璀璨的明珠”；“开创了中日两国友好往来和文化交流的历史，成为日本古代文明的开拓者”，“不但是中国航海史上伟大创举，而且还成为中日两国人民世代友好的象征”；“成为划时代的大事，在中日交往史上产生出重大影响”，是中国古代远洋航行活动中的光辉序幕……
1991年5月13日，日本徐福会在东京宣布成立。徐福，这位东渡日本的传奇式人物，今已被视作中日两国交往的始祖。日本的《神皇正统记》、《太平记》等历史典籍中，都载有徐福事迹。
有关徐福东渡的传说、遗迹，至今仍散布于日本的东京、新富、佐贺、富士吉田等地。例如，和歌山县有徐福和他的船员七人墓、徐福宫；而和歌山县新宫市正位于东南海岸线上，面向大海，海水深而浪高，在其海岸线的附近，有山叫“蓬莱山”，或许正是徐福梦寐以求的仙山。而在蓬莱山前数百米处，立着一座不高的塔式纪念碑，据说是徐福登陆的地方。现留有徐福墓；现新宫市到处可见以徐福的名字命名的商店。据日本民间传说，徐福当年自新宫市上岸，从中国带去了种桑、养蚕、纺织、捕鱼、种稻等先进技术和先进的中国文化，受到日本人民的崇敬。当地群众年年祭祀不止。1982年9月1日，该市还建碑纪念徐福东渡2200周年。佐贺市现存有“徐福上陆地”纪念碑、徐福的石家、徐福祠，还有徐福作为农耕、蚕桑和医药之神奉祀的金立神社；丹后半岛地区有祭祀徐福的新井崎神社；鹿儿岛有以当年徐福置冠于此而命名的冠岳等等。1991年8月3日，日本为纪念徐福东渡日本，在相传当年徐福东渡登陆的地方佐贺诸富町，修建了徐福之路公园。
据台湾学者彭双松先生统计，日本各地与徐福姓名联系在一起的墓、祠、碑、宫、庙、神庄等遗址有50余处，登陆点20余处，传说故事30余个。这些遗迹与传说虽不全是真实的，但也与史实有所关联。
况且《史记》和《汉书》是中国古代最有权威性的两部史书，尤其《史记》，其年代与徐福东渡时相隔仅百年左右，其可信度还是相当高的。所以说，徐福东渡是存在的。
总之，秦代徐福率3000童男女东渡日本，是古代中外交往史上一件划时代大事，也是山东沿海人民最早大规模走出海外的一次壮举。徐福集团东渡，自山东半岛经过辽东半岛、朝鲜西海岸南下，渡过对马海峡到达日本南部。开辟了自山东半岛到日本的东方海上丝绸之路，对朝鲜半岛南部和日本社会的进步和经济发展都起到了巨大的推动作用，这种作用与影响已为中日韩三国研究者所公认。徐福已成为早期中日韩人民友好和友谊的化身。徐福乘船泛海东渡，成为迄今有史记载的东渡第一人。徐福东渡把秦代文明传入日本，促进了日本社会的飞跃。徐福在日本被尊为农耕神、蚕桑神和医药神。日本纪念徐福的祭祀活动历千年而不衰。